MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 10349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011832	CA	3	6	1066576	1066581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_011832	GTGA	2	8	1066608	1066615	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_011832	ATC	2	6	1066617	1066622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_011832	AACT	2	8	1066623	1066630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3505	NC_011832	TTC	2	6	1067349	1067354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_011832	TCT	2	6	1067409	1067414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_011832	AACG	2	8	1067466	1067473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3508	NC_011832	GA	3	6	1067520	1067525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_011832	A	7	7	1067553	1067559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_011832	GAT	2	6	1067568	1067573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_011832	CCT	2	6	1068726	1068731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_011832	TCAT	2	8	1068760	1068767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_011832	TCA	2	6	1068875	1068880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_011832	GCG	2	6	1068898	1068903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_011832	AGG	2	6	1068990	1068995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_011832	T	6	6	1070661	1070666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_011832	TTC	2	6	1070771	1070776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_011832	TC	3	6	1070775	1070780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3519	NC_011832	GTAT	2	8	1070825	1070832	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_011832	A	7	7	1070882	1070888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_011832	CTAT	2	8	1071285	1071292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3522	NC_011832	TAT	2	6	1071303	1071308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_011832	TTC	2	6	1072500	1072505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_011832	ATT	2	6	1072631	1072636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_011832	TGA	2	6	1072676	1072681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_011832	TCG	2	6	1072758	1072763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_011832	GAAC	2	8	1072786	1072793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3528	NC_011832	GAAGA	2	10	1072799	1072808	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_011832	ATC	2	6	1073021	1073026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_011832	CGG	2	6	1073041	1073046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_011832	TCG	2	6	1073049	1073054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_011832	TGA	2	6	1073076	1073081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_011832	GAT	2	6	1073200	1073205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_011832	TACC	2	8	1073215	1073222	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3535	NC_011832	CGT	2	6	1073257	1073262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_011832	TTG	2	6	1073298	1073303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_011832	T	6	6	1073672	1073677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_011832	TCA	2	6	1075808	1075813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_011832	T	6	6	1075825	1075830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_011832	TAA	2	6	1075867	1075872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_011832	AT	3	6	1075875	1075880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_011832	T	8	8	1080443	1080450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_011832	TTC	2	6	1080468	1080473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_011832	TCGTTT	2	12	1080474	1080485	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3545	NC_011832	GCCG	2	8	1080493	1080500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_011832	GTG	2	6	1080506	1080511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_011832	GCC	2	6	1080524	1080529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_011832	TGA	2	6	1081543	1081548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_011832	TCA	2	6	1081549	1081554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_011832	TAT	2	6	1081571	1081576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_011832	CTG	2	6	1081579	1081584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_011832	TCC	2	6	1081595	1081600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_011832	T	6	6	1081688	1081693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_011832	A	6	6	1081699	1081704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_011832	GGTA	2	8	1083201	1083208	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_011832	GTG	2	6	1083213	1083218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_011832	A	7	7	1083223	1083229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_011832	T	6	6	1083239	1083244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_011832	CT	4	8	1083347	1083354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3560	NC_011832	TC	3	6	1083371	1083376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3561	NC_011832	A	7	7	1083397	1083403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_011832	GATT	2	8	1084296	1084303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_011832	TAA	2	6	1084308	1084313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_011832	TAA	2	6	1084344	1084349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_011832	AAGA	2	8	1084389	1084396	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_011832	GT	3	6	1084914	1084919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_011832	A	6	6	1084926	1084931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_011832	ATTT	2	8	1084936	1084943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_011832	TAT	2	6	1085000	1085005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_011832	TGAAAT	2	12	1085019	1085030	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_011832	TAAAA	2	10	1085042	1085051	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_011832	CTT	2	6	1085058	1085063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_011832	T	6	6	1085106	1085111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_011832	A	7	7	1085126	1085132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_011832	A	8	8	1085134	1085141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_011832	TG	3	6	1085201	1085206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_011832	CAG	2	6	1085212	1085217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_011832	T	6	6	1087204	1087209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_011832	TTG	2	6	1087246	1087251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_011832	TTG	2	6	1087260	1087265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_011832	ACC	2	6	1087267	1087272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_011832	A	6	6	1087303	1087308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_011832	TA	3	6	1089605	1089610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_011832	TTG	2	6	1089640	1089645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_011832	GAC	2	6	1089653	1089658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_011832	AGG	2	6	1089671	1089676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_011832	AAG	2	6	1089700	1089705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_011832	GGA	2	6	1089773	1089778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_011832	A	6	6	1090809	1090814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_011832	TTA	3	9	1091114	1091122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_011832	AT	3	6	1091136	1091141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_011832	GAA	2	6	1091150	1091155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_011832	TAT	2	6	1095606	1095611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_011832	TCT	2	6	1095633	1095638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_011832	GGGAAT	2	12	1095653	1095664	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_011832	AAT	2	6	1095724	1095729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_011832	T	7	7	1095745	1095751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_011832	TA	3	6	1095792	1095797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_011832	CTG	2	6	1096474	1096479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_011832	CAC	2	6	1096490	1096495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_011832	T	6	6	1096506	1096511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_011832	TCA	2	6	1096515	1096520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_011832	GTA	2	6	1098609	1098614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_011832	CTG	2	6	1098676	1098681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_011832	GCCC	2	8	1098725	1098732	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3606	NC_011832	AAC	2	6	1098742	1098747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_011832	GTA	2	6	1098750	1098755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_011832	TCG	2	6	1098777	1098782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_011832	GAG	3	9	1098783	1098791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_011832	CGG	2	6	1098805	1098810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_011832	T	7	7	1099614	1099620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_011832	ATC	2	6	1099635	1099640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_011832	GTACT	2	10	1099662	1099671	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3614	NC_011832	AAT	2	6	1099861	1099866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_011832	TTC	2	6	1100384	1100389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_011832	AGA	2	6	1100413	1100418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_011832	TG	3	6	1100449	1100454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_011832	TGA	2	6	1100466	1100471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_011832	GAGC	2	8	1100505	1100512	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_011832	GTT	2	6	1100538	1100543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_011832	TCTT	2	8	1100555	1100562	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3622	NC_011832	T	6	6	1100574	1100579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_011832	TCG	2	6	1100648	1100653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_011832	AGT	2	6	1100811	1100816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_011832	TCG	2	6	1100921	1100926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_011832	CAT	2	6	1100944	1100949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_011832	TCCC	2	8	1100967	1100974	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3628	NC_011832	ATCGT	2	10	1100981	1100990	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3629	NC_011832	CGAT	2	8	1101046	1101053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3630	NC_011832	GAT	2	6	1101196	1101201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_011832	GTT	2	6	1101247	1101252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_011832	GAA	2	6	1101337	1101342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_011832	GTT	2	6	1101352	1101357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_011832	GGA	2	6	1101495	1101500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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