MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 10349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011832	CTGC	2	8	929036	929043	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_011832	TC	3	6	929147	929152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_011832	GCC	2	6	929173	929178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_011832	TCG	2	6	929272	929277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_011832	CGA	2	6	929279	929284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_011832	TCG	2	6	929329	929334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_011832	TCG	2	6	929341	929346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_011832	CAG	2	6	929439	929444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_011832	GAG	2	6	929449	929454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_011832	TCC	2	6	929494	929499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_011832	GAA	2	6	929502	929507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_011832	GCTG	2	8	929510	929517	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3013	NC_011832	CGGC	2	8	929550	929557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_011832	GCG	2	6	929590	929595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_011832	CCA	2	6	929609	929614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_011832	CGA	2	6	929705	929710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_011832	CGC	2	6	929748	929753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_011832	ATC	2	6	929779	929784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_011832	ATT	2	6	929790	929795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_011832	GAT	2	6	929925	929930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_011832	CTT	2	6	930051	930056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_011832	CGA	2	6	930062	930067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_011832	CGG	2	6	930104	930109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_011832	GTT	2	6	930144	930149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_011832	GA	3	6	930157	930162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_011832	TCC	2	6	930188	930193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_011832	GATC	2	8	930215	930222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_011832	TTCG	2	8	930226	930233	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_011832	CTCG	2	8	930239	930246	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_011832	CT	3	6	930247	930252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_011832	A	7	7	930441	930447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_011832	TCC	2	6	931716	931721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_011832	ATC	2	6	931803	931808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_011832	TCAT	2	8	931830	931837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_011832	AGACAT	2	12	931852	931863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3036	NC_011832	GAA	2	6	932517	932522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_011832	TCA	2	6	932539	932544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_011832	CAAA	2	8	932618	932625	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3039	NC_011832	TCT	2	6	932658	932663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_011832	GAA	2	6	935229	935234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_011832	T	7	7	935245	935251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_011832	ACG	2	6	935263	935268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_011832	TCC	2	6	935327	935332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_011832	TCC	2	6	935354	935359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_011832	A	8	8	935408	935415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_011832	T	6	6	935418	935423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_011832	GGA	2	6	939644	939649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_011832	CTG	2	6	939661	939666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_011832	ATCC	2	8	939734	939741	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3050	NC_011832	GAA	2	6	939813	939818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_011832	AGCC	2	8	939826	939833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_011832	AAT	2	6	939847	939852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_011832	TAT	2	6	939861	939866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_011832	GCCG	2	8	939969	939976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_011832	G	7	7	939983	939989	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_011832	G	7	7	940014	940020	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_011832	TCT	2	6	940045	940050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_011832	TGG	2	6	940109	940114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_011832	TTG	2	6	940167	940172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_011832	AAT	2	6	940207	940212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_011832	T	7	7	940276	940282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_011832	ATG	2	6	940283	940288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_011832	ATCT	2	8	940300	940307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_011832	AGA	2	6	940368	940373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_011832	ATT	2	6	940400	940405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_011832	GA	3	6	940408	940413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_011832	AAG	2	6	940491	940496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_011832	TCAA	2	8	942206	942213	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3069	NC_011832	CTCAT	2	10	942326	942335	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3070	NC_011832	C	8	8	942437	942444	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3071	NC_011832	G	6	6	942447	942452	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_011832	GGT	2	6	942539	942544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_011832	CTT	2	6	942565	942570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_011832	TGG	2	6	942651	942656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_011832	AGG	2	6	942698	942703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_011832	TTC	2	6	942711	942716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_011832	CGG	2	6	942744	942749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_011832	A	6	6	942782	942787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_011832	TCA	2	6	944131	944136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_011832	TGA	2	6	944142	944147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_011832	AG	3	6	944250	944255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_011832	GTAT	2	8	944278	944285	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_011832	GT	3	6	944563	944568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_011832	AC	3	6	944589	944594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_011832	ATT	2	6	944596	944601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_011832	ATT	2	6	944658	944663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_011832	ATT	2	6	944687	944692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_011832	A	6	6	944710	944715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_011832	CGGC	3	12	946641	946652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_011832	CGG	2	6	946696	946701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_011832	GTG	2	6	946721	946726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_011832	CGG	2	6	946735	946740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_011832	TG	3	6	946750	946755	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_011832	ACG	2	6	947329	947334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_011832	A	6	6	947335	947340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_011832	AG	3	6	947368	947373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_011832	CA	3	6	947376	947381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_011832	GGAG	2	8	947389	947396	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_011832	GA	3	6	947473	947478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_011832	TCA	2	6	947589	947594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_011832	TGCA	2	8	947653	947660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3102	NC_011832	A	8	8	947688	947695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_011832	CTA	2	6	947707	947712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_011832	AAC	2	6	947713	947718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_011832	ATGGG	2	10	947886	947895	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_011832	CTC	2	6	947956	947961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_011832	CCT	2	6	947975	947980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_011832	ATT	2	6	948118	948123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_011832	TAT	2	6	948124	948129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_011832	TTTA	2	8	948140	948147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_011832	TGT	2	6	951174	951179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_011832	CAA	2	6	951213	951218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_011832	GCC	2	6	951274	951279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_011832	TTG	2	6	951329	951334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_011832	GT	3	6	951378	951383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_011832	AGT	2	6	951395	951400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_011832	ATAA	2	8	951439	951446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_011832	CAA	2	6	951449	951454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_011832	ATAA	2	8	951478	951485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_011832	CAA	2	6	951488	951493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_011832	AT	5	10	951501	951510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_011832	ACT	2	6	951661	951666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_011832	ATC	2	6	951764	951769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_011832	AACG	2	8	951954	951961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3125	NC_011832	AT	3	6	952056	952061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_011832	TCA	2	6	952178	952183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_011832	AAC	2	6	952214	952219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_011832	TAT	2	6	952254	952259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_011832	GTC	2	6	952424	952429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_011832	ATC	2	6	952500	952505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_011832	GTT	2	6	952616	952621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_011832	TGA	2	6	952712	952717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_011832	AAC	2	6	952754	952759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_011832	TTC	2	6	952836	952841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_011832	AT	4	8	952915	952922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_011832	GTA	2	6	952924	952929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3139	NC_011832	CGG	2	6	955105	955110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3142	NC_011832	CTG	2	6	955273	955278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3169	NC_011832	CCG	2	6	957127	957132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3172	NC_011832	ACC	2	6	957179	957184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3257	NC_011832	CT	3	6	999516	999521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3258	NC_011832	T	6	6	999521	999526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_011832	GTTC	2	8	999558	999565	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3260	NC_011832	TA	3	6	999611	999616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_011832	TAT	2	6	999619	999624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_011832	ATT	2	6	999653	999658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_011832	TGG	2	6	999703	999708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3264	NC_011832	G	6	6	999707	999712	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3265	NC_011832	CAA	2	6	999755	999760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3266	NC_011832	ATT	2	6	999841	999846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3267	NC_011832	GAA	2	6	999870	999875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3268	NC_011832	A	6	6	1002314	1002319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3269	NC_011832	TAA	2	6	1002326	1002331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3270	NC_011832	AGA	2	6	1003888	1003893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3271	NC_011832	TCC	2	6	1003927	1003932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3272	NC_011832	A	7	7	1005433	1005439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3273	NC_011832	TA	3	6	1005944	1005949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3274	NC_011832	GTCTG	2	10	1005953	1005962	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3275	NC_011832	CTG	2	6	1007014	1007019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3276	NC_011832	CT	3	6	1007028	1007033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3277	NC_011832	ATC	2	6	1007039	1007044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3281	NC_011832	CTT	2	6	1008353	1008358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3304	NC_011832	A	8	8	1011630	1011637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3305	NC_011832	TAA	2	6	1012648	1012653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3306	NC_011832	A	7	7	1012664	1012670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3307	NC_011832	TCTGC	2	10	1014071	1014080	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3399	NC_011832	AGG	2	6	1033067	1033072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3403	NC_011832	GT	3	6	1033270	1033275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3404	NC_011832	AGG	2	6	1033286	1033291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3405	NC_011832	GCT	2	6	1033296	1033301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3406	NC_011832	TC	3	6	1033361	1033366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3407	NC_011832	TCA	2	6	1033379	1033384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3409	NC_011832	TCT	2	6	1033461	1033466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3413	NC_011832	TGA	2	6	1033597	1033602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3415	NC_011832	CCT	2	6	1033693	1033698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3421	NC_011832	TTATA	2	10	1033974	1033983	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3423	NC_011832	TCA	2	6	1034130	1034135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3425	NC_011832	TG	3	6	1034158	1034163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3426	NC_011832	TGG	2	6	1034183	1034188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3429	NC_011832	AG	3	6	1034352	1034357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3430	NC_011832	TGC	2	6	1034366	1034371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3431	NC_011832	TCG	2	6	1034528	1034533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3432	NC_011832	TGAT	2	8	1034541	1034548	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3433	NC_011832	TGAA	2	8	1036689	1036696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3434	NC_011832	GAAA	2	8	1036756	1036763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3435	NC_011832	ATA	2	6	1036823	1036828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3436	NC_011832	TAA	2	6	1038948	1038953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3437	NC_011832	GAA	2	6	1038967	1038972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3438	NC_011832	GGATC	2	10	1038985	1038994	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3439	NC_011832	ATT	3	9	1044799	1044807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3440	NC_011832	ATT	2	6	1046256	1046261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3441	NC_011832	AAT	2	6	1046272	1046277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3442	NC_011832	CT	3	6	1046310	1046315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3443	NC_011832	CTG	2	6	1046342	1046347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3445	NC_011832	TAA	2	6	1049568	1049573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3446	NC_011832	TCT	2	6	1049577	1049582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3455	NC_011832	TGA	2	6	1057423	1057428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3464	NC_011832	AG	3	6	1058845	1058850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3482	NC_011832	CATG	2	8	1061095	1061102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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