MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD01

Total Repeats: 410

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011892	TTGC	2	8	133	140	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011892	TCCC	2	8	776	783	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_011892	TCGG	2	8	811	818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011892	GCGG	2	8	2722	2729	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011892	TCCG	2	8	3066	3073	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011892	CCGG	2	8	5194	5201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011892	TGGC	2	8	5250	5257	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011892	GCAC	2	8	5392	5399	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011892	TCCA	2	8	5826	5833	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011892	GACG	2	8	6321	6328	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011892	GCCC	2	8	6416	6423	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_011892	CGAG	2	8	7272	7279	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011892	CGCC	2	8	7886	7893	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_011892	TCGA	2	8	7965	7972	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011892	CGGC	2	8	7976	7983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011892	AGGG	2	8	8107	8114	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011892	CGGC	2	8	9287	9294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011892	CGCC	2	8	10098	10105	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_011892	GCCT	2	8	14268	14275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011892	CGGG	2	8	15195	15202	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011892	CCGG	2	8	17723	17730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011892	CTGG	2	8	17892	17899	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011892	CAGC	2	8	18000	18007	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011892	CGGC	2	8	18165	18172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011892	GGCC	2	8	18254	18261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011892	TTAT	2	8	19700	19707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011892	TTTA	2	8	23645	23652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011892	TTGG	2	8	23678	23685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011892	GGCT	2	8	26560	26567	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011892	CTAC	2	8	27912	27919	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011892	ACGC	2	8	31913	31920	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011892	GGCT	2	8	34864	34871	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011892	GCCG	2	8	34903	34910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011892	GGCG	2	8	35061	35068	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011892	CGGC	2	8	35081	35088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011892	GACG	2	8	35118	35125	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011892	CGGC	2	8	35180	35187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011892	TTGT	2	8	37801	37808	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011892	AGCC	2	8	44131	44138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011892	GCGG	2	8	44358	44365	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011892	CGAG	2	8	44921	44928	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011892	AGTG	2	8	45072	45079	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011892	GGCG	2	8	54633	54640	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011892	CTGC	2	8	56539	56546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011892	AGCG	2	8	56862	56869	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011892	GAAG	2	8	56944	56951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011892	GGTA	2	8	58916	58923	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011892	CGGA	2	8	61104	61111	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011892	CAGG	2	8	61146	61153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011892	AGCG	2	8	68766	68773	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011892	TCGA	2	8	70139	70146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011892	GCTC	2	8	71503	71510	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011892	TCAC	2	8	72075	72082	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011892	GAAG	2	8	72086	72093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011892	GCCG	2	8	73566	73573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011892	GGCC	2	8	73643	73650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011892	ACGA	2	8	74374	74381	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011892	AAGG	2	8	76298	76305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011892	GACC	2	8	76309	76316	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011892	GCCG	2	8	82040	82047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011892	GCGG	2	8	82164	82171	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011892	GGCT	2	8	82236	82243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011892	GTGG	2	8	82458	82465	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011892	CGTG	2	8	82568	82575	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011892	AGTA	2	8	84550	84557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011892	TGGG	2	8	87309	87316	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011892	GCGA	2	8	88316	88323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011892	CAGC	2	8	88804	88811	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011892	ATCG	2	8	89350	89357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011892	TCCG	2	8	90657	90664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011892	CCGG	2	8	90826	90833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011892	GGCC	2	8	91048	91055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011892	GAGC	2	8	91079	91086	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011892	AATA	2	8	91685	91692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011892	TGGG	2	8	93035	93042	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011892	TCCC	2	8	100070	100077	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_011892	CGTG	2	8	101042	101049	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011892	TGAG	2	8	110134	110141	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011892	TGGC	2	8	117336	117343	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011892	TGGG	2	8	118130	118137	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011892	ATGG	2	8	118266	118273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011892	GAGG	2	8	120740	120747	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011892	GGCG	2	8	120774	120781	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011892	GCTC	2	8	121377	121384	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011892	GCGT	2	8	122414	122421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011892	TGGC	2	8	122638	122645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011892	GCGG	2	8	122685	122692	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011892	TGCG	2	8	122846	122853	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011892	CTGT	2	8	122933	122940	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011892	GCCG	2	8	122947	122954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011892	GCCC	2	8	123199	123206	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_011892	TGGG	2	8	123368	123375	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011892	CGCC	2	8	123432	123439	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_011892	CTCG	2	8	123919	123926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011892	CCCT	2	8	124253	124260	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_011892	GCTG	2	8	124356	124363	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011892	CAGG	2	8	124565	124572	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011892	CTGG	2	8	124600	124607	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011892	CCGC	2	8	124742	124749	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_011892	CGCC	2	8	124780	124787	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_011892	GCGG	2	8	128078	128085	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011892	GCCG	2	8	128135	128142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011892	CGAC	2	8	128362	128369	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011892	CGAA	2	8	128715	128722	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011892	GATC	2	8	129557	129564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011892	CCCA	2	8	131034	131041	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_011892	GACA	2	8	131755	131762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011892	CCGG	2	8	132153	132160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011892	GGAA	2	8	132206	132213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011892	CCGG	2	8	132671	132678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011892	GGCG	2	8	137104	137111	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011892	GTGC	2	8	140333	140340	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011892	CGCC	2	8	142734	142741	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_011892	CGCC	2	8	143298	143305	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_011892	GGGC	2	8	143527	143534	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011892	CGAT	2	8	143570	143577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011892	ACGC	2	8	144873	144880	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011892	TTTC	2	8	145004	145011	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011892	GGAC	2	8	146041	146048	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011892	GGGC	2	8	147345	147352	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011892	GCCG	2	8	147614	147621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011892	TCGT	2	8	149567	149574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011892	GGCT	2	8	149597	149604	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011892	CGGC	2	8	151112	151119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011892	GCTG	2	8	151518	151525	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011892	GCGA	2	8	155552	155559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011892	GGCC	2	8	155737	155744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011892	GACG	2	8	157434	157441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011892	TCTA	2	8	159591	159598	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011892	TCCG	2	8	160821	160828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011892	GCCA	2	8	161903	161910	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_011892	ACGA	2	8	161970	161977	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011892	TGGC	2	8	162554	162561	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011892	GGGC	2	8	162562	162569	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011892	GGCC	2	8	167300	167307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011892	GCCG	2	8	170769	170776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011892	GCCG	3	12	170788	170799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_011892	GCTG	2	8	172083	172090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011892	GCTT	2	8	172146	172153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011892	CCGG	2	8	173308	173315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011892	CGGT	2	8	173440	173447	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011892	AGTA	2	8	174559	174566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011892	CAAC	2	8	176961	176968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_011892	CTCC	2	8	179167	179174	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_011892	GACG	2	8	179204	179211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011892	GGCG	2	8	179257	179264	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_011892	GTCG	2	8	182080	182087	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011892	GTCG	2	8	186730	186737	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011892	CGCC	2	8	186929	186936	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_011892	TCGA	2	8	188664	188671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_011892	ACTC	2	8	188813	188820	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_011892	GGCT	2	8	189731	189738	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_011892	CCCG	2	8	189752	189759	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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265	NC_011892	GGGA	2	8	337701	337708	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_011892	GCCG	2	8	347283	347290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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279	NC_011892	CCGG	2	8	349085	349092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.