MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 10349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011832	TGA	2	6	2850893	2850898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_011832	ATC	2	6	2851933	2851938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_011832	CA	3	6	2851988	2851993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10004	NC_011832	CAC	2	6	2852039	2852044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10005	NC_011832	CCT	2	6	2852065	2852070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10006	NC_011832	GAT	2	6	2852158	2852163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_011832	GCAT	2	8	2852205	2852212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10008	NC_011832	ACT	2	6	2852232	2852237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_011832	GTGA	2	8	2852245	2852252	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_011832	GAAGG	2	10	2852340	2852349	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_011832	AG	3	6	2852350	2852355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_011832	CCT	2	6	2852361	2852366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10013	NC_011832	GTA	2	6	2852397	2852402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_011832	CAGC	2	8	2852450	2852457	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10015	NC_011832	TAA	2	6	2852479	2852484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_011832	GCT	2	6	2852524	2852529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_011832	ATT	2	6	2852530	2852535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_011832	ATC	2	6	2852555	2852560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_011832	CTCTA	2	10	2858862	2858871	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10020	NC_011832	TTA	2	6	2858886	2858891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_011832	ATA	2	6	2858892	2858897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_011832	CCT	2	6	2858916	2858921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10023	NC_011832	CAT	2	6	2860215	2860220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_011832	AGC	2	6	2860258	2860263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_011832	AGG	2	6	2863719	2863724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_011832	TCT	2	6	2869503	2869508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_011832	AATA	2	8	2869546	2869553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_011832	AT	3	6	2869568	2869573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_011832	ATC	2	6	2870346	2870351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_011832	CT	3	6	2870354	2870359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10031	NC_011832	ACA	2	6	2870376	2870381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_011832	ACGC	2	8	2871220	2871227	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10033	NC_011832	CTG	2	6	2872013	2872018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_011832	A	7	7	2874778	2874784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_011832	A	7	7	2874812	2874818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_011832	AGA	2	6	2874831	2874836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_011832	TGA	2	6	2874859	2874864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_011832	TA	3	6	2874883	2874888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_011832	TCC	3	9	2874899	2874907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10040	NC_011832	TCT	2	6	2874908	2874913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_011832	GA	3	6	2874944	2874949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_011832	CA	3	6	2874960	2874965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10043	NC_011832	CGT	2	6	2875044	2875049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_011832	AAC	2	6	2875057	2875062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_011832	GCA	2	6	2875159	2875164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_011832	GAG	2	6	2875172	2875177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_011832	CGT	2	6	2875185	2875190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_011832	TCA	2	6	2875238	2875243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_011832	ATG	2	6	2875463	2875468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_011832	TTC	2	6	2875477	2875482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_011832	TCAA	2	8	2875532	2875539	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10052	NC_011832	TCG	2	6	2875565	2875570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_011832	CAA	2	6	2875578	2875583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_011832	GTC	2	6	2875641	2875646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_011832	TAC	2	6	2875722	2875727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_011832	TCG	2	6	2876149	2876154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_011832	CAG	2	6	2876175	2876180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_011832	GAT	2	6	2876190	2876195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_011832	AAG	2	6	2876205	2876210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_011832	AGG	2	6	2876295	2876300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_011832	AAG	2	6	2876321	2876326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_011832	CT	3	6	2876365	2876370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10063	NC_011832	GGC	2	6	2876405	2876410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_011832	GAG	2	6	2876411	2876416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_011832	A	6	6	2876417	2876422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_011832	CAT	2	6	2876435	2876440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_011832	AGG	2	6	2876450	2876455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_011832	GAT	3	9	2876557	2876565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_011832	CAGG	2	8	2878173	2878180	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10070	NC_011832	C	6	6	2878197	2878202	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10071	NC_011832	TCT	2	6	2878243	2878248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_011832	GCT	2	6	2878258	2878263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_011832	CAGC	2	8	2878314	2878321	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10074	NC_011832	CGA	2	6	2878323	2878328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_011832	TGG	2	6	2878333	2878338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_011832	ATG	2	6	2878392	2878397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_011832	GATC	2	8	2878414	2878421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10078	NC_011832	AAT	2	6	2878461	2878466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_011832	CAG	2	6	2878491	2878496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_011832	CTG	2	6	2878522	2878527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_011832	CTCGA	2	10	2878606	2878615	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10082	NC_011832	CTGGG	2	10	2878641	2878650	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10083	NC_011832	ACAG	2	8	2878763	2878770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10084	NC_011832	TGG	2	6	2878942	2878947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_011832	GAT	2	6	2878953	2878958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_011832	ATG	2	6	2879073	2879078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_011832	CAA	2	6	2879089	2879094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_011832	CCG	2	6	2879127	2879132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10089	NC_011832	GCCG	2	8	2879139	2879146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10090	NC_011832	GATG	2	8	2879167	2879174	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_011832	CAC	2	6	2879273	2879278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10092	NC_011832	CAC	2	6	2879335	2879340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10093	NC_011832	CGA	2	6	2879346	2879351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_011832	CCA	2	6	2879376	2879381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10095	NC_011832	ACC	2	6	2879426	2879431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10096	NC_011832	GAG	2	6	2879495	2879500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_011832	GGT	2	6	2879513	2879518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_011832	CT	3	6	2879520	2879525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10099	NC_011832	ACTC	2	8	2879562	2879569	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10100	NC_011832	CTCACC	2	12	2879600	2879611	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10101	NC_011832	GAT	2	6	2879612	2879617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_011832	TTC	2	6	2879639	2879644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_011832	CAA	2	6	2879647	2879652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_011832	TGG	2	6	2879669	2879674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_011832	GTG	2	6	2879756	2879761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_011832	CCA	2	6	2879790	2879795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10107	NC_011832	TGA	2	6	2879836	2879841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_011832	CAG	2	6	2879865	2879870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_011832	C	6	6	2879873	2879878	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10110	NC_011832	CGA	2	6	2880053	2880058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_011832	ATGGG	2	10	2880117	2880126	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_011832	CAA	2	6	2880177	2880182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_011832	TCC	2	6	2880306	2880311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10114	NC_011832	TAG	2	6	2880355	2880360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_011832	TA	3	6	2880361	2880366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_011832	ATTA	2	8	2880404	2880411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_011832	AATA	2	8	2880431	2880438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_011832	CTTCT	2	10	2880542	2880551	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10119	NC_011832	GTG	2	6	2882272	2882277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_011832	AACA	2	8	2882291	2882298	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10121	NC_011832	GAG	2	6	2882330	2882335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_011832	AG	4	8	2882334	2882341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_011832	ACT	2	6	2882351	2882356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_011832	CCT	2	6	2882375	2882380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10125	NC_011832	A	7	7	2882408	2882414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_011832	CTG	2	6	2882442	2882447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_011832	TAGTC	2	10	2882451	2882460	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10128	NC_011832	TCA	2	6	2882540	2882545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_011832	TTC	2	6	2882550	2882555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_011832	CTG	2	6	2882600	2882605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10131	NC_011832	TGG	2	6	2882640	2882645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_011832	TC	3	6	2882651	2882656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10133	NC_011832	TC	3	6	2883363	2883368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10134	NC_011832	A	6	6	2883382	2883387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10135	NC_011832	GA	3	6	2883449	2883454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10136	NC_011832	TGAAGA	2	12	2883492	2883503	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10137	NC_011832	GGTC	2	8	2883561	2883568	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10138	NC_011832	ACA	2	6	2883584	2883589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10139	NC_011832	TC	3	6	2883606	2883611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10140	NC_011832	TCG	2	6	2883626	2883631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10141	NC_011832	CAT	2	6	2883640	2883645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10142	NC_011832	ACCT	2	8	2883662	2883669	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10143	NC_011832	TGA	2	6	2883693	2883698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10144	NC_011832	TTCAT	2	10	2883704	2883713	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10145	NC_011832	TGGA	2	8	2883787	2883794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10146	NC_011832	TCG	2	6	2883811	2883816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10147	NC_011832	GGA	2	6	2883860	2883865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10149	NC_011832	TCAG	2	8	2883981	2883988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10150	NC_011832	CAT	2	6	2884000	2884005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10151	NC_011832	ATC	2	6	2884188	2884193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10159	NC_011832	GAG	2	6	2885629	2885634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10160	NC_011832	TA	3	6	2885641	2885646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10161	NC_011832	GATC	2	8	2885662	2885669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10162	NC_011832	T	6	6	2886909	2886914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10163	NC_011832	GGT	2	6	2889419	2889424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10168	NC_011832	CTTAA	2	10	2891927	2891936	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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10172	NC_011832	TAT	2	6	2892127	2892132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10177	NC_011832	ATGCT	2	10	2892486	2892495	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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10186	NC_011832	TAT	2	6	2893043	2893048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10200	NC_011832	G	6	6	2895381	2895386	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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10240	NC_011832	A	6	6	2898343	2898348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10241	NC_011832	CAA	2	6	2899451	2899456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10242	NC_011832	T	8	8	2899466	2899473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10243	NC_011832	ATC	2	6	2899706	2899711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10244	NC_011832	CTC	2	6	2899743	2899748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10245	NC_011832	AGG	2	6	2899752	2899757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10246	NC_011832	CCT	2	6	2899784	2899789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10247	NC_011832	GGC	2	6	2899888	2899893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10248	NC_011832	CTCC	2	8	2899912	2899919	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10249	NC_011832	GGT	2	6	2900628	2900633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10250	NC_011832	AAG	2	6	2900723	2900728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10251	NC_011832	TCA	2	6	2900863	2900868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10252	NC_011832	CA	3	6	2900897	2900902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10253	NC_011832	AT	3	6	2900970	2900975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_011832	TGG	2	6	2900991	2900996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10255	NC_011832	CAAAC	2	10	2901083	2901092	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10256	NC_011832	ATA	2	6	2901172	2901177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_011832	T	7	7	2901192	2901198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10258	NC_011832	CTT	2	6	2901202	2901207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10287	NC_011832	CTTAA	2	10	2903644	2903653	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10288	NC_011832	CTT	2	6	2903672	2903677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10302	NC_011832	TAT	2	6	2904616	2904621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10329	NC_011832	ATC	2	6	2912920	2912925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10336	NC_011832	CCACT	2	10	2914263	2914272	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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10339	NC_011832	AGA	2	6	2915273	2915278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10340	NC_011832	AT	3	6	2915794	2915799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10341	NC_011832	GATCA	2	10	2915808	2915817	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10342	NC_011832	AGGA	2	8	2918779	2918786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10346	NC_011832	TC	4	8	2922685	2922692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10347	NC_011832	ACCC	2	8	2922792	2922799	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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