MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 10349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_011832	ATA	2	6	715246	715251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_011832	TCA	2	6	716612	716617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_011832	CT	3	6	716655	716660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2004	NC_011832	ACC	2	6	716672	716677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2005	NC_011832	TCGT	2	8	716719	716726	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2006	NC_011832	TCGATT	2	12	716759	716770	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2007	NC_011832	GAG	2	6	717767	717772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_011832	CCTG	2	8	718255	718262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2009	NC_011832	AGT	2	6	718268	718273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_011832	ATT	2	6	718274	718279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_011832	AAT	2	6	718319	718324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_011832	TCA	2	6	718360	718365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_011832	ATG	2	6	718414	718419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_011832	CTC	2	6	719933	719938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2015	NC_011832	GA	3	6	719942	719947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_011832	AAAAT	2	10	720660	720669	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_011832	CTT	2	6	720712	720717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_011832	CAT	2	6	720724	720729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_011832	CGT	2	6	720749	720754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_011832	ATG	2	6	720762	720767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_011832	TTG	2	6	720831	720836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_011832	GCT	2	6	720876	720881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_011832	CTT	2	6	720898	720903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2024	NC_011832	CCTGT	2	10	721010	721019	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2025	NC_011832	GAT	2	6	721034	721039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_011832	GAG	2	6	721074	721079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_011832	CCG	2	6	721125	721130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2028	NC_011832	GTT	2	6	721160	721165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_011832	GCG	2	6	721180	721185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_011832	CGG	2	6	721222	721227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2031	NC_011832	CGT	2	6	721238	721243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_011832	T	6	6	721295	721300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_011832	TGG	2	6	721414	721419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_011832	AGG	2	6	721464	721469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_011832	CGGC	2	8	721501	721508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2036	NC_011832	GATC	2	8	721525	721532	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2037	NC_011832	TCG	2	6	721558	721563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2038	NC_011832	T	6	6	721581	721586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_011832	TCG	3	9	721647	721655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2040	NC_011832	CGA	2	6	721708	721713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2041	NC_011832	GCC	2	6	721718	721723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2042	NC_011832	CGA	2	6	721738	721743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_011832	TGT	2	6	721750	721755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_011832	ATC	2	6	721811	721816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2045	NC_011832	T	6	6	721822	721827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_011832	ATTT	2	8	721876	721883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_011832	A	6	6	721911	721916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_011832	CAC	2	6	721974	721979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2049	NC_011832	TAA	2	6	722004	722009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_011832	CCA	2	6	722042	722047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2051	NC_011832	T	6	6	722110	722115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_011832	TCA	2	6	722120	722125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2053	NC_011832	T	7	7	722136	722142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_011832	TC	3	6	722205	722210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2055	NC_011832	CGT	2	6	722288	722293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2056	NC_011832	CGG	2	6	722298	722303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_011832	GAT	2	6	722319	722324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_011832	AGA	2	6	722420	722425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_011832	CCT	2	6	723245	723250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2060	NC_011832	T	8	8	723266	723273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_011832	ATT	2	6	723279	723284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_011832	ATTC	2	8	723305	723312	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2063	NC_011832	ATC	3	9	723330	723338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2064	NC_011832	ATC	2	6	723362	723367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_011832	T	8	8	723370	723377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_011832	GAT	2	6	723393	723398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_011832	ATT	2	6	723413	723418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_011832	TGT	2	6	723475	723480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_011832	ATC	2	6	723482	723487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2070	NC_011832	TGG	2	6	723488	723493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2071	NC_011832	TA	3	6	723533	723538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2072	NC_011832	GAAT	2	8	723543	723550	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_011832	GTTCG	2	10	724181	724190	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2074	NC_011832	ATA	3	9	724199	724207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2075	NC_011832	AAGT	2	8	724226	724233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2076	NC_011832	TAAT	2	8	724245	724252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2077	NC_011832	TGAA	2	8	724343	724350	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2078	NC_011832	CGGGA	2	10	725898	725907	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2079	NC_011832	GAG	2	6	725974	725979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2080	NC_011832	TC	3	6	726006	726011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2081	NC_011832	GATC	2	8	726033	726040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2082	NC_011832	TC	3	6	726054	726059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2083	NC_011832	CAG	2	6	726118	726123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2084	NC_011832	CTGG	2	8	726167	726174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2085	NC_011832	ACG	2	6	726214	726219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2086	NC_011832	GAGGGA	2	12	729446	729457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2088	NC_011832	TGG	2	6	734158	734163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2089	NC_011832	GA	3	6	734235	734240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2090	NC_011832	AT	3	6	734243	734248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2091	NC_011832	GTC	2	6	734285	734290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2092	NC_011832	CG	3	6	734342	734347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2093	NC_011832	GA	3	6	734351	734356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_011832	CT	3	6	734372	734377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2095	NC_011832	ATA	2	6	734390	734395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2096	NC_011832	AC	3	6	735350	735355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2097	NC_011832	GTA	2	6	735374	735379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2098	NC_011832	TTCTT	2	10	735394	735403	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2099	NC_011832	AAAAT	2	10	735405	735414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_011832	CGA	2	6	735473	735478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2101	NC_011832	GATCG	2	10	735558	735567	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2102	NC_011832	G	6	6	735567	735572	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_011832	ACT	2	6	735579	735584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2104	NC_011832	TTATG	2	10	735585	735594	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_011832	AGA	2	6	735637	735642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2106	NC_011832	GGC	2	6	736638	736643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2107	NC_011832	GAT	2	6	736656	736661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_011832	GAA	2	6	736667	736672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2109	NC_011832	CCA	3	9	736676	736684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2110	NC_011832	ACC	2	6	736721	736726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2111	NC_011832	CGGC	2	8	736729	736736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2112	NC_011832	GTT	2	6	736834	736839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2113	NC_011832	T	6	6	736838	736843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2114	NC_011832	TCG	2	6	736870	736875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2115	NC_011832	A	7	7	736882	736888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2116	NC_011832	GGA	2	6	741470	741475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2117	NC_011832	T	8	8	741518	741525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_011832	A	6	6	741542	741547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2119	NC_011832	AAC	2	6	741551	741556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2120	NC_011832	GAT	2	6	741656	741661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2121	NC_011832	GAG	2	6	741696	741701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_011832	TCC	2	6	741708	741713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2123	NC_011832	TCT	2	6	741716	741721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2124	NC_011832	GGT	2	6	741722	741727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2125	NC_011832	TC	3	6	741754	741759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2126	NC_011832	CGG	2	6	741768	741773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2127	NC_011832	GCT	2	6	741792	741797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2128	NC_011832	AAC	2	6	742015	742020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2129	NC_011832	GTT	2	6	742133	742138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_011832	GA	3	6	743003	743008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_011832	ACT	2	6	744413	744418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2132	NC_011832	TTC	2	6	744465	744470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2133	NC_011832	TC	3	6	744479	744484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2134	NC_011832	A	6	6	744487	744492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2136	NC_011832	A	6	6	748266	748271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2408	NC_011832	GTA	2	6	789178	789183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2409	NC_011832	GCA	2	6	789197	789202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2410	NC_011832	TGA	2	6	789229	789234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2411	NC_011832	GATC	2	8	789312	789319	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2412	NC_011832	TAG	2	6	789346	789351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2431	NC_011832	A	7	7	790566	790572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2436	NC_011832	AT	3	6	797254	797259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2437	NC_011832	T	6	6	797435	797440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2439	NC_011832	CTG	2	6	798258	798263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2442	NC_011832	GTT	2	6	798465	798470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2445	NC_011832	ATG	2	6	798596	798601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2452	NC_011832	GAA	2	6	801645	801650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2453	NC_011832	CAG	2	6	801680	801685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2471	NC_011832	TCT	2	6	811621	811626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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