MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD02

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011887	GTTTG	2	10	14512	14521	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011887	ATGGA	2	10	18180	18189	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011887	AGCGA	2	10	18236	18245	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011887	AATGC	2	10	24489	24498	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011887	CAGCG	2	10	24656	24665	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_011887	AGCGC	2	10	27300	27309	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_011887	ACGGA	2	10	28319	28328	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011887	ACCTG	2	10	45143	45152	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_011887	CGGCC	2	10	45365	45374	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_011887	GCTCC	2	10	51010	51019	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_011887	GAGCG	2	10	55000	55009	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011887	ACGCA	2	10	55037	55046	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_011887	CCTGG	2	10	56975	56984	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011887	GTGGA	2	10	58090	58099	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011887	TTGGT	2	10	58122	58131	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011887	CTGGG	2	10	58872	58881	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011887	TGCTG	2	10	62637	62646	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011887	CGGCG	2	10	68358	68367	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011887	CCAGC	2	10	77495	77504	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_011887	CGGAG	2	10	78897	78906	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011887	GCGTC	2	10	82403	82412	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_011887	CGGAG	2	10	102750	102759	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011887	CGCTT	2	10	103058	103067	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_011887	GCGTC	2	10	116398	116407	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011887	GCTTC	2	10	123246	123255	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011887	ATGCA	2	10	124556	124565	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011887	GAGGG	2	10	128807	128816	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011887	CGACA	2	10	133024	133033	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_011887	GAAAC	2	10	134110	134119	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011887	AGGCG	2	10	135203	135212	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011887	GGCGG	2	10	162120	162129	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
32	NC_011887	GGCAT	2	10	162732	162741	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011887	GCCGC	2	10	177245	177254	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_011887	CAAGC	2	10	180118	180127	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_011887	GTGGA	2	10	181511	181520	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011887	AGCGG	2	10	183559	183568	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011887	AGAGA	2	10	187428	187437	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011887	ATTCA	2	10	193737	193746	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011887	CAATC	2	10	193970	193979	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_011887	CTATG	2	10	195632	195641	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011887	CCTCG	2	10	197456	197465	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_011887	TCCCC	2	10	203136	203145	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
43	NC_011887	GCGTC	2	10	203158	203167	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_011887	CGGCA	2	10	212271	212280	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_011887	GGACC	2	10	212563	212572	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_011887	GCCGA	2	10	216198	216207	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_011887	GCAAC	2	10	222295	222304	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_011887	CATGA	2	10	222526	222535	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011887	TCGCC	2	10	232740	232749	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
50	NC_011887	TCAGG	2	10	233211	233220	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011887	GCGCC	2	10	237692	237701	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_011887	GAGAG	2	10	237710	237719	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011887	TCCTG	2	10	253212	253221	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_011887	TCACA	2	10	253278	253287	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_011887	TGGCG	2	10	254812	254821	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011887	CGGGC	2	10	264367	264376	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_011887	CGGCC	2	10	264383	264392	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_011887	CGGCG	2	10	280934	280943	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
59	NC_011887	AACGC	2	10	294609	294618	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_011887	TCATT	2	10	297694	297703	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011887	AGCGC	2	10	306988	306997	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_011887	CTCGG	2	10	308910	308919	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_011887	CGGGC	2	10	315861	315870	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_011887	CGGGA	2	10	318537	318546	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011887	GCGTG	2	10	328939	328948	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011887	CCTCG	2	10	329541	329550	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_011887	CCGAG	2	10	329571	329580	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_011887	AGCTG	2	10	329604	329613	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011887	TGGCG	2	10	330636	330645	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011887	GACAG	2	10	331513	331522	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011887	GCCGC	2	10	333828	333837	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_011887	TCCGC	2	10	359042	359051	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_011887	TCATC	2	10	359187	359196	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_011887	TCGCC	2	10	360666	360675	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_011887	AGCGC	2	10	367360	367369	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_011887	CGCAG	2	10	368290	368299	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_011887	CGGCG	2	10	368859	368868	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_011887	CTTCG	2	10	369742	369751	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_011887	GCACT	2	10	372180	372189	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_011887	AAGCC	2	10	380380	380389	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_011887	GTTAT	2	10	380466	380475	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011887	TCGGG	2	10	380693	380702	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011887	GACGA	2	10	390342	390351	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011887	GCCCG	2	10	390700	390709	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_011887	CGGGC	2	10	396695	396704	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_011887	CAGAA	2	10	396822	396831	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011887	ACCCT	2	10	400567	400576	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
88	NC_011887	GATTT	2	10	405367	405376	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011887	GCCGC	2	10	406002	406011	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
90	NC_011887	GCAAC	2	10	407639	407648	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_011887	GCCCA	2	10	415520	415529	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_011887	GCCTC	2	10	415899	415908	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_011887	ACTCG	2	10	415926	415935	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_011887	AAACC	2	10	416986	416995	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_011887	GCTTC	2	10	421944	421953	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_011887	CAGCT	2	10	421978	421987	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_011887	TCAAA	2	10	423405	423414	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011887	TCAGA	2	10	423807	423816	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011887	TCACG	2	10	424757	424766	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_011887	CGGGC	2	10	425800	425809	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_011887	CCGGG	2	10	443972	443981	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_011887	AGCGC	2	10	444943	444952	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.