MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanococcus maripaludis C7 chromosome

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009637	TAATTT	2	12	67	78	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009637	ATTGGG	2	12	22217	22228	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009637	CTTTTT	2	12	28564	28575	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009637	TAATTA	2	12	37243	37254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009637	TAAAAA	2	12	45178	45189	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009637	TAATTT	2	12	50727	50738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009637	TTGCAA	2	12	55101	55112	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009637	GTATAT	2	12	80925	80936	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009637	TAATGC	2	12	85591	85602	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009637	TGTATT	2	12	90206	90217	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009637	TCACGC	2	12	90983	90994	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009637	AATTTA	2	12	92420	92431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009637	TATAAA	2	12	103144	103155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009637	TTTTTA	2	12	105576	105587	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009637	TTATAT	2	12	114090	114101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009637	TAAAAT	2	12	125285	125296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009637	TTCGAT	2	12	137879	137890	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009637	CCAAAA	2	12	145754	145765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009637	TTTTTA	2	12	150181	150192	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009637	TTAAAA	2	12	158110	158121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009637	CTTTTT	2	12	158725	158736	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_009637	ATTTTT	2	12	213037	213048	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009637	TTATAA	2	12	243553	243564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009637	AATAAA	2	12	243790	243801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009637	TCTGCA	2	12	249420	249431	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009637	ATAGAT	2	12	289344	289355	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009637	AGCAAA	2	12	292321	292332	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009637	ATTTAT	2	12	293110	293121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009637	TAAAAA	2	12	298125	298136	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009637	AATAAA	2	12	300711	300722	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009637	ATCTAA	2	12	300751	300762	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009637	ATTTCA	2	12	349744	349755	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009637	AAAAAT	2	12	355777	355788	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009637	AAATTA	2	12	359009	359020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009637	AAAATA	2	12	378916	378927	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009637	ATTTTT	2	12	395301	395312	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009637	AAATAC	2	12	406072	406083	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009637	AAAATT	2	12	406970	406981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009637	TTTATC	2	12	408705	408716	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009637	CTAATT	2	12	409019	409030	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009637	TTAAAA	2	12	412048	412059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009637	TAAAAA	2	12	412186	412197	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009637	TAAATA	2	12	423261	423272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009637	TAAAAT	2	12	423278	423289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009637	TTTAAA	2	12	440713	440724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009637	TGAAAT	2	12	441129	441140	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009637	TTTAAA	2	12	445031	445042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009637	AAAATT	2	12	449965	449976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009637	TTAAAT	2	12	477634	477645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009637	ATTTAA	2	12	486588	486599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009637	ATAATT	2	12	529579	529590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009637	TTTAAA	2	12	539202	539213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009637	ATCAAT	2	12	576352	576363	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009637	AAAATA	2	12	597336	597347	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009637	AATTTA	2	12	600052	600063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009637	ATATTA	2	12	607337	607348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009637	TAATTA	2	12	615100	615111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009637	ATATAG	2	12	621260	621271	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009637	TATTTT	2	12	621305	621316	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009637	TTTTAA	2	12	627217	627228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009637	AAAATA	2	12	638182	638193	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009637	AATAAA	2	12	645896	645907	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009637	CTAAAA	2	12	651770	651781	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_009637	TAAAAA	2	12	662944	662955	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009637	CTTATT	2	12	674006	674017	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009637	TCTACC	2	12	769111	769122	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009637	TAAAAT	2	12	815834	815845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009637	TAAAAA	2	12	819980	819991	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009637	AAAATT	2	12	854046	854057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009637	ACCCCC	2	12	854627	854638	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
71	NC_009637	GCAGGG	2	12	893727	893738	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_009637	TAAAAA	2	12	895586	895597	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009637	TAAAAT	2	12	949219	949230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009637	CCTACG	2	12	958160	958171	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009637	AAGGCC	2	12	959083	959094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009637	CCTACG	2	12	963200	963211	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009637	AAGGCC	2	12	964123	964134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009637	CCTACG	2	12	995427	995438	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009637	AAGGCC	2	12	996430	996441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009637	TTTTAA	2	12	1004785	1004796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009637	ATTTTA	2	12	1005767	1005778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009637	ATTTTA	2	12	1005978	1005989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009637	ATTTTA	2	12	1006164	1006175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009637	AATTAA	2	12	1096236	1096247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009637	ATTTAA	2	12	1114826	1114837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009637	TAAAAA	3	18	1151886	1151903	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009637	TTTAAA	2	12	1158194	1158205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009637	ATATTT	2	12	1159129	1159140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009637	TGTTTA	2	12	1164597	1164608	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009637	CATTCC	2	12	1173944	1173955	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009637	ATGGAA	2	12	1174136	1174147	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009637	GAAACT	2	12	1174969	1174980	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_009637	CAAGTT	2	12	1174988	1174999	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009637	AAGTTC	2	12	1175151	1175162	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_009637	TTTGAT	2	12	1181827	1181838	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009637	ATAAAT	2	12	1194228	1194239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009637	AAAAAT	2	12	1201212	1201223	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009637	TTGTTT	2	12	1207248	1207259	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009637	ATAATT	2	12	1224304	1224315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009637	TTTTAT	2	12	1252087	1252098	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009637	AATTAA	2	12	1252818	1252829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009637	TTAAAA	2	12	1264471	1264482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009637	TTTAAA	2	12	1266982	1266993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009637	ATTTGA	2	12	1272036	1272047	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009637	TTTTAA	2	12	1296436	1296447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009637	ATAAAA	2	12	1307839	1307850	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009637	CTTTTT	2	12	1346431	1346442	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009637	TTAATT	2	12	1346540	1346551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009637	TATAAA	2	12	1394198	1394209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009637	TTAATT	2	12	1404078	1404089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009637	ATTTTT	2	12	1412226	1412237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009637	ATAAAA	2	12	1414364	1414375	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009637	AATATA	2	12	1421149	1421160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009637	ATCTTC	2	12	1429983	1429994	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009637	TAATTA	2	12	1435145	1435156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009637	AAATAT	2	12	1457826	1457837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009637	AACCAA	2	12	1465528	1465539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009637	TTTTAA	2	12	1491211	1491222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009637	TTATAT	2	12	1491347	1491358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009637	AATTTG	2	12	1492101	1492112	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009637	ATTTAT	2	12	1534129	1534140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009637	TAATTT	2	12	1538725	1538736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009637	AAAATT	2	12	1551971	1551982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009637	TAAAAT	2	12	1570089	1570100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009637	AGTTTA	2	12	1597033	1597044	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009637	AATCCA	2	12	1598896	1598907	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009637	TTAAAA	2	12	1599519	1599530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009637	TTAATC	2	12	1602614	1602625	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_009637	TTATAA	2	12	1637918	1637929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009637	ATTTTA	2	12	1645494	1645505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009637	AAAAAT	2	12	1673445	1673456	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009637	ATAAAA	2	12	1677984	1677995	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009637	AATTTT	2	12	1710347	1710358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009637	GTTGCT	2	12	1713171	1713182	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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136	NC_009637	AAAATA	2	12	1714843	1714854	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_009637	TTTAAA	2	12	1753322	1753333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009637	TTTTAA	2	12	1754237	1754248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.