MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD01

Total Repeats: 2818

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010510	GA	3	6	543494	543499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_010510	GAT	2	6	543552	543557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_010510	TGT	2	6	543576	543581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_010510	GGC	2	6	543641	543646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_010510	GCG	2	6	543687	543692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_010510	TGG	2	6	543824	543829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_010510	CGA	2	6	543848	543853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_010510	GAT	2	6	543873	543878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_010510	GCA	2	6	543922	543927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_010510	GTGA	2	8	543975	543982	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_010510	GGA	2	6	544036	544041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_010510	CAG	2	6	544065	544070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_010510	GGC	2	6	544130	544135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_010510	TGG	2	6	544215	544220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_010510	GGC	2	6	544276	544281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_010510	AG	3	6	544555	544560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_010510	GC	3	6	544581	544586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2518	NC_010510	TGC	2	6	544594	544599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_010510	GTC	2	6	544606	544611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_010510	TCGTG	2	10	544615	544624	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2521	NC_010510	CAT	2	6	544674	544679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_010510	AC	3	6	544770	544775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2523	NC_010510	AC	3	6	544938	544943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2524	NC_010510	AGG	2	6	544997	545002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_010510	CCT	2	6	545079	545084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2526	NC_010510	CAG	2	6	545100	545105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_010510	CTC	2	6	545127	545132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2528	NC_010510	TCAG	2	8	545159	545166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2529	NC_010510	TTTCTC	2	12	545197	545208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_010510	CCG	2	6	545228	545233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2531	NC_010510	AG	3	6	545381	545386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_010510	CGG	2	6	545399	545404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_010510	GGT	2	6	545424	545429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_010510	TCC	2	6	545490	545495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2535	NC_010510	GGA	2	6	545797	545802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_010510	AGT	2	6	545826	545831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_010510	GCGA	2	8	545833	545840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2538	NC_010510	GACG	2	8	545922	545929	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2539	NC_010510	G	6	6	545979	545984	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_010510	ACC	2	6	545985	545990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2541	NC_010510	CTC	2	6	546006	546011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2542	NC_010510	CGA	2	6	546060	546065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_010510	CGAG	2	8	546174	546181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2544	NC_010510	GCC	2	6	546459	546464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2545	NC_010510	CCAA	2	8	546481	546488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2546	NC_010510	AC	3	6	546520	546525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2547	NC_010510	CGTC	2	8	546538	546545	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2548	NC_010510	AAC	2	6	546557	546562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_010510	AGG	2	6	546631	546636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_010510	AGC	2	6	546647	546652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_010510	AAAG	2	8	546661	546668	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_010510	GT	3	6	546747	546752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_010510	GAAG	2	8	546800	546807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_010510	GA	3	6	547134	547139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_010510	AGG	2	6	547186	547191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_010510	GAC	2	6	547280	547285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_010510	AGAGG	2	10	547323	547332	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_010510	CGG	2	6	547362	547367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_010510	GGT	2	6	547580	547585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_010510	TGG	2	6	547612	547617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_010510	ACC	2	6	547633	547638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_010510	TGG	2	6	547649	547654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_010510	GGCA	2	8	547694	547701	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2564	NC_010510	TCG	2	6	547776	547781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_010510	GACA	2	8	547813	547820	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2566	NC_010510	GGT	2	6	547856	547861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_010510	GTGG	2	8	547867	547874	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_010510	TGA	2	6	547917	547922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_010510	TCA	2	6	547971	547976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_010510	CGT	2	6	548051	548056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_010510	AGG	2	6	548089	548094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_010510	TGG	2	6	548144	548149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_010510	TGT	2	6	548153	548158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_010510	GCA	2	6	548174	548179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_010510	ACGG	2	8	548189	548196	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2576	NC_010510	C	6	6	548227	548232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2577	NC_010510	GAC	2	6	548265	548270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_010510	GCG	2	6	548297	548302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_010510	TCCGTG	2	12	548356	548367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_010510	CCA	2	6	548420	548425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2581	NC_010510	CGAA	2	8	548435	548442	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2582	NC_010510	GCA	2	6	548455	548460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_010510	GCC	2	6	548467	548472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2584	NC_010510	A	6	6	548480	548485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_010510	TTGCG	2	10	548486	548495	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2586	NC_010510	TGG	2	6	548502	548507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_010510	GCG	2	6	548513	548518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_010510	GTCG	2	8	548599	548606	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2589	NC_010510	CAC	2	6	548669	548674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2590	NC_010510	AGC	2	6	548760	548765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2591	NC_010510	CGT	2	6	548941	548946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_010510	GAT	2	6	548949	548954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_010510	AGG	3	9	549009	549017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_010510	GCT	2	6	550235	550240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_010510	CGGT	2	8	550255	550262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2596	NC_010510	CT	3	6	550453	550458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2597	NC_010510	GGC	2	6	550465	550470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_010510	CTG	2	6	550482	550487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_010510	CGCA	2	8	550507	550514	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2600	NC_010510	CCG	2	6	552431	552436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2601	NC_010510	CACG	2	8	552458	552465	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2602	NC_010510	GCT	2	6	552467	552472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_010510	CCG	2	6	552483	552488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2604	NC_010510	GCG	2	6	556447	556452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_010510	GCCT	2	8	556489	556496	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2606	NC_010510	CG	4	8	556499	556506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2607	NC_010510	GAT	2	6	556547	556552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_010510	GAC	2	6	556590	556595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_010510	GCC	2	6	556613	556618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2610	NC_010510	GTC	2	6	556655	556660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_010510	GGA	2	6	556679	556684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_010510	GA	3	6	556683	556688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_010510	TGA	2	6	557014	557019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_010510	TCGA	2	8	557050	557057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2615	NC_010510	TCG	2	6	557077	557082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_010510	CTC	2	6	557093	557098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2617	NC_010510	GACG	2	8	557194	557201	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2618	NC_010510	CGA	2	6	557242	557247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_010510	CTC	2	6	557272	557277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2620	NC_010510	CGCGC	2	10	557283	557292	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2621	NC_010510	TCC	2	6	557294	557299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2622	NC_010510	ACG	2	6	557390	557395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_010510	GCA	2	6	557486	557491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_010510	CG	3	6	557501	557506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2625	NC_010510	CGG	2	6	557520	557525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_010510	CGG	2	6	557640	557645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_010510	GCC	2	6	557996	558001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2628	NC_010510	CCA	2	6	558033	558038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2629	NC_010510	GTCG	2	8	558180	558187	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2630	NC_010510	CTT	2	6	558220	558225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_010510	ATC	2	6	558246	558251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_010510	GGC	3	9	558287	558295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_010510	ATCC	2	8	558302	558309	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2634	NC_010510	GGCCC	2	10	558366	558375	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2635	NC_010510	GC	3	6	558439	558444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2770	NC_010510	GAG	2	6	575320	575325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2771	NC_010510	G	6	6	575369	575374	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2772	NC_010510	GGC	2	6	575414	575419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2773	NC_010510	GACC	2	8	575439	575446	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2774	NC_010510	TC	3	6	575467	575472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2775	NC_010510	ACC	2	6	575520	575525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2776	NC_010510	CCGG	2	8	575560	575567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2777	NC_010510	GTC	2	6	575585	575590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2778	NC_010510	CGA	2	6	575661	575666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2779	NC_010510	CGA	2	6	575728	575733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2780	NC_010510	GATC	2	8	578814	578821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2781	NC_010510	CGACG	2	10	578856	578865	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2782	NC_010510	CGC	2	6	578890	578895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2783	NC_010510	GCG	2	6	578900	578905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2784	NC_010510	GC	3	6	581578	581583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2785	NC_010510	TGC	2	6	581618	581623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2786	NC_010510	GC	3	6	581622	581627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2787	NC_010510	CCT	2	6	581699	581704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2788	NC_010510	GC	3	6	581774	581779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2789	NC_010510	CGC	2	6	581847	581852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2790	NC_010510	CG	3	6	581861	581866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2791	NC_010510	CG	3	6	581876	581881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2792	NC_010510	CGTGC	2	10	581901	581910	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2793	NC_010510	GC	3	6	581926	581931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2794	NC_010510	GTGC	2	8	582004	582011	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2795	NC_010510	CGAT	2	8	583316	583323	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2796	NC_010510	GCC	2	6	583484	583489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2797	NC_010510	GGT	2	6	583534	583539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2798	NC_010510	GCG	2	6	583571	583576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2799	NC_010510	CAC	2	6	583596	583601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2800	NC_010510	CCG	2	6	583633	583638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2801	NC_010510	GCCG	3	12	584758	584769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2802	NC_010510	CG	3	6	585164	585169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2803	NC_010510	CGGC	2	8	585230	585237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2804	NC_010510	CGGG	2	8	585309	585316	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2805	NC_010510	CCT	2	6	585324	585329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2806	NC_010510	CG	3	6	585358	585363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2807	NC_010510	TCG	2	6	585369	585374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2808	NC_010510	CCG	2	6	585391	585396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2809	NC_010510	GC	3	6	585409	585414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2810	NC_010510	GTGCG	2	10	585468	585477	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2811	NC_010510	CGCAC	2	10	585490	585499	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2812	NC_010510	CGC	2	6	585507	585512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2813	NC_010510	CG	3	6	585768	585773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2814	NC_010510	GGC	2	6	585786	585791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2815	NC_010510	GCC	2	6	585817	585822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2816	NC_010510	TCG	2	6	585842	585847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2817	NC_010510	CGA	2	6	586021	586026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2818	NC_010510	GCC	2	6	586096	586101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.