MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 5944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011832	AGA	3	9	49	57	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011832	TTC	2	6	162	167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011832	ATC	2	6	199	204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011832	AAT	2	6	226	231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011832	ATG	2	6	294	299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011832	ATC	2	6	360	365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011832	GAA	3	9	415	423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011832	TCT	2	6	3411	3416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011832	AAT	2	6	5545	5550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011832	GGT	2	6	9525	9530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011832	TCA	2	6	9568	9573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011832	TAG	2	6	11090	11095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011832	CCT	2	6	13411	13416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_011832	TAA	2	6	13465	13470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011832	TTG	2	6	13662	13667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011832	TGC	2	6	13697	13702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011832	GCG	2	6	15724	15729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011832	CAC	2	6	15734	15739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_011832	TCT	2	6	25041	25046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011832	ATC	2	6	26332	26337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011832	CAG	2	6	26339	26344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011832	TCA	2	6	26356	26361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011832	TCA	2	6	27978	27983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011832	CTC	2	6	27991	27996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_011832	TTA	2	6	29269	29274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011832	TCA	2	6	31955	31960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011832	GCA	2	6	32855	32860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011832	ATA	2	6	32936	32941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011832	CCT	2	6	32943	32948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011832	TCT	3	9	34546	34554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011832	ATC	2	6	34609	34614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011832	TCT	2	6	34666	34671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011832	CAT	2	6	34704	34709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011832	ACC	2	6	35181	35186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_011832	GTC	2	6	38977	38982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011832	CAT	2	6	41206	41211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011832	ATA	2	6	42589	42594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011832	TCT	2	6	42602	42607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011832	CAG	2	6	42663	42668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011832	ACG	2	6	42670	42675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011832	GAC	2	6	42695	42700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011832	ATC	2	6	42734	42739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011832	GGA	2	6	42751	42756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011832	TCA	3	9	42792	42800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011832	CTC	3	9	42806	42814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011832	GAA	2	6	42853	42858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011832	CGA	2	6	42859	42864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011832	CGC	2	6	42889	42894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_011832	TGC	2	6	43064	43069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011832	CGA	3	9	43070	43078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011832	CAC	2	6	43151	43156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_011832	TGG	2	6	43159	43164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011832	ATC	2	6	43191	43196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011832	TCA	2	6	43270	43275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011832	CTG	2	6	43290	43295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011832	TCC	2	6	43604	43609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011832	TCC	2	6	43701	43706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_011832	CAT	2	6	43936	43941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011832	AGC	3	9	43997	44005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011832	TCA	2	6	44045	44050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011832	TCG	2	6	44102	44107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011832	GTT	2	6	44170	44175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011832	AGG	2	6	44350	44355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011832	ACA	2	6	44418	44423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011832	TGG	2	6	44479	44484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011832	GAT	2	6	51998	52003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011832	GGA	2	6	52045	52050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011832	AGA	2	6	52102	52107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011832	TCA	2	6	52119	52124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011832	CTT	2	6	52214	52219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011832	TCG	2	6	53467	53472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011832	CGG	2	6	53532	53537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011832	CTC	2	6	53540	53545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_011832	GGA	2	6	53633	53638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011832	ACA	2	6	53648	53653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011832	TGA	2	6	53656	53661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011832	TGT	2	6	53692	53697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011832	ACC	2	6	53791	53796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_011832	CTT	2	6	54519	54524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011832	TAA	2	6	57579	57584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011832	TTC	3	9	57647	57655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011832	GAT	2	6	61051	61056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011832	AAT	2	6	61089	61094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011832	CAC	2	6	63033	63038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011832	GAA	2	6	64536	64541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011832	GGA	2	6	64601	64606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011832	ATT	2	6	64745	64750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011832	CGC	2	6	64762	64767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_011832	TAC	2	6	65892	65897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011832	CCT	2	6	65956	65961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011832	CAG	2	6	66012	66017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011832	TCC	2	6	66054	66059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_011832	CTG	2	6	66067	66072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011832	GAT	2	6	66111	66116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011832	CTG	2	6	66212	66217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011832	ATT	2	6	66303	66308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011832	GTG	2	6	66391	66396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011832	TCC	2	6	66780	66785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_011832	ACA	2	6	66819	66824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011832	CCG	2	6	66825	66830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011832	ACC	2	6	66874	66879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011832	GAT	2	6	66908	66913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011832	TGA	2	6	66917	66922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011832	CAT	2	6	66956	66961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011832	GAA	2	6	66968	66973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011832	TGC	2	6	66982	66987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011832	CAC	2	6	67072	67077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_011832	CTG	2	6	67229	67234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011832	CTG	2	6	68795	68800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011832	ATA	2	6	68860	68865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011832	GAC	2	6	68889	68894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011832	TGA	2	6	68912	68917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011832	CAA	2	6	68961	68966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011832	CAT	2	6	69045	69050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011832	TCA	2	6	69059	69064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011832	AGA	2	6	69082	69087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011832	TGA	2	6	69115	69120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011832	TGA	2	6	69230	69235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011832	TGA	2	6	69248	69253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011832	CTT	2	6	76587	76592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011832	CAG	2	6	76610	76615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011832	CTG	2	6	76622	76627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011832	TGC	2	6	80476	80481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011832	TGA	2	6	80537	80542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011832	CTG	2	6	80578	80583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011832	TAG	3	9	81400	81408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011832	TTG	2	6	81432	81437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011832	TCT	2	6	81505	81510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011832	ATC	2	6	81530	81535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011832	GTA	2	6	89126	89131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011832	AAT	2	6	89150	89155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011832	TCC	2	6	91313	91318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_011832	ATA	2	6	92449	92454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011832	TCT	2	6	93492	93497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011832	AAT	2	6	93518	93523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011832	CTT	2	6	93525	93530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011832	TTC	2	6	93532	93537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011832	CTG	2	6	93543	93548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011832	GTC	2	6	93603	93608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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