MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylocella silvestris BL2 chromosome

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011666	CTCGCC	2	12	4862	4873	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_011666	GCGATC	2	12	4955	4966	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011666	GCTCGC	2	12	5032	5043	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011666	GGGCGC	2	12	12042	12053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011666	CCGCGT	2	12	62005	62016	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011666	CGATTT	2	12	65289	65300	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011666	GCGTCC	2	12	67342	67353	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011666	GCCGCA	2	12	84815	84826	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011666	CAGGGG	2	12	139106	139117	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011666	GGCGTC	2	12	139166	139177	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011666	ACTTGG	2	12	156601	156612	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011666	GCCGTC	2	12	156650	156661	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011666	TTAAGT	2	12	183423	183434	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011666	GGTCAA	2	12	183890	183901	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011666	GCGCCA	2	12	265074	265085	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011666	CATCGA	2	12	265958	265969	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011666	CGCCTG	2	12	284302	284313	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011666	ATCCGC	2	12	308571	308582	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011666	GCGGCC	2	12	347481	347492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011666	GAGCCG	2	12	385863	385874	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011666	CCGGCG	2	12	393668	393679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011666	CGAGCG	2	12	456927	456938	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011666	GCGCCG	2	12	460112	460123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011666	AGGCGA	2	12	472560	472571	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011666	ACGTTG	2	12	506018	506029	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011666	TCGCCG	2	12	514091	514102	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011666	GCGCCC	2	12	514380	514391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_011666	GCGCCG	2	12	638242	638253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011666	CGGCGA	2	12	650551	650562	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011666	GGCGCG	2	12	653865	653876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011666	CTTCCA	2	12	658800	658811	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011666	CAATTC	2	12	671793	671804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011666	AAAGGC	2	12	768231	768242	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011666	GAACGC	2	12	779980	779991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011666	CTGCGG	2	12	829153	829164	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011666	GCGTCC	2	12	864628	864639	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011666	ATCGCC	2	12	865164	865175	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011666	CCAAAT	2	12	876877	876888	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011666	GGCGCG	2	12	927132	927143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011666	CGGGAG	2	12	950612	950623	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011666	CAAGCC	2	12	967174	967185	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011666	GTCATC	2	12	980644	980655	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011666	AGTCGG	2	12	980658	980669	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011666	GAGGCG	2	12	989779	989790	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011666	GCGACA	2	12	1006555	1006566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011666	AATCGA	2	12	1010630	1010641	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011666	TTTCGA	2	12	1017306	1017317	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011666	ACTTCG	2	12	1067178	1067189	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011666	CGCTCC	2	12	1068411	1068422	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_011666	GCTTAA	2	12	1077420	1077431	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011666	TCCCGC	2	12	1141205	1141216	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_011666	CGCCGG	2	12	1163010	1163021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011666	AGAAGC	2	12	1166380	1166391	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011666	CCATTC	2	12	1204716	1204727	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011666	AACGCT	2	12	1214219	1214230	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011666	CGCCGG	2	12	1243145	1243156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011666	GAAGCC	2	12	1245097	1245108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011666	TTCGAT	2	12	1318055	1318066	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011666	AAAACC	2	12	1387322	1387333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011666	GGCACA	2	12	1389074	1389085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011666	TCGAGC	2	12	1397267	1397278	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011666	CGTCGC	2	12	1397291	1397302	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011666	CTCGCG	2	12	1474534	1474545	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011666	TCGATT	2	12	1476669	1476680	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011666	CAAAAT	2	12	1580630	1580641	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_011666	GACGGC	2	12	1601620	1601631	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011666	CGCTTT	2	12	1605272	1605283	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011666	TTTGAG	2	12	1606191	1606202	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011666	CTTTGG	2	12	1606664	1606675	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011666	GCCTCC	2	12	1607226	1607237	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_011666	CTGGTG	2	12	1617325	1617336	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_011666	TTTGCA	2	12	1671150	1671161	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011666	AGTTGC	2	12	1685459	1685470	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_011666	GAGGCA	2	12	1698306	1698317	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_011666	TGGGCG	2	12	1729670	1729681	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_011666	AAGCTG	2	12	1749477	1749488	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011666	GCCGAG	2	12	1823263	1823274	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011666	CAATAT	2	12	1858018	1858029	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_011666	AATCGA	2	12	1880197	1880208	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011666	GGGCGC	2	12	1891355	1891366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011666	CGCCGG	2	12	1906470	1906481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011666	GCTTGA	2	12	1906537	1906548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_011666	CGGCGC	2	12	1907851	1907862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011666	TACAGA	2	12	1908321	1908332	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011666	CTGCGC	2	12	1932647	1932658	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011666	TCGTTT	2	12	1948627	1948638	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_011666	TGCGGC	2	12	1950520	1950531	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011666	CGGAGC	2	12	1953542	1953553	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011666	GGCGCG	2	12	1995884	1995895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011666	AACCCC	2	12	2022462	2022473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011666	CGGAAG	2	12	2062390	2062401	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_011666	AAGGGT	2	12	2068493	2068504	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011666	GTTTGG	2	12	2079242	2079253	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011666	CGGCGC	2	12	2097195	2097206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011666	GCCGCA	2	12	2100620	2100631	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011666	CGAAAT	2	12	2111754	2111765	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_011666	TCTCGA	2	12	2188767	2188778	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011666	CCGATC	2	12	2247603	2247614	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011666	CGCCGG	2	12	2264207	2264218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011666	CCGCGT	2	12	2280124	2280135	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011666	GAAGCG	2	12	2299995	2300006	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_011666	TCCTTG	2	12	2323778	2323789	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011666	CAAAAG	2	12	2335373	2335384	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_011666	GGCGCG	2	12	2335737	2335748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011666	GCGCGA	2	12	2339824	2339835	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011666	CGAAAG	2	12	2341009	2341020	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_011666	CGTTTT	2	12	2357947	2357958	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_011666	CCCTTG	2	12	2358768	2358779	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011666	GACTGT	2	12	2374660	2374671	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_011666	GTTGGC	2	12	2376378	2376389	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_011666	GCTTCG	2	12	2376440	2376451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011666	CGCTTG	2	12	2420230	2420241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011666	CCCTTC	2	12	2435278	2435289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011666	AAATCC	2	12	2438064	2438075	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011666	CTGCGC	2	12	2444948	2444959	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011666	CAGTTA	2	12	2451832	2451843	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_011666	TCGACT	2	12	2466506	2466517	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011666	GATCGC	2	12	2483672	2483683	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011666	CCAGCG	2	12	2483939	2483950	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011666	AAAGCG	2	12	2504137	2504148	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_011666	CCTCGC	2	12	2528951	2528962	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_011666	CTGCAG	2	12	2531726	2531737	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011666	TCGCAA	2	12	2544731	2544742	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011666	CGGCGC	2	12	2585602	2585613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011666	GGCGCA	2	12	2598487	2598498	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011666	GATTTC	2	12	2599691	2599702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_011666	GGCGAG	2	12	2609505	2609516	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_011666	CCCCGC	2	12	2722522	2722533	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
129	NC_011666	CCCTGT	2	12	2722599	2722610	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011666	GCCGGC	2	12	2725990	2726001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011666	CTTCAA	2	12	2731772	2731783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011666	CTTATT	2	12	2771061	2771072	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_011666	GCGTCG	2	12	2802738	2802749	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011666	GGCGCC	2	12	2805818	2805829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011666	GATCAA	2	12	2857995	2858006	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_011666	GTTGCG	2	12	2873318	2873329	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_011666	GCTGCC	2	12	2909351	2909362	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
138	NC_011666	GATGCG	2	12	3004816	3004827	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_011666	GATTCT	2	12	3029850	3029861	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_011666	TGAGCC	2	12	3048015	3048026	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011666	CTTTCG	2	12	3127042	3127053	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011666	CGACGC	2	12	3148081	3148092	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011666	TGAGAT	2	12	3206640	3206651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011666	CATCGA	2	12	3244633	3244644	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_011666	CGCCTC	2	12	3244730	3244741	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_011666	CGAGCC	2	12	3256426	3256437	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
147	NC_011666	CGGCAG	2	12	3355980	3355991	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_011666	GCCCCG	2	12	3386045	3386056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_011666	ACGCCG	2	12	3413673	3413684	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
150	NC_011666	GGCGCT	2	12	3417295	3417306	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_011666	ATTGTC	2	12	3417829	3417840	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_011666	CGCTTG	2	12	3431580	3431591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_011666	TTGCGT	2	12	3439304	3439315	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_011666	GAAAAA	2	12	3460129	3460140	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011666	GTCGGC	2	12	3469118	3469129	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_011666	TCAAAA	2	12	3483355	3483366	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_011666	CGCCTT	2	12	3490314	3490325	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
158	NC_011666	ATTGGC	2	12	3492125	3492136	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_011666	ACGCGG	2	12	3573172	3573183	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_011666	ATAAAA	2	12	3786579	3786590	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_011666	CGGCGC	2	12	3851684	3851695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.