MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens CM4 plasmid pMCHL01

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011758	GACG	2	8	3141	3148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011758	CGGC	2	8	3167	3174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011758	ATCA	2	8	4491	4498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011758	CCTG	2	8	4602	4609	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011758	GCCG	2	8	4719	4726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011758	CGGA	2	8	4786	4793	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011758	GCGG	2	8	4813	4820	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011758	AGCC	2	8	6350	6357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011758	TGCA	2	8	6498	6505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011758	ATCC	2	8	13649	13656	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011758	ATAC	2	8	13755	13762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011758	TCAA	2	8	13782	13789	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011758	CAGC	2	8	14702	14709	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011758	GAAC	2	8	14768	14775	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011758	CATT	2	8	15226	15233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011758	CAAC	2	8	15259	15266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011758	TCGG	2	8	15939	15946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011758	GACA	2	8	16711	16718	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011758	CGCC	2	8	16814	16821	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_011758	GGGA	2	8	16986	16993	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011758	CGGC	2	8	18283	18290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011758	GGAA	2	8	18295	18302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011758	CGGA	2	8	23928	23935	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011758	GGCC	2	8	26842	26849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011758	GCCT	2	8	26958	26965	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011758	CTCC	2	8	27275	27282	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_011758	ATCT	2	8	29537	29544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011758	CCAT	2	8	35718	35725	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011758	AGCG	2	8	42672	42679	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011758	CGCC	2	8	43238	43245	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_011758	GAGC	2	8	43958	43965	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011758	AGTC	2	8	43970	43977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011758	GGCG	2	8	44028	44035	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011758	TGCT	2	8	44039	44046	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011758	CTGC	2	8	44310	44317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011758	AGGT	2	8	44437	44444	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011758	GCCG	2	8	44673	44680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011758	GAGG	2	8	44712	44719	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011758	TTCG	2	8	45548	45555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011758	CTTC	2	8	45764	45771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011758	GCTC	2	8	46139	46146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011758	AGGG	2	8	46368	46375	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011758	ACCG	2	8	47253	47260	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011758	GGGC	2	8	47682	47689	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011758	GCCA	2	8	47807	47814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011758	GTCT	2	8	48093	48100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011758	CGAA	2	8	49610	49617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011758	CGGT	2	8	50917	50924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011758	GCCG	2	8	51048	51055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011758	TCCC	2	8	53074	53081	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_011758	CGGG	3	12	53166	53177	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011758	CCGG	2	8	53256	53263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011758	GTCC	2	8	58565	58572	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011758	CGGG	2	8	59394	59401	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011758	CCGC	2	8	59497	59504	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_011758	ATCA	2	8	59550	59557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011758	TTAG	2	8	64122	64129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011758	TGGC	2	8	64358	64365	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011758	GCGG	2	8	64841	64848	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011758	AGCC	2	8	68757	68764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011758	TCCG	2	8	68842	68849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011758	TAAA	2	8	69035	69042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011758	GGGA	2	8	71446	71453	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011758	CGAG	2	8	73568	73575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011758	CAGA	2	8	73722	73729	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011758	CCAG	2	8	82006	82013	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011758	GGCC	2	8	85181	85188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011758	TTCG	2	8	90242	90249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011758	GCTG	2	8	90290	90297	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011758	GAGC	2	8	91299	91306	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011758	ACTC	2	8	91382	91389	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011758	AGGC	2	8	91793	91800	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011758	CGGG	2	8	91853	91860	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011758	GCCT	2	8	92074	92081	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011758	ACCG	2	8	92177	92184	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011758	CGGC	3	12	92384	92395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011758	CGCC	2	8	92496	92503	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_011758	TGCC	2	8	92715	92722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011758	GAAG	2	8	93444	93451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011758	GTCC	2	8	93527	93534	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011758	TGCC	2	8	94899	94906	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011758	CCTG	2	8	95222	95229	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011758	GGCC	2	8	95849	95856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011758	TCCG	2	8	95909	95916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011758	GCCG	2	8	96185	96192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011758	TCGC	2	8	98306	98313	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011758	GACC	2	8	98414	98421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011758	AGCG	2	8	98638	98645	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011758	ACCA	2	8	99283	99290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011758	TCGC	2	8	99449	99456	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011758	GATC	2	8	100035	100042	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011758	ACGA	2	8	101424	101431	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011758	GGGT	2	8	105856	105863	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011758	GCGT	2	8	105874	105881	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011758	GACG	2	8	106009	106016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011758	CGCC	2	8	113907	113914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_011758	ACGA	2	8	113945	113952	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011758	TCGG	2	8	114212	114219	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011758	GCCG	2	8	114249	114256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011758	CACC	2	8	114576	114583	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_011758	ACCG	2	8	114717	114724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011758	CCAC	2	8	114774	114781	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_011758	GGCC	2	8	114834	114841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011758	CTGC	2	8	115339	115346	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011758	GGCT	2	8	115373	115380	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011758	GGCT	2	8	115554	115561	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011758	GCCG	2	8	115593	115600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011758	CAAC	2	8	115849	115856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011758	CTGA	2	8	116037	116044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011758	GACA	2	8	116331	116338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011758	GGTC	2	8	118402	118409	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011758	ATGG	2	8	118987	118994	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011758	CATG	2	8	119006	119013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011758	CGAC	2	8	119073	119080	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_011758	GCCT	2	8	119942	119949	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011758	TTCC	2	8	124466	124473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011758	GACC	2	8	124550	124557	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011758	CGCT	2	8	124600	124607	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011758	CTGA	2	8	124801	124808	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011758	TCCC	2	8	128784	128791	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_011758	ATTG	2	8	130565	130572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011758	ATTC	2	8	130878	130885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011758	CGGC	2	8	130919	130926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011758	TCCG	2	8	133177	133184	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011758	ACAG	2	8	137264	137271	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011758	CCGG	2	8	138361	138368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011758	GCTC	2	8	138395	138402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011758	GGGA	2	8	138504	138511	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011758	CGCT	2	8	138530	138537	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011758	CAGA	2	8	146616	146623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011758	CCGA	2	8	157073	157080	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_011758	CGGC	2	8	157404	157411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011758	CCGG	2	8	157533	157540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011758	GCGG	2	8	159867	159874	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011758	CCCT	2	8	160148	160155	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_011758	TCGA	2	8	160222	160229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011758	GCGT	2	8	161032	161039	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011758	CGGG	2	8	161769	161776	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011758	CGTT	2	8	163831	163838	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011758	TCGA	2	8	163984	163991	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011758	CGGC	2	8	171463	171470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011758	GCCG	2	8	171778	171785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011758	ACCG	2	8	174715	174722	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_011758	GCTT	2	8	175451	175458	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011758	GATG	2	8	177273	177280	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011758	GCCA	2	8	186796	186803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_011758	CGCC	2	8	186984	186991	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_011758	CGGA	2	8	191390	191397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011758	CCGC	2	8	194829	194836	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_011758	CCGG	2	8	194839	194846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_011758	CCGG	2	8	194903	194910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_011758	CATA	2	8	202221	202228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_011758	GACC	2	8	203312	203319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_011758	CAAC	2	8	206828	206835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_011758	CGCC	2	8	208901	208908	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
156	NC_011758	TCCG	2	8	208945	208952	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
157	NC_011758	CGGG	2	8	209304	209311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
158	NC_011758	GGCC	2	8	210602	210609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_011758	GACC	2	8	210695	210702	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
160	NC_011758	CACC	2	8	211503	211510	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
161	NC_011758	GCTC	2	8	211525	211532	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
162	NC_011758	ATCT	2	8	211605	211612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_011758	GTGG	2	8	212092	212099	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011758	TAGA	2	8	212146	212153	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_011758	CCGG	2	8	241975	241982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
173	NC_011758	GCGG	2	8	242102	242109	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
174	NC_011758	CCGC	2	8	242196	242203	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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177	NC_011758	GCCG	2	8	242837	242844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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182	NC_011758	TCAA	2	8	244974	244981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
183	NC_011758	AGGG	2	8	245010	245017	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
184	NC_011758	GCCC	2	8	245127	245134	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
185	NC_011758	TCGA	2	8	247513	247520	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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188	NC_011758	GCGG	2	8	252214	252221	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_011758	GGCG	2	8	252660	252667	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
192	NC_011758	CCGG	2	8	257734	257741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
193	NC_011758	GGGC	2	8	259473	259480	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
194	NC_011758	CGAC	2	8	259697	259704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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196	NC_011758	GCCC	2	8	261108	261115	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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221	NC_011758	CCCG	2	8	312764	312771	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
222	NC_011758	CGGG	2	8	313404	313411	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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252	NC_011758	CGGG	2	8	348457	348464	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
253	NC_011758	CGGG	2	8	349552	349559	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
254	NC_011758	GCCC	2	8	367358	367365	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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260	NC_011758	ATCA	2	8	377942	377949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
261	NC_011758	GCGA	2	8	378075	378082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
262	NC_011758	CAGG	2	8	378095	378102	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.