MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 10349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011832	AGG	2	6	356447	356452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011832	CGG	2	6	356471	356476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_011832	AT	4	8	357834	357841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011832	TCT	2	6	357851	357856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_011832	G	6	6	357867	357872	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011832	AAT	2	6	357882	357887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011832	AGG	2	6	358825	358830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011832	TAC	2	6	359606	359611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_011832	T	7	7	359997	360003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011832	CTG	2	6	360012	360017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_011832	GCA	2	6	360033	360038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_011832	CTG	2	6	360044	360049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_011832	TCT	2	6	360961	360966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_011832	GAT	2	6	361006	361011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011832	AG	3	6	362829	362834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011832	TAA	2	6	362895	362900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_011832	GGT	2	6	362919	362924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011832	AT	4	8	363001	363008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011832	AGGGT	2	10	363042	363051	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011832	CTTTT	2	10	363111	363120	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_011832	ATA	2	6	363223	363228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011832	AAC	2	6	363255	363260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_011832	CTC	2	6	363287	363292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_011832	GTA	2	6	363323	363328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011832	TCT	2	6	363385	363390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_011832	TGG	2	6	363443	363448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011832	A	6	6	363466	363471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011832	TTG	2	6	364556	364561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011832	GTTAT	2	10	364616	364625	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011832	CAA	2	6	364657	364662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_011832	T	8	8	364771	364778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_011832	GCC	2	6	364783	364788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_011832	GAG	2	6	364811	364816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011832	TCT	3	9	364890	364898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_011832	TG	3	6	364958	364963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011832	C	7	7	364973	364979	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1037	NC_011832	CGATC	2	10	365032	365041	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1038	NC_011832	ATG	2	6	365986	365991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011832	AT	4	8	365995	366002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011832	AT	3	6	366009	366014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_011832	ATCT	2	8	366030	366037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_011832	CGT	2	6	366057	366062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_011832	CGT	2	6	366081	366086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_011832	TGG	2	6	367657	367662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_011832	A	8	8	367663	367670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011832	ATA	2	6	367680	367685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011832	TA	3	6	367684	367689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011832	TAT	2	6	367694	367699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011832	TCA	2	6	367747	367752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011832	TTC	2	6	367785	367790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_011832	TCCC	2	8	367797	367804	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1052	NC_011832	TTAT	2	8	367845	367852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011832	GA	3	6	367900	367905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_011832	GATCCC	2	12	367907	367918	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_011832	C	6	6	367916	367921	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1056	NC_011832	CGAT	2	8	367944	367951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_011832	TCT	2	6	367971	367976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_011832	CGT	2	6	372787	372792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_011832	GA	3	6	372842	372847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011832	GAG	2	6	372859	372864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011832	GGA	2	6	372915	372920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_011832	GAAA	2	8	372963	372970	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011832	CA	3	6	372971	372976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_011832	A	7	7	373807	373813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_011832	CCA	2	6	373824	373829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_011832	TAAAAA	2	12	378777	378788	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011832	ATC	2	6	378861	378866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_011832	AAC	2	6	378871	378876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_011832	GAG	2	6	378976	378981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_011832	ATA	2	6	379044	379049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011832	AGC	2	6	379069	379074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_011832	ATC	2	6	379111	379116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_011832	C	6	6	379130	379135	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1074	NC_011832	GGAAGA	2	12	379163	379174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011832	TTC	2	6	379330	379335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_011832	AGT	2	6	379423	379428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011832	T	7	7	379479	379485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_011832	TTC	2	6	379582	379587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_011832	CTG	2	6	379599	379604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_011832	TCA	2	6	379639	379644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_011832	CT	3	6	379661	379666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_011832	CCTGC	2	10	379704	379713	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1083	NC_011832	TCT	2	6	379736	379741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_011832	ACC	2	6	379818	379823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_011832	CTG	2	6	379839	379844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_011832	TAG	2	6	379999	380004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_011832	ATC	2	6	380045	380050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_011832	ATTC	2	8	380073	380080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_011832	TCATC	2	10	380146	380155	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1090	NC_011832	TC	3	6	380212	380217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_011832	ATCC	2	8	380221	380228	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_011832	ATCG	2	8	380322	380329	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_011832	TCG	2	6	380364	380369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_011832	GTT	2	6	380407	380412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011832	CGA	2	6	380428	380433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_011832	GGGATC	2	12	380596	380607	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1097	NC_011832	TTG	2	6	380666	380671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011832	TGA	2	6	380710	380715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011832	ATTTTT	2	12	380821	380832	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011832	GA	3	6	380867	380872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011832	GTG	2	6	380881	380886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011832	CAAAG	2	10	380893	380902	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1103	NC_011832	AT	3	6	380981	380986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011832	GAG	2	6	381000	381005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011832	TG	3	6	381025	381030	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011832	AAAT	2	8	381033	381040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011832	CAT	2	6	381041	381046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_011832	TTAA	2	8	381100	381107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011832	CCT	2	6	381164	381169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_011832	TTG	2	6	381212	381217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011832	ATT	2	6	381267	381272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011832	GAT	2	6	381278	381283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011832	ATG	2	6	381312	381317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011832	TG	3	6	382337	382342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011832	CA	3	6	382355	382360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_011832	A	7	7	382373	382379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011832	TGA	2	6	382400	382405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011832	AATG	2	8	382425	382432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011832	CAC	2	6	382444	382449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_011832	ATTG	2	8	382502	382509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011832	GAC	2	6	382520	382525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_011832	T	6	6	382568	382573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011832	AAT	2	6	382585	382590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011832	CTT	2	6	382644	382649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_011832	TA	3	6	382652	382657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_011832	CAT	2	6	382662	382667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_011832	AATA	2	8	384552	384559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011832	AACC	2	8	384567	384574	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_011832	AAGA	2	8	384651	384658	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_011832	A	6	6	384721	384726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_011832	A	7	7	384740	384746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_011832	GAAT	2	8	384747	384754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011832	AGC	2	6	385061	385066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_011832	GAAAA	2	10	386693	386702	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_011832	TAA	2	6	386725	386730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_011832	TGA	2	6	386733	386738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_011832	TAA	2	6	386792	386797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1405	NC_011832	A	7	7	496020	496026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_011832	TCT	3	9	496061	496069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1407	NC_011832	CCTTT	2	10	496115	496124	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1408	NC_011832	GGTAG	2	10	496214	496223	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_011832	CGTTTT	2	12	496279	496290	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1411	NC_011832	TGG	2	6	496784	496789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_011832	TGA	2	6	496805	496810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_011832	TTC	2	6	496826	496831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1414	NC_011832	AGTG	2	8	496854	496861	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_011832	TC	3	6	496891	496896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1416	NC_011832	GA	3	6	496903	496908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_011832	CT	3	6	497081	497086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1421	NC_011832	GGA	2	6	497139	497144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1423	NC_011832	G	6	6	497175	497180	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1439	NC_011832	AT	3	6	498056	498061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1448	NC_011832	TCA	2	6	500828	500833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1452	NC_011832	GAA	2	6	501089	501094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1456	NC_011832	GGA	2	6	503770	503775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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