MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 8600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009525	TTG	2	6	3203619	3203624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_009525	CTC	3	9	3204202	3204210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_009525	TCG	2	6	3204227	3204232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_009525	CTC	3	9	3204255	3204263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_009525	TCG	2	6	3204280	3204285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_009525	CTC	3	9	3204308	3204316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_009525	TCG	2	6	3204333	3204338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_009525	AGC	2	6	3204348	3204353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_009525	CTC	2	6	3205155	3205160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_009525	CAC	2	6	3205181	3205186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_009525	CAA	2	6	3205253	3205258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_009525	GCCG	2	8	3205265	3205272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6013	NC_009525	AGGCC	2	10	3205273	3205282	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6014	NC_009525	CAA	2	6	3205317	3205322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_009525	GTTCT	2	10	3205333	3205342	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6016	NC_009525	GTT	2	6	3211998	3212003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_009525	GGA	2	6	3212057	3212062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_009525	CCG	2	6	3212078	3212083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_009525	CCG	2	6	3212153	3212158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_009525	AGT	2	6	3212174	3212179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_009525	CGA	2	6	3212225	3212230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_009525	GCG	3	9	3212248	3212256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_009525	TCCC	2	8	3214019	3214026	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6024	NC_009525	GCCG	2	8	3214029	3214036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6025	NC_009525	GTC	2	6	3214148	3214153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_009525	GGC	2	6	3214201	3214206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_009525	GAAG	2	8	3214311	3214318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_009525	CGC	2	6	3216326	3216331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_009525	TCC	2	6	3217228	3217233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_009525	GACCC	2	10	3217240	3217249	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6031	NC_009525	CGA	2	6	3220382	3220387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_009525	TCA	2	6	3220457	3220462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_009525	GGC	2	6	3220517	3220522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_009525	CAT	2	6	3220540	3220545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_009525	CGAC	3	12	3223741	3223752	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6036	NC_009525	CA	3	6	3223758	3223763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_009525	GGC	2	6	3225871	3225876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_009525	C	6	6	3226281	3226286	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6039	NC_009525	GGT	2	6	3226300	3226305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_009525	GCA	2	6	3226343	3226348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_009525	GGC	2	6	3226349	3226354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_009525	ACC	2	6	3226369	3226374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6043	NC_009525	GACA	2	8	3226377	3226384	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6044	NC_009525	GGT	2	6	3226438	3226443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_009525	CG	3	6	3226506	3226511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_009525	GCC	2	6	3226570	3226575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_009525	CGGG	2	8	3229678	3229685	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6048	NC_009525	ACC	2	6	3229718	3229723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_009525	GGC	2	6	3229725	3229730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_009525	GTC	2	6	3229748	3229753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_009525	GCC	2	6	3229766	3229771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_009525	CAT	2	6	3231238	3231243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_009525	CTG	2	6	3231256	3231261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_009525	CGC	2	6	3233723	3233728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_009525	CG	3	6	3235547	3235552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_009525	CCG	2	6	3236679	3236684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_009525	CCA	2	6	3238342	3238347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_009525	GGTT	2	8	3242703	3242710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_009525	GAC	2	6	3244547	3244552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_009525	GTT	2	6	3244576	3244581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_009525	GCG	2	6	3244582	3244587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_009525	GCC	2	6	3244593	3244598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_009525	TCA	2	6	3244604	3244609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_009525	GCG	2	6	3244660	3244665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_009525	CG	3	6	3244670	3244675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_009525	CCA	2	6	3244686	3244691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_009525	GCG	2	6	3244716	3244721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_009525	CG	3	6	3244726	3244731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_009525	CCA	2	6	3244742	3244747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6070	NC_009525	GCG	2	6	3244772	3244777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_009525	CG	3	6	3244782	3244787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6072	NC_009525	CCA	2	6	3244798	3244803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_009525	GCG	2	6	3244828	3244833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_009525	CG	3	6	3244838	3244843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6075	NC_009525	CTT	2	6	3250494	3250499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_009525	GA	4	8	3250545	3250552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_009525	TGA	2	6	3251467	3251472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_009525	GCG	2	6	3251481	3251486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_009525	TCA	2	6	3251717	3251722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_009525	TGA	2	6	3251735	3251740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_009525	GCG	2	6	3251749	3251754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_009525	TCA	2	6	3251803	3251808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_009525	CCT	2	6	3253960	3253965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_009525	TGT	2	6	3253984	3253989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_009525	TGG	2	6	3254025	3254030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_009525	GT	3	6	3254036	3254041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_009525	CGA	2	6	3254061	3254066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_009525	CTG	2	6	3254095	3254100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_009525	CGG	2	6	3254121	3254126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_009525	CGT	2	6	3254143	3254148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_009525	ACCA	2	8	3255307	3255314	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6092	NC_009525	CGGCA	2	10	3255324	3255333	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6093	NC_009525	CAC	3	9	3255361	3255369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6094	NC_009525	ACG	2	6	3255382	3255387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_009525	CGCC	2	8	3255432	3255439	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6096	NC_009525	TGC	2	6	3255529	3255534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_009525	A	6	6	3255644	3255649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_009525	CCG	2	6	3288224	3288229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_009525	ATC	2	6	3288270	3288275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_009525	CAC	2	6	3288337	3288342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6101	NC_009525	CGA	2	6	3294745	3294750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_009525	ACG	2	6	3294856	3294861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_009525	C	6	6	3294868	3294873	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6104	NC_009525	GTT	2	6	3294969	3294974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_009525	TGC	2	6	3295063	3295068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_009525	ATT	2	6	3295099	3295104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_009525	CGC	2	6	3295156	3295161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_009525	GCG	2	6	3295166	3295171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_009525	CACAT	2	10	3295173	3295182	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6110	NC_009525	TGG	2	6	3295197	3295202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_009525	CTG	2	6	3295226	3295231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_009525	CGA	3	9	3299861	3299869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_009525	GTT	2	6	3299908	3299913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_009525	GC	3	6	3299931	3299936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_009525	GAT	2	6	3299967	3299972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_009525	ACG	2	6	3300122	3300127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_009525	CAA	2	6	3300218	3300223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_009525	CGC	2	6	3300226	3300231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6119	NC_009525	CTG	2	6	3300343	3300348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_009525	AGG	2	6	3300440	3300445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_009525	CCT	2	6	3303398	3303403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6122	NC_009525	TCGCCG	2	12	3303424	3303435	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_009525	CCT	2	6	3303455	3303460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6124	NC_009525	TCGCCG	2	12	3303481	3303492	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6125	NC_009525	TTC	2	6	3312564	3312569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_009525	CTTC	2	8	3314451	3314458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_009525	AG	3	6	3314472	3314477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_009525	GCTGC	2	10	3314484	3314493	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6129	NC_009525	CGCGA	2	10	3314546	3314555	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6130	NC_009525	GCTG	2	8	3314642	3314649	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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