MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 10349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011832	CGAT	2	8	1298314	1298321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_011832	AGG	2	6	1298353	1298358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_011832	GTGA	2	8	1298363	1298370	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_011832	GGC	2	6	1298420	1298425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_011832	TAA	2	6	1298468	1298473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_011832	TTTC	2	8	1298485	1298492	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4507	NC_011832	GAA	2	6	1298532	1298537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_011832	GAT	2	6	1298545	1298550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_011832	A	7	7	1298554	1298560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_011832	ACC	2	6	1298577	1298582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_011832	CTC	2	6	1298597	1298602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_011832	GAAT	2	8	1298724	1298731	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_011832	A	6	6	1298761	1298766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_011832	T	6	6	1299677	1299682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_011832	AATC	2	8	1299707	1299714	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_011832	TCG	2	6	1299747	1299752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_011832	CTT	2	6	1299776	1299781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_011832	CTG	2	6	1299782	1299787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_011832	CCT	2	6	1299791	1299796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_011832	GT	3	6	1299847	1299852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_011832	CTC	2	6	1299896	1299901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_011832	CAC	2	6	1299905	1299910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4523	NC_011832	CTT	2	6	1300597	1300602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_011832	TCCC	2	8	1302317	1302324	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4525	NC_011832	G	6	6	1302333	1302338	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_011832	T	6	6	1303082	1303087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_011832	GA	3	6	1303096	1303101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_011832	ATTC	2	8	1303314	1303321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4529	NC_011832	T	7	7	1303353	1303359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_011832	T	6	6	1303388	1303393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_011832	CGAC	2	8	1303447	1303454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4532	NC_011832	TCG	2	6	1303491	1303496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_011832	TCG	3	9	1303559	1303567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_011832	C	6	6	1303583	1303588	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4535	NC_011832	GCCG	2	8	1303599	1303606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_011832	CAC	2	6	1303670	1303675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4537	NC_011832	CCTC	2	8	1304138	1304145	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4538	NC_011832	CAC	2	6	1304215	1304220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_011832	TCA	2	6	1304234	1304239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4541	NC_011832	ATT	2	6	1304475	1304480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_011832	GAA	2	6	1304569	1304574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_011832	TGG	2	6	1304594	1304599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_011832	TTA	2	6	1304636	1304641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_011832	AT	3	6	1304646	1304651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_011832	T	7	7	1306155	1306161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_011832	TCG	2	6	1306244	1306249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_011832	TTCG	2	8	1306250	1306257	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4549	NC_011832	TGG	2	6	1306260	1306265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_011832	CTG	2	6	1306287	1306292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_011832	GT	3	6	1306405	1306410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_011832	TG	3	6	1306513	1306518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_011832	CAT	2	6	1306519	1306524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4555	NC_011832	TCT	2	6	1308177	1308182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_011832	AGT	2	6	1308192	1308197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_011832	TTCT	2	8	1308223	1308230	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4558	NC_011832	AGA	2	6	1308262	1308267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4560	NC_011832	CTT	2	6	1308352	1308357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_011832	ATA	2	6	1308379	1308384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_011832	TCGC	2	8	1308463	1308470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4563	NC_011832	T	6	6	1308532	1308537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_011832	A	6	6	1308660	1308665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_011832	TAA	2	6	1308721	1308726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_011832	TTG	2	6	1308751	1308756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_011832	ATT	2	6	1308757	1308762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_011832	TA	3	6	1309607	1309612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_011832	TAAT	2	8	1309623	1309630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_011832	GAA	2	6	1309664	1309669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4579	NC_011832	GCCG	2	8	1311134	1311141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4588	NC_011832	GAG	2	6	1311444	1311449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_011832	TG	3	6	1311459	1311464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4593	NC_011832	T	7	7	1311568	1311574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_011832	TTG	2	6	1311637	1311642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_011832	CAGA	2	8	1311657	1311664	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4596	NC_011832	A	7	7	1311749	1311755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_011832	G	6	6	1311756	1311761	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_011832	TCA	3	9	1313100	1313108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_011832	GAT	2	6	1313160	1313165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_011832	TA	3	6	1313168	1313173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_011832	CATA	2	8	1313759	1313766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4602	NC_011832	A	6	6	1313766	1313771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_011832	TCT	2	6	1313773	1313778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_011832	A	8	8	1313802	1313809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_011832	GAG	2	6	1313810	1313815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4607	NC_011832	AGT	2	6	1315291	1315296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_011832	CAT	2	6	1315337	1315342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_011832	CTG	2	6	1315385	1315390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_011832	A	7	7	1315544	1315550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_011832	AT	3	6	1319415	1319420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_011832	GTA	2	6	1319460	1319465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_011832	GTG	2	6	1322112	1322117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_011832	ATA	2	6	1322136	1322141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4619	NC_011832	AGTGGA	2	12	1333557	1333568	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_011832	CTT	2	6	1335048	1335053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_011832	AT	3	6	1335632	1335637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_011832	ATT	2	6	1335664	1335669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_011832	ATC	2	6	1337531	1337536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_011832	T	7	7	1337538	1337544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_011832	AT	3	6	1337552	1337557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_011832	A	6	6	1337662	1337667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_011832	TGG	2	6	1337740	1337745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_011832	GAA	2	6	1337822	1337827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_011832	ATA	2	6	1337854	1337859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_011832	TCAT	2	8	1337888	1337895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4631	NC_011832	A	6	6	1337918	1337923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4633	NC_011832	TCA	2	6	1344938	1344943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4897	NC_011832	C	7	7	1420000	1420006	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4932	NC_011832	GA	3	6	1428551	1428556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4933	NC_011832	TTA	2	6	1428579	1428584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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