MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD01

Total Repeats: 433

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010510	CGGA	2	8	1473	1480	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010510	CCGG	2	8	1723	1730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010510	GCCG	2	8	1887	1894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010510	CGGA	2	8	2844	2851	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010510	GCCG	2	8	3401	3408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010510	GCCG	2	8	3421	3428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010510	CGCT	2	8	3690	3697	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010510	ATCC	2	8	8740	8747	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010510	GGCA	2	8	10604	10611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010510	AGGC	2	8	11023	11030	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010510	GGGC	2	8	11054	11061	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010510	GCCG	2	8	12592	12599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010510	TCGA	2	8	12816	12823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010510	CAGG	2	8	13030	13037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010510	CGCC	2	8	16064	16071	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_010510	CCGG	2	8	16113	16120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010510	GGCG	2	8	16191	16198	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010510	CGCC	2	8	16497	16504	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_010510	GGTC	2	8	19030	19037	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010510	CCGA	2	8	19153	19160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010510	CAGC	2	8	19302	19309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010510	GGTG	2	8	19406	19413	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010510	CCGG	2	8	20011	20018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010510	CCGA	2	8	20127	20134	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010510	CGGC	2	8	20141	20148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010510	GCCG	2	8	20614	20621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010510	CGAT	2	8	20709	20716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010510	CGGC	2	8	20886	20893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010510	CGGT	2	8	22056	22063	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010510	GCCG	2	8	22817	22824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010510	GTCC	2	8	22832	22839	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010510	CCTG	2	8	22855	22862	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010510	TGCT	2	8	23479	23486	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010510	CTCC	2	8	26211	26218	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_010510	GCCG	2	8	26282	26289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010510	TCGG	2	8	26302	26309	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010510	GCCC	2	8	26633	26640	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_010510	GGGC	2	8	34301	34308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010510	AGGC	2	8	34370	34377	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010510	GCGG	2	8	35353	35360	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010510	CGGC	2	8	38270	38277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010510	CCGG	2	8	39037	39044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010510	CGGC	2	8	39105	39112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010510	CCCG	2	8	39232	39239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_010510	GACC	2	8	42596	42603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010510	GCCC	2	8	42702	42709	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_010510	CCGG	2	8	45924	45931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010510	CCCA	2	8	54597	54604	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_010510	GGCG	2	8	56707	56714	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010510	CGCA	2	8	64108	64115	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010510	GTGC	2	8	64390	64397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010510	CGGG	2	8	76842	76849	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010510	CGCC	2	8	79859	79866	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_010510	CGGC	2	8	79893	79900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010510	ATCA	2	8	82520	82527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010510	CTTG	2	8	83855	83862	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010510	CCCG	2	8	85481	85488	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_010510	GACC	2	8	85497	85504	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010510	GCCG	2	8	85552	85559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010510	CCGG	2	8	85572	85579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010510	GGCC	2	8	89327	89334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010510	ACGA	2	8	95777	95784	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010510	GCCG	2	8	100590	100597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010510	AGGG	2	8	102481	102488	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010510	GCGA	2	8	102545	102552	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010510	CCGC	2	8	104174	104181	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_010510	GCGA	2	8	106021	106028	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010510	GCGG	2	8	109712	109719	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010510	CGGC	2	8	109723	109730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010510	CCCG	2	8	113424	113431	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_010510	CGGG	2	8	113775	113782	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010510	GGGT	2	8	116239	116246	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010510	GCCG	2	8	117326	117333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010510	CTCC	2	8	117678	117685	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_010510	ATCA	2	8	122588	122595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010510	CGCC	3	12	124268	124279	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_010510	CGGG	2	8	130241	130248	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010510	CCCG	2	8	131267	131274	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_010510	GGCC	2	8	133465	133472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010510	CTGA	2	8	133547	133554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010510	TGCG	2	8	133613	133620	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010510	TGGC	2	8	133755	133762	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010510	TCGC	2	8	133793	133800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010510	CTCA	2	8	134175	134182	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010510	CCGG	2	8	135111	135118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010510	CGGC	2	8	137597	137604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010510	GATG	2	8	138080	138087	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010510	GGCG	2	8	138152	138159	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010510	CGCC	2	8	140930	140937	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_010510	ATCG	2	8	143403	143410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010510	CGGA	2	8	143542	143549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010510	CTCC	2	8	143569	143576	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_010510	TGCG	2	8	143648	143655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010510	TCGA	2	8	145620	145627	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010510	GAGG	2	8	145636	145643	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010510	GCGA	2	8	145698	145705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010510	ACGC	2	8	145748	145755	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_010510	CGGG	2	8	145829	145836	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010510	GGGC	2	8	146166	146173	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010510	CGGA	2	8	146178	146185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010510	GTGA	2	8	146831	146838	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010510	TCAG	2	8	148015	148022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010510	GCGA	2	8	148695	148702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010510	GACG	2	8	148784	148791	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010510	CGAG	2	8	149036	149043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010510	CCAA	2	8	149343	149350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010510	CGTC	2	8	149400	149407	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_010510	AAAG	2	8	149523	149530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010510	GAAG	2	8	149662	149669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010510	GGCA	2	8	150556	150563	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010510	GACA	2	8	150675	150682	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010510	GTGG	2	8	150729	150736	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010510	ACGG	2	8	151051	151058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010510	CGAA	2	8	151297	151304	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010510	GTCG	2	8	151461	151468	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010510	AGCG	2	8	159224	159231	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010510	GTCG	2	8	159467	159474	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010510	TGGC	2	8	160455	160462	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010510	GGTC	2	8	160503	160510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010510	GGGC	2	8	160556	160563	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010510	CCCG	2	8	161475	161482	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_010510	TCGA	2	8	161541	161548	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010510	GCCC	2	8	161589	161596	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_010510	CGGG	2	8	161770	161777	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010510	TTGG	2	8	166162	166169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010510	GCCG	2	8	166715	166722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010510	TCGG	2	8	166804	166811	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010510	GTTC	2	8	167216	167223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010510	CCCG	2	8	167469	167476	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_010510	GTCG	2	8	171142	171149	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010510	CCGG	2	8	172256	172263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010510	GGGC	2	8	175729	175736	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010510	TGCG	2	8	175758	175765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_010510	GGCG	2	8	177005	177012	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010510	CGGC	2	8	179299	179306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_010510	GATG	2	8	180660	180667	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010510	TCGC	2	8	182699	182706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_010510	AGGA	2	8	185074	185081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010510	CCGG	2	8	186526	186533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010510	GCCG	2	8	187806	187813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_010510	GGCG	2	8	187821	187828	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010510	GGGA	2	8	187847	187854	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010510	CGGG	2	8	190337	190344	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010510	CCGG	2	8	190665	190672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_010510	CGGC	3	12	193611	193622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010510	GCGA	2	8	193962	193969	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010510	CCGG	2	8	195333	195340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010510	GAGG	2	8	195384	195391	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010510	GCCC	2	8	198619	198626	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_010510	GCGG	2	8	198695	198702	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010510	GACC	2	8	198740	198747	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_010510	ATCG	2	8	198798	198805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_010510	CGGC	2	8	198867	198874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_010510	TTGC	2	8	199180	199187	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_010510	GAGG	2	8	199324	199331	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010510	GCCC	2	8	200871	200878	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
157	NC_010510	CATT	2	8	201953	201960	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_010510	GCCG	2	8	206402	206409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_010510	CGGG	2	8	209298	209305	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
160	NC_010510	CCGG	2	8	218489	218496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_010510	GCCC	2	8	220764	220771	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
162	NC_010510	GCGG	2	8	221481	221488	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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165	NC_010510	CCGG	2	8	223921	223928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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169	NC_010510	GCAA	2	8	224531	224538	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_010510	GCCG	2	8	224615	224622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
171	NC_010510	GGAG	2	8	228230	228237	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
172	NC_010510	GCCG	2	8	228761	228768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
173	NC_010510	GCCG	2	8	228786	228793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
174	NC_010510	GCGG	2	8	228872	228879	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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179	NC_010510	CCCG	2	8	245556	245563	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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182	NC_010510	CCGG	2	8	251110	251117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
183	NC_010510	CCGG	2	8	251317	251324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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191	NC_010510	GGCC	2	8	255132	255139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
192	NC_010510	GACC	2	8	256695	256702	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
193	NC_010510	GCGA	2	8	257314	257321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
194	NC_010510	CCGA	2	8	257449	257456	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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232	NC_010510	ACGC	2	8	299242	299249	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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292	NC_010510	CCGG	2	8	364389	364396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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294	NC_010510	GGCG	2	8	369156	369163	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
295	NC_010510	CCGG	2	8	369374	369381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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297	NC_010510	GCCG	2	8	369780	369787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
298	NC_010510	GGTC	2	8	371243	371250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
299	NC_010510	GAGG	2	8	372588	372595	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.