MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD01

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010510	CGGCA	2	10	25	34	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_010510	AGCGC	2	10	1633	1642	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_010510	TGACC	2	10	10463	10472	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_010510	CGCGC	2	10	10616	10625	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_010510	GACGG	2	10	12965	12974	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010510	GCTCG	2	10	18319	18328	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_010510	ATGCG	2	10	20662	20671	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010510	GGCCG	2	10	20766	20775	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_010510	GACCG	2	10	21881	21890	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_010510	GCCCG	2	10	45872	45881	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_010510	GATCA	2	10	64228	64237	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_010510	CCGGG	2	10	72885	72894	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_010510	TTCGG	2	10	83811	83820	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010510	GGCCC	2	10	85449	85458	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_010510	CGCGC	2	10	85505	85514	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_010510	GACCG	2	10	102767	102776	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_010510	AAGGC	2	10	109505	109514	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010510	CGGGC	2	10	120466	120475	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_010510	CCCGC	2	10	121866	121875	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
20	NC_010510	GCCGA	2	10	143474	143483	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_010510	ATCGG	2	10	143487	143496	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010510	TCGTG	2	10	147471	147480	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010510	GATCG	2	10	148283	148292	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010510	AGAGG	2	10	150185	150194	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010510	TTGCG	2	10	151348	151357	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010510	GCCCT	2	10	151795	151804	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_010510	CCCTG	2	10	163394	163403	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_010510	GGAGG	2	10	166033	166042	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010510	GGCAG	2	10	166739	166748	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010510	CCGGC	2	10	171189	171198	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_010510	GGGAC	2	10	174841	174850	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010510	AGGGG	2	10	175743	175752	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010510	GCGCG	2	10	180741	180750	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_010510	ACACG	2	10	183439	183448	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_010510	CGGCG	2	10	198851	198860	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_010510	GAGGG	2	10	199096	199105	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010510	GGCCG	2	10	200662	200671	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_010510	GACGG	2	10	209245	209254	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010510	ATCGG	2	10	217480	217489	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010510	TCGCA	2	10	218343	218352	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_010510	GCCGC	2	10	221512	221521	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_010510	GCCGG	2	10	222856	222865	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_010510	CGCGG	2	10	224069	224078	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_010510	CGCGC	2	10	224269	224278	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_010510	GCGTC	2	10	228270	228279	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_010510	CCCGT	2	10	228400	228409	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_010510	CCGGT	2	10	228493	228502	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_010510	GACGG	2	10	233331	233340	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010510	CGGCC	2	10	235597	235606	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_010510	CGGCG	2	10	245886	245895	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_010510	CGGGC	2	10	251197	251206	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_010510	AGGTC	2	10	263681	263690	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010510	CCCGA	2	10	264157	264166	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_010510	CCGCT	2	10	264181	264190	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_010510	CGCGG	2	10	264249	264258	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_010510	GTCCG	2	10	267556	267565	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_010510	CCGCC	2	10	269086	269095	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
58	NC_010510	CGGAC	2	10	269126	269135	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_010510	CCGGC	2	10	270204	270213	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_010510	TTCGC	2	10	271965	271974	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_010510	GATGC	2	10	276996	277005	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010510	GCGAA	2	10	277907	277916	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010510	GTCTC	2	10	279069	279078	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_010510	TGCGG	2	10	279709	279718	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_010510	CCTCG	2	10	279849	279858	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_010510	CGTCG	2	10	279977	279986	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_010510	GGCCG	2	10	281586	281595	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
68	NC_010510	CGCGC	2	10	284504	284513	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_010510	ACCGC	2	10	286441	286450	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_010510	CCTCA	2	10	287345	287354	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
71	NC_010510	CGCGG	2	10	287496	287505	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
72	NC_010510	CGCGG	2	10	288270	288279	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_010510	CCGGT	2	10	289163	289172	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_010510	GCACC	2	10	290047	290056	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_010510	ACGTC	2	10	302211	302220	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_010510	CCGAC	2	10	306757	306766	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_010510	TCGAC	2	10	307550	307559	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_010510	GCTTC	2	10	307628	307637	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_010510	CACCC	2	10	311569	311578	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
80	NC_010510	GCGCT	2	10	313552	313561	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_010510	CATGC	2	10	316719	316728	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_010510	CGCTC	2	10	317235	317244	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_010510	ACCCA	2	10	317778	317787	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
84	NC_010510	CCGAA	2	10	340556	340565	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_010510	ACCCA	2	10	340604	340613	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_010510	GCACC	2	10	347034	347043	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_010510	CGACG	2	10	347472	347481	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_010510	GCGAG	2	10	350326	350335	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010510	ACCCA	2	10	352932	352941	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
90	NC_010510	CGGCG	2	10	364495	364504	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_010510	CGCGG	2	10	369281	369290	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_010510	CCCAA	2	10	371083	371092	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_010510	GAGCT	2	10	373893	373902	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010510	ATGCC	2	10	386160	386169	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_010510	TTCTG	2	10	386873	386882	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_010510	TTTCA	2	10	387547	387556	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_010510	CTAAC	2	10	388010	388019	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_010510	CGCCC	2	10	389614	389623	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
99	NC_010510	GACCG	2	10	394833	394842	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_010510	CAGCG	2	10	406798	406807	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_010510	GGGGA	2	10	415260	415269	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010510	CCTCC	2	10	415488	415497	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
103	NC_010510	CGGTC	2	10	416364	416373	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_010510	CGATC	2	10	419162	419171	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_010510	TGGCG	2	10	446918	446927	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_010510	TCCAG	2	10	449561	449570	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_010510	TCGGG	2	10	449924	449933	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_010510	GCCTC	2	10	461310	461319	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_010510	CCGCG	2	10	461897	461906	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
110	NC_010510	CGTCC	2	10	470443	470452	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_010510	GACGA	2	10	471285	471294	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010510	GGCCC	2	10	471387	471396	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
113	NC_010510	ATGCC	2	10	484970	484979	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_010510	GGCGC	2	10	487853	487862	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_010510	AGGCC	2	10	504246	504255	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_010510	CCGAT	2	10	516082	516091	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_010510	CGAGC	2	10	516880	516889	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_010510	CCGGG	2	10	530653	530662	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_010510	CGCGT	2	10	539645	539654	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_010510	TCGTG	2	10	544615	544624	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_010510	AGAGG	2	10	547323	547332	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010510	TTGCG	2	10	548486	548495	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010510	CGCGC	2	10	557283	557292	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_010510	GGCCC	2	10	558366	558375	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125	NC_010510	CGCGT	2	10	559314	559323	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_010510	GCGCG	2	10	562686	562695	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_010510	ACGGC	2	10	563497	563506	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_010510	CCCGG	2	10	566462	566471	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
129	NC_010510	GGCCC	2	10	569754	569763	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130	NC_010510	TCCCG	2	10	571174	571183	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_010510	AAAAC	2	10	572268	572277	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_010510	CGGTC	2	10	575301	575310	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_010510	CGACG	2	10	578856	578865	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_010510	CGTGC	2	10	581901	581910	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_010510	GTGCG	2	10	585468	585477	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_010510	CGCAC	2	10	585490	585499	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.