MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 10349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011832	AT	3	6	532475	532480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_011832	TG	3	6	533824	533829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_011832	TA	3	6	534454	534459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_011832	AAGTG	2	10	534479	534488	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_011832	ATAA	2	8	535111	535118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_011832	TGA	2	6	535130	535135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_011832	AT	3	6	535150	535155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_011832	TTA	2	6	535187	535192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_011832	ATCA	2	8	543011	543018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_011832	ATGGG	2	10	546150	546159	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_011832	GTGC	2	8	546216	546223	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_011832	TTGG	2	8	546239	546246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_011832	GT	4	8	546251	546258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_011832	TCA	2	6	550002	550007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_011832	TCC	2	6	550008	550013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_011832	T	6	6	550024	550029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_011832	CTC	2	6	553027	553032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_011832	TCACC	2	10	553800	553809	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1519	NC_011832	TCG	2	6	554671	554676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_011832	T	7	7	554686	554692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_011832	CT	3	6	554845	554850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_011832	CTGGT	2	10	554915	554924	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1523	NC_011832	TAC	2	6	555012	555017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_011832	AAC	2	6	555041	555046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_011832	TCT	2	6	555047	555052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_011832	TAT	2	6	555058	555063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_011832	A	6	6	555177	555182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_011832	TCAC	2	8	555599	555606	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_011832	TCC	2	6	555700	555705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_011832	TGA	2	6	555715	555720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_011832	TATC	2	8	556245	556252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_011832	ATC	2	6	556749	556754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_011832	CATC	2	8	556784	556791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_011832	TGA	3	9	556797	556805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011832	GAC	2	6	556830	556835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_011832	TCGAT	2	10	556855	556864	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1537	NC_011832	AGC	2	6	556947	556952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_011832	TCA	2	6	556977	556982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_011832	ATT	2	6	557030	557035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_011832	T	6	6	557041	557046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_011832	CTG	2	6	557096	557101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_011832	ATC	2	6	557123	557128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_011832	TTGA	2	8	557150	557157	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_011832	GGAT	2	8	557175	557182	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_011832	ACC	2	6	557225	557230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_011832	CTC	2	6	557295	557300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_011832	ATC	2	6	557320	557325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_011832	ACAA	2	8	557368	557375	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_011832	TAA	2	6	557376	557381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_011832	TC	4	8	557398	557405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_011832	ACT	2	6	557407	557412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_011832	GAA	2	6	557524	557529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_011832	GCC	2	6	560432	560437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_011832	TTGC	2	8	567508	567515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_011832	AT	4	8	567528	567535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_011832	ATT	2	6	567547	567552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_011832	TCT	2	6	567602	567607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_011832	GATT	2	8	567670	567677	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_011832	C	6	6	568944	568949	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1560	NC_011832	CCGG	2	8	568981	568988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_011832	TGA	2	6	569063	569068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_011832	GGA	2	6	569118	569123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_011832	GGA	2	6	569126	569131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_011832	GGA	2	6	569167	569172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_011832	GTTCC	2	10	569257	569266	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1566	NC_011832	T	7	7	569274	569280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_011832	TTAAA	2	10	569323	569332	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_011832	A	7	7	569330	569336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_011832	GA	3	6	569609	569614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_011832	TCA	2	6	569658	569663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_011832	CTG	2	6	569678	569683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_011832	TGA	2	6	569767	569772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_011832	A	7	7	569778	569784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_011832	AAT	2	6	569800	569805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_011832	TGG	2	6	569818	569823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_011832	CTG	2	6	569909	569914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_011832	CCT	2	6	569919	569924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_011832	TTCA	2	8	569928	569935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1579	NC_011832	ATT	3	9	569960	569968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_011832	GAT	3	9	570011	570019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_011832	ATA	2	6	570057	570062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_011832	TTC	2	6	570067	570072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1584	NC_011832	A	6	6	570289	570294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_011832	TCAC	2	8	570327	570334	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_011832	A	6	6	570339	570344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_011832	TGG	2	6	573741	573746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_011832	TAT	2	6	573748	573753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_011832	GAA	2	6	573860	573865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_011832	TG	3	6	574438	574443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_011832	CT	3	6	574463	574468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_011832	ATTT	2	8	578328	578335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_011832	TA	3	6	578344	578349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_011832	TAT	2	6	578357	578362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_011832	TGAT	2	8	579012	579019	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_011832	TCT	2	6	579041	579046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_011832	TCA	2	6	579076	579081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_011832	CGAT	2	8	579124	579131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_011832	CTT	2	6	579215	579220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_011832	GATCT	2	10	579261	579270	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1601	NC_011832	TGA	2	6	579291	579296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_011832	TATC	2	8	579299	579306	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_011832	GCA	2	6	579369	579374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_011832	GGT	2	6	579396	579401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_011832	CCT	2	6	579987	579992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_011832	TCT	2	6	580046	580051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_011832	TAC	2	6	580063	580068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_011832	T	7	7	581593	581599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011832	ATGGT	2	10	581608	581617	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_011832	GATA	2	8	581618	581625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_011832	TC	4	8	581662	581669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_011832	T	6	6	581673	581678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_011832	TC	3	6	581729	581734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_011832	GAA	2	6	581767	581772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_011832	GAA	3	9	581811	581819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_011832	AAAG	2	8	581827	581834	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_011832	GGAT	2	8	581855	581862	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_011832	CTACC	2	10	581908	581917	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1619	NC_011832	TAC	2	6	581935	581940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_011832	AT	3	6	581957	581962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_011832	CGA	2	6	582024	582029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_011832	GCGATC	2	12	582487	582498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_011832	AAAG	2	8	585344	585351	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_011832	ATTA	2	8	587089	587096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_011832	TGC	2	6	587097	587102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_011832	A	9	9	587120	587128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_011832	TAA	2	6	587350	587355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_011832	GTAT	2	8	587358	587365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_011832	CCG	2	6	587426	587431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_011832	CGATG	2	10	587538	587547	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1631	NC_011832	AT	3	6	587556	587561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_011832	TTA	2	6	587573	587578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_011832	AT	3	6	588504	588509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_011832	TCT	2	6	588571	588576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_011832	TC	3	6	588603	588608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1636	NC_011832	TA	3	6	589481	589486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_011832	ATT	2	6	592138	592143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_011832	TTTA	2	8	592153	592160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1642	NC_011832	ATT	2	6	595221	595226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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