MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanococcus aeolicus Nankai-3 chromosome

Total Repeats: 1066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009635	TAAA	2	8	53	60	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009635	TTAA	2	8	2601	2608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009635	ATTA	2	8	7144	7151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009635	ATTA	2	8	8859	8866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009635	TAAT	2	8	9039	9046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009635	CTAT	2	8	9096	9103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009635	TTAT	2	8	10692	10699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009635	TATT	2	8	10771	10778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009635	ATGT	2	8	10789	10796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009635	TGTC	2	8	15345	15352	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009635	TTTA	2	8	18274	18281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009635	TAAT	2	8	19274	19281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009635	TAAT	2	8	19284	19291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009635	ATAA	2	8	24524	24531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009635	TAAA	2	8	24947	24954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009635	TTTA	2	8	26865	26872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009635	TAAT	2	8	26922	26929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009635	ATTT	2	8	26939	26946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009635	AAAT	2	8	36298	36305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009635	TAAA	2	8	36459	36466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009635	TAAT	2	8	40518	40525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009635	AGTA	2	8	40613	40620	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009635	AGGG	2	8	41728	41735	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009635	TTAT	2	8	43073	43080	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009635	CTTT	2	8	43212	43219	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009635	TGAT	2	8	43496	43503	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009635	CTAC	2	8	43551	43558	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009635	CTAA	2	8	43914	43921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009635	TAAA	2	8	45521	45528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009635	ATAA	2	8	46809	46816	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009635	TATT	2	8	47089	47096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009635	ATTT	3	12	48545	48556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009635	ATTA	2	8	53231	53238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009635	GTTT	2	8	57244	57251	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009635	TTAT	2	8	57487	57494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009635	TTAT	2	8	58201	58208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009635	ATTA	2	8	58277	58284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009635	TTTA	2	8	58553	58560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009635	TATT	2	8	62499	62506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009635	TATT	2	8	62509	62516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009635	ATTT	2	8	63181	63188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009635	TAAT	2	8	63992	63999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009635	AATT	2	8	64065	64072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009635	TAAC	2	8	64623	64630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009635	AGAA	2	8	64650	64657	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009635	TAAA	2	8	65430	65437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009635	AATA	2	8	65559	65566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009635	ATAA	2	8	65569	65576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009635	TATC	2	8	65607	65614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009635	AAAC	2	8	68154	68161	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009635	AATT	2	8	68924	68931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009635	AATT	2	8	72927	72934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009635	AATT	2	8	72944	72951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009635	AAAT	2	8	78736	78743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009635	TACA	2	8	78838	78845	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009635	ACCT	2	8	80840	80847	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009635	ATTT	2	8	81636	81643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009635	AAAT	2	8	82065	82072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009635	AATA	2	8	82082	82089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009635	AACA	2	8	82181	82188	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009635	TTAA	2	8	82933	82940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009635	TATT	2	8	82974	82981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009635	TAAT	2	8	83938	83945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009635	ATTA	2	8	84040	84047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009635	ATTA	2	8	84086	84093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009635	AAAT	2	8	89406	89413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009635	ATTA	2	8	91009	91016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009635	AAAG	2	8	91019	91026	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009635	AATA	2	8	91098	91105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009635	TCCG	2	8	92374	92381	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009635	TATT	2	8	93248	93255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009635	GAAC	2	8	93540	93547	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009635	TAAA	2	8	93619	93626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009635	ATTT	2	8	94610	94617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009635	GTAT	2	8	107013	107020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009635	CGGA	2	8	108862	108869	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009635	TAAT	2	8	109475	109482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009635	AATT	2	8	109600	109607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009635	GGTA	2	8	110055	110062	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009635	ATTT	2	8	110746	110753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009635	CTTT	2	8	114931	114938	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009635	AAAT	2	8	121236	121243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009635	ATTT	2	8	126296	126303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009635	TAAT	2	8	129940	129947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009635	ATAA	2	8	129948	129955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009635	AAAT	2	8	134496	134503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009635	TAAT	2	8	138359	138366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009635	TAAT	2	8	141843	141850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009635	TTAT	2	8	142064	142071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009635	TAAA	2	8	143149	143156	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009635	TTAA	2	8	143178	143185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009635	ATTA	2	8	155363	155370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009635	ATTT	2	8	156108	156115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009635	TAAA	2	8	157835	157842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009635	ACTA	2	8	157907	157914	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009635	ATAA	2	8	160025	160032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009635	ATAA	2	8	160035	160042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009635	ATAA	2	8	161295	161302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009635	TAAT	2	8	164533	164540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009635	TAAT	2	8	164573	164580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009635	TAAA	2	8	168754	168761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009635	TATT	2	8	172165	172172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009635	AATT	2	8	172220	172227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009635	ACAA	2	8	175689	175696	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009635	TACC	2	8	177006	177013	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009635	ATTA	2	8	177159	177166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009635	ATTA	2	8	177169	177176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009635	TATG	2	8	180796	180803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009635	TAAT	2	8	182251	182258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009635	GTTC	2	8	185326	185333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009635	TTAA	2	8	185647	185654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009635	TATG	2	8	188595	188602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009635	ATTT	2	8	192791	192798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009635	ATAA	2	8	194736	194743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009635	TATG	2	8	195151	195158	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009635	ATAA	2	8	195159	195166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009635	TGTA	2	8	195470	195477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009635	TTAT	2	8	195478	195485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009635	AAAT	2	8	196200	196207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009635	AAAT	2	8	196293	196300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009635	AACA	2	8	196323	196330	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009635	TATT	2	8	196840	196847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009635	ATTT	2	8	197689	197696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009635	TATC	2	8	197708	197715	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009635	TTAT	2	8	198723	198730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009635	ATTT	2	8	199245	199252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009635	ATAA	2	8	204175	204182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009635	TAAA	2	8	204620	204627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009635	ATGG	2	8	206488	206495	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009635	AATT	2	8	209520	209527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009635	ATAA	2	8	210807	210814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009635	ATAA	2	8	210822	210829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009635	AATA	2	8	214503	214510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009635	TTAT	2	8	215006	215013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009635	TTAT	2	8	215955	215962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009635	GATA	2	8	216214	216221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009635	ATTT	2	8	217308	217315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009635	TAAA	2	8	221131	221138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009635	ATTT	2	8	221146	221153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009635	ATGT	2	8	225783	225790	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009635	TAAT	2	8	227167	227174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009635	ATTA	2	8	227328	227335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009635	TTAT	2	8	227447	227454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009635	TATT	2	8	230244	230251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009635	ATTA	2	8	230392	230399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009635	CATG	2	8	231416	231423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009635	TTAA	2	8	232290	232297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009635	TTTA	2	8	234124	234131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009635	TATT	2	8	235085	235092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009635	GTTC	2	8	235205	235212	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_009635	TTTC	2	8	235251	235258	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_009635	CGAA	2	8	237658	237665	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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