MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome

Total Repeats: 348

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009515	AATTT	2	10	1729	1738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009515	ATTTT	2	10	3835	3844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009515	TTTAA	2	10	7871	7880	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009515	ATTAT	2	10	10156	10165	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009515	ATTAT	2	10	13019	13028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009515	CATTA	2	10	13824	13833	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009515	TTATT	2	10	16760	16769	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009515	GCAAT	2	10	19577	19586	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009515	TATAA	2	10	21339	21348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009515	ATTTT	2	10	22049	22058	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009515	AATTG	2	10	23078	23087	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009515	TATCA	2	10	31271	31280	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009515	ATATT	2	10	33366	33375	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009515	AATAT	2	10	34315	34324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009515	TATTT	2	10	49040	49049	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009515	AATTG	2	10	49066	49075	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009515	AATTA	2	10	69204	69213	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009515	AAATA	2	10	73132	73141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009515	TTTAA	2	10	85992	86001	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009515	TTAAA	2	10	97021	97030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009515	ATTTT	2	10	100704	100713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009515	ATATA	2	10	100820	100829	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009515	AAATA	2	10	104797	104806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009515	TAAAT	2	10	107454	107463	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009515	GTAAA	2	10	112633	112642	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009515	ATATT	2	10	123294	123303	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009515	AAATC	2	10	123792	123801	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009515	ATAAA	2	10	125158	125167	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009515	TAATA	2	10	130747	130756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009515	TAAAA	2	10	140212	140221	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009515	ATTAA	2	10	141923	141932	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009515	TGGGT	2	10	142008	142017	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009515	ATTCC	2	10	144169	144178	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009515	TCACT	2	10	153152	153161	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009515	ATTGC	2	10	154671	154680	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009515	TAAAA	2	10	155542	155551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009515	TTATT	2	10	166352	166361	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009515	AAATT	2	10	182654	182663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009515	TTAAT	2	10	184329	184338	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009515	ATTTA	2	10	186064	186073	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009515	TAATT	2	10	196870	196879	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009515	CTTTT	2	10	198005	198014	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_009515	CAATA	2	10	200250	200259	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009515	ATTAA	2	10	203436	203445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009515	ATTTA	2	10	209491	209500	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009515	TTTAA	2	10	209590	209599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009515	TAAAA	2	10	209747	209756	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009515	TAAAA	2	10	212744	212753	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009515	ATTAA	2	10	214181	214190	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009515	TTTTA	2	10	218604	218613	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009515	TTAAA	2	10	219930	219939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009515	ATTCA	2	10	231425	231434	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009515	TTAAT	2	10	235024	235033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009515	CTAAA	2	10	249128	249137	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009515	AAATA	2	10	255616	255625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009515	TTAAT	2	10	262890	262899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009515	ATTTT	2	10	265882	265891	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009515	ATTTT	2	10	268214	268223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009515	ATAAA	2	10	282993	283002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009515	TTATA	2	10	286437	286446	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009515	TTTGT	2	10	288868	288877	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009515	AAATA	2	10	289467	289476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009515	ATATT	2	10	289598	289607	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009515	ATAAA	2	10	318921	318930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009515	CAATT	2	10	319590	319599	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009515	AAAAT	2	10	320028	320037	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009515	AAAAT	2	10	320280	320289	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009515	AATTA	2	10	320327	320336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009515	TAAAT	2	10	321396	321405	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009515	AAATA	2	10	322073	322082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009515	ATTAG	2	10	323665	323674	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009515	ATAAA	2	10	329707	329716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009515	GAAAT	2	10	329763	329772	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009515	ACTGA	2	10	331014	331023	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009515	CAAGC	2	10	332969	332978	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_009515	ATATA	2	10	335442	335451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009515	AATAA	2	10	337531	337540	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009515	GGTTT	2	10	337580	337589	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009515	AATTT	2	10	337652	337661	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009515	TTAAT	2	10	344579	344588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009515	ATTTT	2	10	348738	348747	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009515	ACATA	2	10	348798	348807	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009515	ATTAT	2	10	364135	364144	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009515	TTAAT	2	10	365298	365307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009515	ATATA	2	10	374228	374237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009515	TTTAA	2	10	377649	377658	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009515	ATTAA	2	10	379041	379050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009515	AAAAT	2	10	379069	379078	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009515	CTTTT	2	10	381081	381090	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009515	TTTAA	2	10	381113	381122	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009515	TTTTA	2	10	395798	395807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009515	TTAGT	2	10	395878	395887	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009515	TAAAA	2	10	395995	396004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009515	AAAAT	2	10	397435	397444	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009515	AAATA	2	10	399354	399363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009515	AAAAC	2	10	408599	408608	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009515	CTTTT	2	10	411744	411753	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009515	ATATT	2	10	430045	430054	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009515	TAAAA	2	10	430154	430163	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009515	TATAA	2	10	431529	431538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009515	ATGAA	2	10	441139	441148	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009515	TAATT	2	10	443534	443543	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009515	TAAAT	2	10	448700	448709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009515	TAAAC	2	10	470406	470415	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009515	GAACA	2	10	479334	479343	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009515	CAATA	2	10	481138	481147	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009515	ATTTT	2	10	485990	485999	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009515	ATTTA	2	10	486136	486145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009515	TAAAT	2	10	486164	486173	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009515	TTTGT	2	10	505792	505801	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009515	TTTAA	2	10	508621	508630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009515	ACAAA	2	10	509543	509552	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_009515	TATAA	2	10	516101	516110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009515	GAAAT	2	10	516123	516132	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009515	GAAAT	2	10	516305	516314	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009515	ACTGA	2	10	517546	517555	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009515	CAAGC	2	10	519501	519510	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_009515	ATAAA	2	10	521918	521927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009515	CTTTT	2	10	523995	524004	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009515	ACAAA	2	10	536055	536064	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009515	AAGGG	2	10	554276	554285	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009515	ATGTT	2	10	554400	554409	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009515	ATTAA	2	10	554416	554425	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009515	ATTAA	2	10	564258	564267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009515	AAATA	2	10	564652	564661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009515	AATAA	2	10	564921	564930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009515	ATGTA	2	10	565876	565885	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009515	ATTTT	2	10	565896	565905	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009515	TTTAA	2	10	573221	573230	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009515	ATTAA	2	10	576486	576495	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009515	TATTT	2	10	596318	596327	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009515	TAATA	2	10	601776	601785	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009515	AAAAG	2	10	601881	601890	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009515	AGTTA	2	10	605104	605113	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009515	AAATT	2	10	605248	605257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009515	TAAAA	2	10	607098	607107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009515	AGTTA	2	10	607171	607180	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009515	TTAAA	2	10	613514	613523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009515	TTATT	2	10	613598	613607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009515	ATATA	2	10	615068	615077	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009515	AAATA	2	10	621041	621050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009515	TAAAA	2	10	621068	621077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009515	AAGAA	2	10	621215	621224	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009515	TAAAA	2	10	628127	628136	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009515	TAAAA	2	10	628153	628162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009515	TAATA	2	10	639193	639202	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009515	AATGA	2	10	640949	640958	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009515	TTAAA	2	10	641660	641669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009515	AAAAT	2	10	646295	646304	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.