MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD07

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011890	CTG	2	6	36	41	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011890	CGA	2	6	47	52	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011890	CGA	2	6	669	674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011890	CGT	2	6	857	862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011890	GCG	2	6	926	931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011890	GAG	2	6	939	944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011890	GGC	2	6	968	973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011890	CCG	2	6	980	985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011890	GCT	2	6	998	1003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011890	GCC	2	6	1017	1022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011890	CGGG	2	8	1076	1083	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011890	GC	3	6	1090	1095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011890	CTTT	2	8	1367	1374	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011890	CGAG	2	8	1539	1546	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011890	GA	3	6	1583	1588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011890	CGGG	2	8	1623	1630	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011890	TGC	2	6	1668	1673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011890	CGC	2	6	1676	1681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_011890	TCG	2	6	1700	1705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011890	CGC	2	6	1745	1750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_011890	TCG	2	6	1779	1784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011890	CGC	2	6	1792	1797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_011890	GCG	2	6	1802	1807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011890	CG	3	6	1864	1869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011890	GCC	2	6	1882	1887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_011890	TCG	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011890	CCT	2	6	1973	1978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_011890	GGC	2	6	1982	1987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011890	GCG	2	6	1990	1995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011890	AG	3	6	2047	2052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011890	CGC	2	6	2130	2135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_011890	CGC	2	6	2137	2142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_011890	CG	5	10	2155	2164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011890	CGC	2	6	2234	2239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_011890	CCG	2	6	2269	2274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_011890	GA	3	6	2276	2281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011890	AGG	2	6	2290	2295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011890	CGG	2	6	2301	2306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011890	TCCG	2	8	2310	2317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011890	ATT	2	6	5617	5622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011890	CTT	2	6	5630	5635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011890	T	6	6	5634	5639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011890	CGA	2	6	6863	6868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011890	ACG	3	9	6880	6888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011890	ACA	2	6	6935	6940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011890	GCG	2	6	6965	6970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011890	GT	3	6	6994	6999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011890	GCG	3	9	7029	7037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011890	G	6	6	7108	7113	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011890	CAGCGG	2	12	7158	7169	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011890	GCC	2	6	7194	7199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_011890	G	12	12	7219	7230	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011890	GCC	2	6	7321	7326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011890	G	6	6	7346	7351	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011890	GGC	2	6	7355	7360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011890	GCA	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011890	GGGC	2	8	7435	7442	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011890	GCG	2	6	7445	7450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011890	GGC	2	6	7458	7463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011890	CTGC	2	8	7484	7491	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011890	GGCG	2	8	7514	7521	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011890	CCG	2	6	7522	7527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011890	CGA	2	6	7535	7540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011890	G	6	6	7546	7551	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011890	CCCG	2	8	7565	7572	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_011890	CGA	2	6	7640	7645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011890	GC	3	6	7649	7654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011890	CCG	2	6	7858	7863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_011890	CGA	2	6	7904	7909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011890	CGA	2	6	7919	7924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011890	GT	3	6	8053	8058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011890	GTG	2	6	8092	8097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011890	TCA	2	6	8105	8110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011890	CCA	2	6	8132	8137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_011890	GGCACA	2	12	8193	8204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011890	CGA	2	6	8213	8218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011890	GCA	2	6	8318	8323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011890	CG	3	6	8430	8435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011890	GCG	2	6	8440	8445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011890	GCT	2	6	8471	8476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011890	CCGGGG	2	12	8505	8516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011890	CG	3	6	9155	9160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011890	G	6	6	9174	9179	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011890	ATG	2	6	9181	9186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011890	CG	3	6	9224	9229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011890	CG	3	6	9238	9243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011890	GC	4	8	9245	9252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011890	GCC	2	6	9416	9421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_011890	TCAA	2	8	9428	9435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011890	GAACT	2	10	9476	9485	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_011890	GCGA	2	8	9561	9568	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011890	GGC	2	6	9588	9593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011890	ACC	2	6	9654	9659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011890	GCC	2	6	9660	9665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_011890	CCG	2	6	9724	9729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_011890	GCG	2	6	9732	9737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011890	CCT	2	6	9774	9779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_011890	CGC	2	6	9798	9803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.