MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD04

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010517	GCC	2	6	113	118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010517	TCT	2	6	178	183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010517	GGC	2	6	893	898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010517	GGA	2	6	1085	1090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010517	CGC	2	6	1171	1176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010517	CCG	2	6	1300	1305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010517	CCG	2	6	2134	2139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010517	AAG	2	6	2346	2351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010517	TAC	2	6	2430	2435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010517	TTC	2	6	2447	2452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010517	GCT	2	6	5149	5154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010517	GGC	2	6	5159	5164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010517	ACA	2	6	5209	5214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010517	CCT	2	6	5226	5231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_010517	GGT	2	6	5255	5260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010517	TGA	2	6	6331	6336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010517	TGG	2	6	6432	6437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010517	GAA	3	9	6539	6547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010517	CAC	2	6	6583	6588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010517	TGA	2	6	6702	6707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010517	GCC	2	6	7684	7689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_010517	GCT	2	6	7748	7753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010517	AGC	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010517	TCC	2	6	7984	7989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_010517	CAT	2	6	8024	8029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010517	GCA	2	6	8041	8046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010517	ATC	2	6	8109	8114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010517	CTC	2	6	8121	8126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_010517	ACC	2	6	8328	8333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010517	TCC	2	6	8342	8347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_010517	AGC	2	6	8398	8403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010517	AGC	2	6	9112	9117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010517	CGG	2	6	9122	9127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010517	CGG	2	6	9183	9188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010517	CCA	2	6	9875	9880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010517	TGC	2	6	9884	9889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010517	CCG	2	6	9980	9985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010517	CGC	2	6	9993	9998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_010517	TCG	2	6	10034	10039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010517	TCC	2	6	10096	10101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_010517	GGC	2	6	10108	10113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010517	GCC	2	6	10776	10781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_010517	GGC	2	6	11748	11753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010517	GCG	2	6	12634	12639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010517	CTG	2	6	12684	12689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010517	CAG	2	6	12690	12695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010517	GCC	2	6	12723	12728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_010517	AAC	2	6	12733	12738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010517	CGG	2	6	12751	12756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010517	CGG	2	6	12767	12772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010517	GCC	2	6	12858	12863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010517	GCC	2	6	12950	12955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010517	CCG	2	6	12996	13001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010517	ACG	2	6	14201	14206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010517	CTC	2	6	14237	14242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_010517	CGC	3	9	14304	14312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010517	AGT	2	6	15308	15313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010517	GGT	2	6	15324	15329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010517	TTG	2	6	15378	15383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010517	TGG	2	6	15780	15785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010517	CGA	2	6	15913	15918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010517	CTC	2	6	16199	16204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_010517	TCT	2	6	16233	16238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010517	GCC	2	6	16283	16288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010517	CCT	2	6	16326	16331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_010517	GCG	2	6	16509	16514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010517	GCT	2	6	17825	17830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010517	CGA	2	6	17911	17916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010517	CGC	2	6	17945	17950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_010517	CCG	2	6	18244	18249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_010517	CGA	2	6	18407	18412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010517	AGC	2	6	18520	18525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010517	CGG	2	6	18564	18569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010517	TCC	2	6	18676	18681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_010517	GCG	2	6	18819	18824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010517	TGC	2	6	18843	18848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010517	AGA	2	6	18866	18871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010517	CGG	2	6	18894	18899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010517	CGG	2	6	19989	19994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010517	CTG	2	6	20046	20051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010517	ATA	2	6	20216	20221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010517	TCG	2	6	21376	21381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010517	GAG	2	6	21812	21817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010517	CGC	3	9	22199	22207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010517	GTG	2	6	22268	22273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010517	CGG	2	6	22388	22393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010517	CGA	2	6	22416	22421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010517	CCA	2	6	23285	23290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010517	CCG	2	6	23349	23354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_010517	CGG	2	6	23383	23388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010517	GCC	2	6	23402	23407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010517	TCG	2	6	23566	23571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010517	CGA	2	6	24211	24216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010517	GCG	2	6	24237	24242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010517	GGC	2	6	24279	24284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010517	CGC	2	6	26449	26454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_010517	CTC	2	6	26491	26496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_010517	GCG	2	6	26580	26585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010517	CGA	2	6	26834	26839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010517	ACG	3	9	27030	27038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010517	GAC	2	6	27151	27156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010517	GAG	2	6	27198	27203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010517	GAT	2	6	27295	27300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010517	GGC	2	6	27301	27306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010517	CAC	2	6	27352	27357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_010517	TCT	2	6	27430	27435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010517	GCC	2	6	27528	27533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_010517	GTC	2	6	27682	27687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010517	CCG	2	6	27696	27701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_010517	GCA	2	6	29075	29080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010517	GCA	2	6	29095	29100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010517	GGC	2	6	29333	29338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010517	ACG	2	6	29356	29361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010517	GCC	2	6	29431	29436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_010517	CTG	2	6	29475	29480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010517	CGC	2	6	29516	29521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_010517	CCG	2	6	31361	31366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_010517	TCC	2	6	32259	32264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_010517	GGC	2	6	33387	33392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010517	CTT	2	6	35547	35552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010517	ATC	2	6	35623	35628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010517	AGC	2	6	35750	35755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010517	GGT	2	6	35760	35765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010517	TCC	2	6	35933	35938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_010517	GCG	2	6	36608	36613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.