MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanococcus aeolicus Nankai-3 chromosome

Total Repeats: 541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009635	TTATA	2	10	4025	4034	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009635	TAATA	2	10	4092	4101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009635	TAATA	2	10	8914	8923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009635	TATAA	2	10	8988	8997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009635	TAAAA	2	10	15210	15219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009635	ATTAA	2	10	15503	15512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009635	ATTTT	2	10	16135	16144	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009635	TATAT	2	10	16179	16188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009635	ATTTT	2	10	17520	17529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009635	ATTTT	2	10	17536	17545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009635	TTTTA	2	10	18255	18264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009635	TTTTA	2	10	19173	19182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009635	GTATT	2	10	19223	19232	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009635	ATTAT	2	10	19296	19305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009635	ATATA	2	10	21706	21715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009635	AATAA	2	10	21734	21743	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009635	TATAT	2	10	25506	25515	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009635	GATAT	2	10	29690	29699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009635	ATATT	2	10	32575	32584	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009635	TTTAT	2	10	32698	32707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009635	TATAT	2	10	42544	42553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009635	TATAT	2	10	42559	42568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009635	AGCGA	2	10	43944	43953	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009635	AGCGA	2	10	44002	44011	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009635	ATTAT	2	10	46830	46839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009635	TAAAA	2	10	47050	47059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009635	CAAAT	2	10	48369	48378	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009635	AATAA	2	10	48572	48581	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009635	TATAA	2	10	57439	57448	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009635	ATTTT	2	10	57476	57485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009635	TAATA	2	10	58712	58721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009635	TTTAT	2	10	60293	60302	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009635	TAAAA	2	10	63933	63942	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009635	CTATA	2	10	68138	68147	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009635	ATATT	2	10	72966	72975	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009635	GATAG	2	10	76051	76060	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009635	TATTT	2	10	76751	76760	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009635	AATAT	2	10	78933	78942	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009635	ATTAA	2	10	78968	78977	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009635	AATTA	2	10	80735	80744	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009635	ATTTA	2	10	82851	82860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009635	TAAAA	2	10	84104	84113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009635	AAATA	2	10	89300	89309	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009635	TATTT	2	10	89469	89478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009635	ATTAA	2	10	89683	89692	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009635	ATATA	2	10	90917	90926	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009635	GAAAA	2	10	92299	92308	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009635	TAATT	2	10	94695	94704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009635	ATTTT	2	10	99857	99866	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009635	TATTT	2	10	105568	105577	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009635	CATAC	2	10	108849	108858	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009635	TATTT	2	10	110082	110091	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009635	ATTTT	2	10	110132	110141	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009635	TATAT	2	10	110142	110151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009635	TTTTC	2	10	114703	114712	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_009635	TTTTC	2	10	114774	114783	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009635	CTGTT	2	10	115151	115160	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009635	TATTT	2	10	116298	116307	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009635	TAATA	2	10	122608	122617	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009635	ATATA	2	10	140438	140447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009635	TATAT	2	10	142044	142053	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009635	TATTT	2	10	143186	143195	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009635	ATATA	2	10	144364	144373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009635	GATAA	2	10	145050	145059	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009635	TTATA	2	10	155449	155458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009635	ATTTT	2	10	161266	161275	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009635	AAATT	2	10	163445	163454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009635	TTCGC	2	10	165981	165990	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_009635	TATAT	2	10	168928	168937	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009635	TTTAA	2	10	170489	170498	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009635	TCAAA	2	10	170537	170546	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009635	TAATA	2	10	173172	173181	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009635	TAGAA	2	10	179140	179149	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009635	TAAAT	2	10	180177	180186	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009635	ATTAT	2	10	182786	182795	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009635	ATGTT	2	10	185302	185311	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009635	TACAA	2	10	185343	185352	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009635	AAGCT	2	10	185506	185515	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009635	TACTA	2	10	189086	189095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009635	TTTAT	2	10	192765	192774	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009635	AAATA	2	10	194503	194512	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009635	ATGTT	2	10	194643	194652	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009635	ATTTT	2	10	195486	195495	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009635	TAGAT	2	10	196485	196494	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009635	TTTAA	2	10	198699	198708	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009635	TAAAT	2	10	199455	199464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009635	ATTTA	2	10	200970	200979	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009635	TAAAT	2	10	200982	200991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009635	TAAAT	3	15	214482	214496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009635	ATATG	2	10	217278	217287	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009635	TAAAA	2	10	217473	217482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009635	TTTTA	2	10	230474	230483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009635	TATAT	2	10	232307	232316	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009635	ATTAT	2	10	235145	235154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009635	ATATA	2	10	239418	239427	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009635	ATTTT	2	10	245189	245198	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009635	TTAAT	2	10	248690	248699	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009635	AATTT	2	10	248717	248726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009635	ATTTC	2	10	248752	248761	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009635	TGGAG	2	10	250535	250544	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009635	ATTTT	2	10	250734	250743	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009635	ATTAT	2	10	262653	262662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009635	GAAAG	2	10	262982	262991	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009635	CATAT	2	10	264181	264190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009635	TATAA	2	10	269646	269655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009635	TAATA	2	10	274151	274160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009635	AATAA	2	10	274184	274193	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009635	TATAA	2	10	282076	282085	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009635	CATTA	2	10	282837	282846	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009635	ATATT	2	10	295257	295266	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009635	TAAAT	2	10	299370	299379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009635	TTATA	5	25	299745	299769	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009635	TTTAT	2	10	301706	301715	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009635	GTAGT	2	10	303784	303793	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009635	TTAAT	2	10	305899	305908	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009635	TTATT	2	10	308344	308353	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009635	TAATA	2	10	309382	309391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009635	ATTTT	2	10	311458	311467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009635	TAATA	2	10	311570	311579	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009635	ATATA	2	10	314506	314515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009635	TAATA	2	10	314519	314528	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009635	TATTT	2	10	315263	315272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009635	AGCGA	2	10	319599	319608	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009635	TATAT	2	10	319748	319757	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009635	AAATA	2	10	323763	323772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009635	TATAT	2	10	331472	331481	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009635	TAATT	2	10	336158	336167	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009635	TTATT	2	10	341047	341056	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009635	ATATA	2	10	345101	345110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009635	TATAA	2	10	348157	348166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009635	ATAAA	2	10	349220	349229	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009635	TTTTA	3	15	352032	352046	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009635	GTAAT	2	10	356177	356186	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009635	AGTGT	2	10	356438	356447	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009635	TAATT	2	10	362792	362801	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009635	ATATA	2	10	367452	367461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009635	ATTAT	2	10	367530	367539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009635	TATAA	2	10	368904	368913	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009635	AATTT	2	10	370691	370700	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009635	ATATA	2	10	371681	371690	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009635	ATTAT	2	10	376955	376964	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009635	ATAAA	2	10	379141	379150	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009635	AAAAT	2	10	388467	388476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009635	TATTT	2	10	392885	392894	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009635	TAAAT	2	10	397376	397385	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009635	CGCTC	2	10	397452	397461	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
147	NC_009635	AATGA	2	10	397800	397809	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009635	AAATG	2	10	397835	397844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009635	TTATA	2	10	414395	414404	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009635	GTGTT	2	10	418648	418657	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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