MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanoregula boonei 6A8 chromosome

Total Repeats: 890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009712	TTTC	2	8	81	88	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009712	GTAC	2	8	295	302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009712	CATT	2	8	7627	7634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009712	CTGA	2	8	14794	14801	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009712	GGCC	2	8	20492	20499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009712	ATTC	2	8	28356	28363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009712	CTGC	2	8	34114	34121	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009712	CCCT	2	8	36799	36806	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_009712	TGTT	2	8	38411	38418	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009712	CGGA	2	8	41460	41467	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009712	ATTC	2	8	59678	59685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009712	TAAT	2	8	61664	61671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009712	AGGA	2	8	62859	62866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009712	CCGG	2	8	66975	66982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009712	GTGA	2	8	70395	70402	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009712	AATC	2	8	70510	70517	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009712	CTGC	2	8	70528	70535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009712	CCGG	2	8	71255	71262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009712	GCTC	2	8	71327	71334	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009712	GGCC	2	8	72983	72990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009712	CGAT	2	8	76320	76327	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009712	TGGA	2	8	76680	76687	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009712	ATAA	2	8	79861	79868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009712	GAAG	2	8	86423	86430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009712	GGAT	2	8	87359	87366	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009712	CGAC	2	8	90666	90673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009712	ACGA	2	8	91423	91430	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009712	GGGA	2	8	91668	91675	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009712	GATT	2	8	92120	92127	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009712	TCTT	2	8	92248	92255	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009712	CTTT	2	8	92296	92303	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009712	AATT	2	8	92353	92360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009712	TCGG	2	8	92885	92892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009712	GGTC	2	8	92957	92964	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009712	ATCG	2	8	92979	92986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009712	AAAT	2	8	93587	93594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009712	AAAG	2	8	93901	93908	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009712	GGGA	2	8	96900	96907	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009712	TTCC	2	8	104733	104740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009712	AGCC	2	8	106210	106217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009712	TGGC	2	8	132542	132549	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009712	GCAT	2	8	132770	132777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009712	ATAC	2	8	133824	133831	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009712	GTTG	2	8	133865	133872	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009712	GAAG	2	8	134347	134354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009712	CGGG	2	8	134483	134490	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009712	CTAA	2	8	135068	135075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009712	GATC	2	8	135080	135087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009712	TTAG	2	8	135526	135533	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009712	CCTG	2	8	138040	138047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009712	CCAC	2	8	144850	144857	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_009712	GCAG	2	8	144950	144957	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009712	GGCT	2	8	147731	147738	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009712	ATAA	2	8	148104	148111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009712	TAAA	2	8	149350	149357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009712	TGAT	2	8	149497	149504	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009712	GCCG	2	8	161862	161869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009712	TTAT	2	8	170973	170980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009712	CCGG	2	8	172438	172445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009712	CCCG	2	8	173389	173396	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_009712	AAAG	2	8	173561	173568	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009712	GGTA	2	8	173737	173744	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009712	TCCA	2	8	187162	187169	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009712	GCAG	2	8	189967	189974	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009712	CGAA	2	8	191036	191043	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009712	GGGT	2	8	193113	193120	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009712	TAAA	2	8	193807	193814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009712	CGGG	2	8	197268	197275	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009712	GCCG	2	8	199361	199368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009712	CGGT	2	8	201621	201628	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009712	CCGG	2	8	202755	202762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009712	CCGG	2	8	203114	203121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009712	CCCT	2	8	203617	203624	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_009712	GGCC	2	8	210018	210025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009712	CGGC	2	8	216634	216641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009712	CCGT	2	8	218365	218372	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009712	TGTT	2	8	220816	220823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009712	GCAT	2	8	221326	221333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009712	GCTT	2	8	221437	221444	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009712	GAAA	2	8	221508	221515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009712	CGAC	2	8	243417	243424	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009712	ATCG	2	8	243440	243447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009712	CCGA	2	8	243523	243530	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009712	CCGA	2	8	243642	243649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009712	TCGG	2	8	243658	243665	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009712	GACA	2	8	245212	245219	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009712	CCTG	2	8	249587	249594	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009712	TCAT	2	8	260340	260347	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009712	CCTG	2	8	268005	268012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009712	AAAT	2	8	270842	270849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009712	AGGC	2	8	272366	272373	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009712	AAAC	2	8	272397	272404	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009712	CCTC	2	8	274957	274964	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_009712	CGAT	2	8	275001	275008	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009712	TCGG	2	8	275016	275023	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009712	GGCA	2	8	276800	276807	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009712	CTTT	2	8	277004	277011	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009712	TACT	2	8	279280	279287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009712	CCGT	2	8	281567	281574	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009712	TGCC	2	8	281605	281612	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009712	GCCT	2	8	284801	284808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009712	GATC	2	8	284865	284872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009712	CCGG	2	8	284949	284956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009712	ACAT	2	8	288039	288046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009712	TTTG	2	8	288297	288304	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009712	ACGC	2	8	288424	288431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009712	GCAG	2	8	288597	288604	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009712	ATTT	2	8	293698	293705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009712	TAAA	2	8	293711	293718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009712	CGGG	2	8	294639	294646	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009712	CAGG	2	8	295180	295187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009712	TCCT	2	8	295356	295363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009712	GAGG	2	8	295511	295518	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009712	GTTC	2	8	295548	295555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009712	GGAG	2	8	297792	297799	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009712	ATGT	2	8	299342	299349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009712	AAAC	2	8	303106	303113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009712	CGGA	2	8	303718	303725	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009712	TACG	2	8	305819	305826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009712	GTAT	2	8	312424	312431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009712	GCAG	2	8	313380	313387	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009712	TACG	2	8	314106	314113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009712	CTTT	2	8	314438	314445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009712	CCGG	2	8	319413	319420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009712	ATTT	2	8	321354	321361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009712	AAAT	2	8	321799	321806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009712	TCCC	2	8	321888	321895	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_009712	CAGG	2	8	325894	325901	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009712	CCCG	2	8	327609	327616	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_009712	CTGC	2	8	332184	332191	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009712	TCCC	2	8	333016	333023	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_009712	CAGG	2	8	333680	333687	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009712	CGGG	2	8	333725	333732	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009712	CCGG	2	8	338016	338023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009712	TCCT	2	8	338423	338430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009712	TCCT	2	8	339680	339687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009712	ATGG	2	8	349377	349384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009712	CTTC	2	8	355893	355900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009712	TTTC	2	8	356013	356020	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009712	CCTG	2	8	357146	357153	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009712	CATT	2	8	357198	357205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009712	GCGG	2	8	359903	359910	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009712	GGGC	2	8	359938	359945	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009712	AAAG	2	8	360225	360232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009712	AAAT	2	8	361697	361704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009712	GATG	2	8	364326	364333	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009712	CCGC	2	8	371534	371541	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_009712	AGGC	2	8	371836	371843	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009712	GAAC	2	8	373942	373949	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009712	ACAT	2	8	375599	375606	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_009712	TAAT	2	8	377812	377819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_009712	TCGG	2	8	1344552	1344559	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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497	NC_009712	GTCA	2	8	1360974	1360981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_009712	GGTT	2	8	1366897	1366904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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