MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma agalactiae PG2 chromosome

Total Repeats: 440

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009497	TAAT	2	8	2764	2771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009497	GAAG	2	8	2784	2791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009497	TCCC	2	8	3003	3010	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_009497	ATTT	2	8	3142	3149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009497	AATT	2	8	6212	6219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009497	TAAC	2	8	6305	6312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009497	GAAA	2	8	7075	7082	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009497	AAAT	2	8	10405	10412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009497	AAGA	2	8	13373	13380	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009497	TTTA	2	8	18006	18013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009497	TTAT	2	8	20448	20455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009497	ATTT	2	8	20456	20463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009497	ATTT	3	12	22870	22881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009497	TTAT	2	8	22927	22934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009497	CAGC	2	8	22982	22989	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009497	CATA	2	8	23054	23061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009497	GAAA	2	8	23102	23109	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009497	ACAA	2	8	29667	29674	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009497	TTAT	2	8	30697	30704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009497	ATTT	2	8	51228	51235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009497	TAAA	2	8	51236	51243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009497	AATT	2	8	51271	51278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009497	GCAA	2	8	51305	51312	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009497	CAAT	2	8	51374	51381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009497	ATTT	2	8	68219	68226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009497	GAAA	2	8	93062	93069	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009497	TGTA	2	8	94652	94659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009497	ATTT	2	8	95965	95972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009497	TGAA	2	8	99478	99485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009497	ATAA	2	8	99573	99580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009497	ATTC	2	8	104777	104784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009497	AATT	2	8	104798	104805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009497	ATTT	2	8	107166	107173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009497	AAAG	2	8	107376	107383	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009497	TTAA	2	8	111752	111759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009497	TAAT	2	8	111873	111880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009497	TTTA	2	8	112050	112057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009497	TTAC	2	8	112122	112129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009497	AAAG	2	8	112232	112239	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009497	GCTT	2	8	122127	122134	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009497	ATTT	2	8	122146	122153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009497	ATAA	2	8	122701	122708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009497	TTTA	2	8	123504	123511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009497	CTAA	2	8	127852	127859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009497	AATA	2	8	128079	128086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009497	AAAT	2	8	128234	128241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009497	CTTT	2	8	131920	131927	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009497	ATAA	2	8	135850	135857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009497	TAAA	3	12	146489	146500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009497	TAAT	2	8	152940	152947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009497	ACAA	2	8	153223	153230	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009497	TAAA	2	8	153577	153584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009497	TAAT	2	8	159611	159618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009497	TTAT	2	8	171073	171080	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009497	ATTA	2	8	171083	171090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009497	AAAT	2	8	172180	172187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009497	TTTA	2	8	172274	172281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009497	TTTG	3	12	172513	172524	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009497	TAAT	2	8	173586	173593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009497	AAAT	2	8	174880	174887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009497	TTCA	2	8	174922	174929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009497	TACT	2	8	182627	182634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009497	CAAA	2	8	184540	184547	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009497	AATA	2	8	184612	184619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009497	ATTA	2	8	184680	184687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009497	ATTT	2	8	184917	184924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009497	TTGT	2	8	185006	185013	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009497	ATGC	2	8	188716	188723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009497	TTAT	2	8	190338	190345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009497	ATAA	2	8	190472	190479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009497	ATAA	2	8	194468	194475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009497	TAAA	2	8	196136	196143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009497	GTAT	2	8	197646	197653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009497	TAAT	2	8	201264	201271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009497	TAAA	2	8	203167	203174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009497	TAAA	2	8	203985	203992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009497	ATTA	2	8	206723	206730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009497	TAAA	2	8	208227	208234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009497	TTTA	2	8	211882	211889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009497	ATTA	2	8	216596	216603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009497	AGTT	2	8	218584	218591	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009497	TATT	2	8	219015	219022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009497	TTTG	2	8	222102	222109	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009497	TGGT	2	8	222211	222218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009497	TAAA	2	8	222239	222246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009497	TTGC	2	8	222252	222259	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009497	TAAT	2	8	222444	222451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009497	ATAA	2	8	223692	223699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009497	CTTT	2	8	224266	224273	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009497	TTTA	2	8	224322	224329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009497	CATT	2	8	224793	224800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009497	TAAA	2	8	224900	224907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009497	TCTA	2	8	225936	225943	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009497	TAAA	2	8	228640	228647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009497	TTTG	2	8	228995	229002	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009497	ATTT	2	8	229667	229674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009497	TATT	2	8	233710	233717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009497	TAAA	2	8	234484	234491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009497	TTTA	2	8	234662	234669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009497	CTAA	2	8	234687	234694	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009497	AAAC	2	8	234954	234961	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009497	AATT	2	8	235031	235038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009497	ATTG	2	8	235112	235119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009497	TTCC	2	8	237303	237310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009497	ATTT	2	8	241872	241879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009497	TAAA	2	8	242238	242245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009497	TTAA	2	8	242264	242271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009497	TATT	2	8	248675	248682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009497	ATAA	2	8	248815	248822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009497	AATT	2	8	249350	249357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009497	TCAA	2	8	250153	250160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009497	TAAA	2	8	250247	250254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009497	AAAT	2	8	250352	250359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009497	TAAT	2	8	250435	250442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009497	GCCT	2	8	250806	250813	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009497	GTAG	2	8	251341	251348	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009497	TATT	2	8	253341	253348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009497	TAAA	2	8	258919	258926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009497	CATG	2	8	259116	259123	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009497	TCCC	2	8	259386	259393	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_009497	CTTT	2	8	259497	259504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009497	TTAA	2	8	266427	266434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009497	TATG	2	8	266462	266469	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009497	ATTT	2	8	266868	266875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009497	ATTT	2	8	274008	274015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009497	TATT	2	8	279713	279720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009497	TAGG	2	8	280879	280886	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009497	ATAA	2	8	280909	280916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009497	TGTT	2	8	282919	282926	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009497	TTAA	2	8	284008	284015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009497	TTAT	2	8	284359	284366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009497	TTAT	2	8	284412	284419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009497	TAAA	2	8	285044	285051	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009497	TAAA	2	8	285129	285136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009497	TTAA	2	8	299674	299681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009497	TTTA	2	8	303622	303629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009497	AAAT	2	8	304324	304331	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009497	TTTA	2	8	305886	305893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009497	TTAC	2	8	310233	310240	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009497	TTAT	2	8	311669	311676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009497	TAAA	2	8	313584	313591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009497	TATG	2	8	318254	318261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009497	ACAA	2	8	321055	321062	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009497	TTAT	2	8	324201	324208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009497	AATT	2	8	324272	324279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009497	ATTA	2	8	329331	329338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009497	CAAT	2	8	331409	331416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009497	AATT	2	8	333784	333791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009497	TAAA	2	8	338705	338712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009497	TTAG	2	8	338713	338720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_009497	ATTT	2	8	338776	338783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.