MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium abscessus plasmid

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010394	CCT	2	6	126	131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010394	CGG	2	6	1417	1422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010394	CGA	3	9	1753	1761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010394	TCG	3	9	1824	1832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010394	GGC	2	6	1858	1863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010394	CGG	3	9	1864	1872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010394	ATC	2	6	1892	1897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010394	GCG	2	6	1968	1973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010394	CAT	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010394	CGA	2	6	1990	1995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010394	TTC	2	6	2037	2042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010394	CGG	2	6	2100	2105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010394	GTC	2	6	2315	2320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010394	CTG	2	6	2337	2342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010394	TTC	2	6	2363	2368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010394	CGG	2	6	3873	3878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010394	CCG	2	6	3895	3900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_010394	TGA	2	6	5365	5370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010394	GCC	2	6	5415	5420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010394	CGC	3	9	5445	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_010394	TCG	2	6	7946	7951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010394	CCG	2	6	8722	8727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_010394	CCG	3	9	13263	13271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010394	ACC	3	9	16634	16642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_010394	GGT	2	6	16718	16723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010394	CGA	2	6	16850	16855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010394	CAC	2	6	18069	18074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_010394	AGC	2	6	18087	18092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010394	CAG	2	6	18101	18106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010394	GCG	2	6	18113	18118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010394	CCT	2	6	18454	18459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010394	GCC	2	6	18484	18489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_010394	CGG	2	6	18544	18549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010394	CCT	2	6	18692	18697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010394	CGG	2	6	19207	19212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010394	CGC	2	6	19231	19236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010394	TCG	2	6	19321	19326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010394	GGC	2	6	19340	19345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010394	GCG	2	6	19346	19351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010394	CCG	2	6	19374	19379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_010394	CGG	3	9	19424	19432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010394	TCA	2	6	19444	19449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010394	ACT	2	6	19788	19793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010394	CGG	2	6	19849	19854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010394	CAG	2	6	19898	19903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010394	CAG	2	6	19940	19945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010394	GCG	2	6	19997	20002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010394	GCG	2	6	20155	20160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010394	GAC	2	6	20173	20178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010394	CAC	2	6	20179	20184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010394	GCG	2	6	20236	20241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010394	GTC	2	6	20255	20260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010394	TGA	2	6	20270	20275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010394	CGA	2	6	20303	20308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010394	ACG	2	6	20416	20421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010394	GGT	2	6	20474	20479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010394	TCG	2	6	20569	20574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010394	CGT	2	6	20617	20622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010394	CAA	2	6	20799	20804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010394	CGT	2	6	20865	20870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010394	GGT	2	6	22227	22232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010394	TCA	2	6	23197	23202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.