MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinomonas sp. MWYL1 chromosome

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009654	ATTTTA	2	12	11062	11073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009654	AAATCA	2	12	12196	12207	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009654	AACTTG	2	12	17664	17675	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009654	ATCTGT	2	12	17883	17894	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009654	AAACGT	2	12	29815	29826	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_009654	ATTGTC	2	12	55795	55806	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_009654	CCAACC	2	12	58938	58949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009654	ATGTCC	2	12	59104	59115	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009654	CGCTAT	2	12	59534	59545	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009654	TAAACG	2	12	83053	83064	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009654	ATTGCT	2	12	110675	110686	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009654	TTTTCG	2	12	154460	154471	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009654	CTGATG	2	12	161135	161146	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009654	CGGTTG	2	12	165787	165798	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009654	GCGTTG	2	12	165980	165991	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_009654	TTATAA	2	12	178895	178906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009654	TGCTTT	2	12	205094	205105	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009654	TTTTAT	2	12	221159	221170	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009654	GAAATA	2	12	231819	231830	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009654	CATTTA	2	12	232238	232249	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009654	TGATTT	2	12	301843	301854	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009654	TTAATT	2	12	326771	326782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009654	TTGAGA	2	12	387421	387432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009654	ATCATT	2	12	405444	405455	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009654	CAAAAA	2	12	406164	406175	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_009654	TTTTAA	2	12	486860	486871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009654	TCGTCA	2	12	518035	518046	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009654	CAAGAT	2	12	553820	553831	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009654	TGGTAT	2	12	620779	620790	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009654	GAAGGG	2	12	628885	628896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009654	GCAAGA	2	12	644357	644368	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009654	AAATAG	2	12	760298	760309	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009654	ATGAAA	2	12	767943	767954	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009654	ACCAAA	2	12	864974	864985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009654	AAACCA	2	12	865030	865041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009654	ACCAAA	2	12	865084	865095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009654	ACCAAA	2	12	865137	865148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009654	GGTTTT	2	12	904318	904329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009654	AATAAA	2	12	977658	977669	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009654	GTAAAA	2	12	1064667	1064678	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009654	GTAATG	2	12	1125466	1125477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009654	TTGCTT	2	12	1159434	1159445	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009654	CCTTAT	2	12	1191987	1191998	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009654	TGAAAT	2	12	1195001	1195012	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009654	CTATGT	2	12	1225443	1225454	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009654	GAGGCC	2	12	1252496	1252507	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009654	TTGAAC	2	12	1266624	1266635	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009654	CCGGTG	2	12	1267068	1267079	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009654	TTTTAA	2	12	1293404	1293415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009654	TTAAAG	2	12	1321541	1321552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009654	AATGAG	2	12	1326401	1326412	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009654	AAGCGA	2	12	1333038	1333049	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009654	TTTTAG	2	12	1336282	1336293	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009654	CAGATG	2	12	1366587	1366598	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009654	TCTTTA	2	12	1372440	1372451	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_009654	TATGTC	2	12	1424213	1424224	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009654	GATTGT	2	12	1466486	1466497	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009654	CCTTAT	2	12	1486513	1486524	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009654	TGAAAT	2	12	1489527	1489538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009654	TTTTTA	2	12	1500826	1500837	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009654	GTTTGC	2	12	1558793	1558804	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009654	AAGGGG	2	12	1573524	1573535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009654	TTAATG	2	12	1648216	1648227	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009654	AGAGCA	2	12	1653610	1653621	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009654	ATTGAG	2	12	1658002	1658013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009654	AGTTTA	2	12	1658122	1658133	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009654	AAAGCA	2	12	1664884	1664895	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_009654	CTTACA	2	12	1715801	1715812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009654	AATGCC	2	12	1729051	1729062	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009654	AAAATA	2	12	1761302	1761313	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009654	ACTTTT	2	12	1786748	1786759	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_009654	ATAAAA	2	12	1800746	1800757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009654	ATTAAT	2	12	1824958	1824969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009654	TTTTCG	2	12	1864085	1864096	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009654	CTCTTC	2	12	1876116	1876127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009654	ATTTAA	2	12	1966499	1966510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009654	AAATGA	2	12	1979731	1979742	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009654	AAATAA	2	12	2001597	2001608	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009654	TTAGCG	2	12	2014365	2014376	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009654	GATATA	2	12	2053041	2053052	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009654	AAAAAT	2	12	2116942	2116953	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009654	AAATCA	2	12	2133638	2133649	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_009654	TAAAAA	2	12	2153724	2153735	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009654	CTTGAT	2	12	2213829	2213840	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_009654	AGTAAA	2	12	2244629	2244640	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009654	GAATGT	2	12	2250012	2250023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009654	ATTGTT	2	12	2258625	2258636	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009654	TAGATA	2	12	2261557	2261568	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009654	TTACTG	2	12	2265094	2265105	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_009654	TTAAAA	2	12	2352100	2352111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009654	TGATAT	2	12	2372677	2372688	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009654	TGACCT	2	12	2522524	2522535	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009654	GTATAT	2	12	2527405	2527416	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009654	TAGTGT	2	12	2567832	2567843	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009654	ATTTCA	2	12	2631579	2631590	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_009654	ATAAGG	2	12	2634451	2634462	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009654	CAAAAA	2	12	2719452	2719463	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_009654	CAGCCG	2	12	2730554	2730565	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009654	AGCAAA	2	12	2770317	2770328	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009654	TTAATA	2	12	2796775	2796786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009654	TCAATG	2	12	2799398	2799409	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_009654	CATATA	2	12	2803908	2803919	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_009654	AGAAAA	2	12	2843358	2843369	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009654	ATAGAT	2	12	2918734	2918745	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009654	AACCTT	2	12	2927638	2927649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009654	GTTAAT	2	12	2936767	2936778	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009654	GGCTAG	2	12	3036123	3036134	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009654	TAAAAC	2	12	3107990	3108001	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_009654	TAAAAA	2	12	3108026	3108037	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009654	AATGAA	2	12	3120151	3120162	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009654	TATTTA	2	12	3128190	3128201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009654	ACAAAA	2	12	3196195	3196206	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009654	CATTAA	2	12	3209400	3209411	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_009654	ATAAGG	2	12	3215150	3215161	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009654	ACAAAA	2	12	3275314	3275325	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_009654	TCCTTT	2	12	3324512	3324523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009654	CAGCCC	2	12	3330385	3330396	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_009654	AATATC	2	12	3339158	3339169	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009654	TTAAAA	2	12	3354680	3354691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009654	CCCCTT	2	12	3357315	3357326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_009654	ATTGTT	2	12	3409715	3409726	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009654	GTACCT	2	12	3428882	3428893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009654	ATAAAA	2	12	3452551	3452562	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009654	CTTATT	2	12	3536956	3536967	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_009654	ATATCT	2	12	3549572	3549583	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_009654	TAAAAA	2	12	3551909	3551920	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.