MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanococcus maripaludis C6 chromosome

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009975	ATTTTT	2	12	18235	18246	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009975	TAAAAA	2	12	24705	24716	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009975	TTAAAA	2	12	32525	32536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009975	TTTTTA	2	12	33503	33514	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009975	TTATTT	2	12	40705	40716	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009975	ATTAAA	2	12	40872	40883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009975	ATTTTT	2	12	48326	48337	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009975	AATTTA	2	12	50243	50254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009975	ACTGAA	2	12	55939	55950	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009975	ATTAAT	2	12	56032	56043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009975	TAATTT	2	12	80553	80564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009975	TTTTAA	2	12	91545	91556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009975	ATGAAT	2	12	92728	92739	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009975	TTTTAA	2	12	111270	111281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009975	ATTTTA	2	12	139854	139865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009975	AATATA	2	12	140957	140968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009975	ATTTTT	2	12	166349	166360	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009975	TAAAAA	2	12	198234	198245	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009975	TTATAA	2	12	201740	201751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009975	AAATTA	2	12	229055	229066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009975	GATTAA	2	12	237429	237440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009975	ATTTGG	2	12	241717	241728	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009975	TAAAAT	2	12	268170	268181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009975	ATTTTA	2	12	270520	270531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009975	AATTTT	2	12	288637	288648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009975	AAATTA	2	12	299009	299020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009975	TTAAAA	2	12	346572	346583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009975	TTTAAA	2	12	367173	367184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009975	TAAAAT	2	12	367520	367531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009975	AAAAGG	2	12	369359	369370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009975	TAAAAA	2	12	370185	370196	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009975	TAAAAA	2	12	397986	397997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009975	TTAAAT	2	12	417940	417951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009975	AAAAAT	2	12	420018	420029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009975	AAATAT	2	12	420100	420111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009975	AAATTA	2	12	428391	428402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009975	CTTGAA	2	12	435450	435461	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009975	ATTTTA	2	12	445668	445679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009975	ATTCTG	2	12	456833	456844	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009975	GTTTTC	2	12	457262	457273	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009975	AATTTT	2	12	461703	461714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009975	TTAAAA	2	12	476441	476452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009975	TTTAAT	2	12	506373	506384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009975	ATATTT	2	12	561443	561454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009975	TAAAAA	2	12	569202	569213	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009975	TAAAAA	2	12	570834	570845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009975	AATTTT	2	12	584569	584580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009975	ATATTT	2	12	585843	585854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009975	CAAATT	2	12	593622	593633	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009975	TTTTTA	2	12	600658	600669	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009975	TTTAAA	2	12	600867	600878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009975	TTTGCT	2	12	602041	602052	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009975	TTTAAA	2	12	602335	602346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009975	ATAAAA	2	12	617247	617258	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009975	AATTAT	2	12	644922	644933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009975	TAAAAA	2	12	687759	687770	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009975	GATTTT	2	12	691639	691650	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009975	TTTAAA	2	12	693741	693752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009975	TTAAAA	2	12	705845	705856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009975	ATTTTT	2	12	711528	711539	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009975	TAACTA	2	12	720284	720295	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009975	TCTTGA	2	12	739934	739945	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009975	AAAATG	2	12	741719	741730	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009975	TAAAAC	2	12	775226	775237	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009975	TTTTTA	2	12	818394	818405	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009975	ATTCTT	2	12	821710	821721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_009975	AATTTA	2	12	840889	840900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009975	TTAATT	2	12	850915	850926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009975	AAAATT	2	12	852137	852148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009975	TTAAAA	2	12	852149	852160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009975	AATAAA	2	12	852330	852341	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009975	GGCCTT	2	12	860505	860516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009975	CGTAGG	2	12	861508	861519	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009975	TTAAAT	2	12	872363	872374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009975	GGCCTT	2	12	892815	892826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009975	CGTAGG	2	12	893738	893749	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009975	GGCCTT	2	12	897856	897867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009975	CGTAGG	2	12	898779	898790	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_009975	TAATAT	2	12	923365	923376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009975	ATTTTA	2	12	931194	931205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009975	CCCTGC	2	12	962462	962473	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_009975	TAATTT	2	12	983258	983269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009975	TTTTAA	2	12	1007950	1007961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009975	TTTTAA	2	12	1013806	1013817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009975	ATTTTT	3	18	1013839	1013856	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009975	TAAATT	2	12	1038860	1038871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009975	AATTTA	2	12	1056771	1056782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009975	TAAAAA	2	12	1056797	1056808	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009975	GGTAGA	2	12	1061321	1061332	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009975	AATATT	2	12	1065217	1065228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009975	ATTTTA	2	12	1065299	1065310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009975	AAATTA	2	12	1123573	1123584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009975	AAAATA	2	12	1153038	1153049	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009975	TTAATT	2	12	1193799	1193810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009975	TTAAAA	2	12	1203202	1203213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009975	TAATAT	2	12	1223089	1223100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009975	AATAAA	2	12	1226500	1226511	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009975	TAAAAA	2	12	1229527	1229538	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009975	TATTTT	2	12	1233089	1233100	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009975	TATTGA	2	12	1254059	1254070	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009975	AAAAAT	2	12	1268957	1268968	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009975	ATTTTT	3	18	1274177	1274194	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009975	ATTACT	2	12	1274237	1274248	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_009975	TAATTA	2	12	1301350	1301361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009975	TTTAAT	2	12	1318021	1318032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009975	TTATAT	2	12	1318043	1318054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009975	CTTTTT	2	12	1318944	1318955	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009975	TTATAT	2	12	1333743	1333754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009975	TATAAT	2	12	1348150	1348161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009975	ATTTAA	2	12	1353207	1353218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009975	AATATT	2	12	1369039	1369050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009975	AATTTT	2	12	1382182	1382193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009975	ATTTTA	2	12	1419783	1419794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009975	GAATTA	2	12	1421158	1421169	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009975	GATAAA	2	12	1421473	1421484	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009975	GTATTT	2	12	1424140	1424151	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009975	TAAAAA	2	12	1435207	1435218	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009975	TTAATG	2	12	1441404	1441415	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009975	TTAAAA	2	12	1462826	1462837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009975	TTAATT	2	12	1471480	1471491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009975	AAATTT	2	12	1473889	1473900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009975	TTTAAA	2	12	1487176	1487187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009975	TTAGAT	2	12	1523045	1523056	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009975	TTTTTA	2	12	1523083	1523094	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009975	ATTTTT	2	12	1529669	1529680	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009975	TGTTAA	2	12	1562295	1562306	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009975	TGAATT	2	12	1567744	1567755	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009975	ATATTA	2	12	1571760	1571771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009975	TAAAAA	2	12	1585583	1585594	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009975	AACATA	2	12	1599387	1599398	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_009975	TAAAAA	2	12	1608560	1608571	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009975	TAAAAA	2	12	1616202	1616213	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009975	CTAAAA	2	12	1618514	1618525	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.