MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 5175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009440	ATA	2	6	1635435	1635440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_009440	TACA	2	8	1637195	1637202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4003	NC_009440	AAAC	2	8	1637234	1637241	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4004	NC_009440	A	6	6	1645237	1645242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_009440	TTG	2	6	1646053	1646058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_009440	ACTA	2	8	1646075	1646082	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4007	NC_009440	ATGAT	2	10	1646093	1646102	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_009440	AGT	3	9	1646128	1646136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_009440	TA	3	6	1646141	1646146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_009440	A	7	7	1648016	1648022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_009440	GTT	2	6	1648063	1648068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_009440	TA	4	8	1648085	1648092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_009440	TTA	2	6	1650195	1650200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_009440	GTG	2	6	1650233	1650238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_009440	TTA	2	6	1650290	1650295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_009440	ATA	2	6	1650382	1650387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_009440	AGT	2	6	1650481	1650486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_009440	CGG	2	6	1653337	1653342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_009440	CTTC	2	8	1653348	1653355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_009440	TAA	2	6	1653398	1653403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_009440	A	6	6	1653460	1653465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_009440	CTA	2	6	1653535	1653540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_009440	ATA	2	6	1653577	1653582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_009440	A	6	6	1653613	1653618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_009440	AG	3	6	1653622	1653627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_009440	TA	3	6	1653628	1653633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_009440	T	7	7	1656116	1656122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_009440	ATA	2	6	1656230	1656235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_009440	TTC	2	6	1657648	1657653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_009440	A	6	6	1660910	1660915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_009440	TGAG	2	8	1662395	1662402	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_009440	GTTG	2	8	1665557	1665564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_009440	TTTAC	2	10	1666020	1666029	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4034	NC_009440	GAA	2	6	1666112	1666117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_009440	AAT	2	6	1666293	1666298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_009440	TAA	2	6	1669049	1669054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_009440	GGT	2	6	1669238	1669243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_009440	TTA	2	6	1669265	1669270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_009440	TA	5	10	1669313	1669322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_009440	ATT	2	6	1669339	1669344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_009440	AT	3	6	1669347	1669352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_009440	TA	3	6	1669383	1669388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_009440	A	6	6	1669390	1669395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_009440	TAT	2	6	1669421	1669426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_009440	TAT	2	6	1669448	1669453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_009440	ACT	2	6	1669456	1669461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_009440	ATCT	2	8	1669483	1669490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4048	NC_009440	AAT	2	6	1670678	1670683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_009440	TCA	2	6	1671468	1671473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_009440	TTAG	2	8	1676723	1676730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_009440	AAAT	2	8	1676738	1676745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_009440	TAAA	2	8	1679147	1679154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_009440	TGA	2	6	1679187	1679192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_009440	AT	3	6	1679921	1679926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_009440	TCG	2	6	1679939	1679944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_009440	A	6	6	1679972	1679977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_009440	TCCCT	2	10	1680535	1680544	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4058	NC_009440	AT	3	6	1687164	1687169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_009440	TCA	2	6	1687487	1687492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_009440	TCA	2	6	1687513	1687518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_009440	TTA	2	6	1687536	1687541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_009440	GGA	2	6	1687611	1687616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_009440	ATA	3	9	1689951	1689959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_009440	TTC	2	6	1692857	1692862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_009440	AGT	2	6	1692876	1692881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_009440	CTTA	2	8	1692898	1692905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4067	NC_009440	CTG	2	6	1693001	1693006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_009440	ATG	2	6	1693030	1693035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_009440	GTG	2	6	1693079	1693084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_009440	ATA	2	6	1693091	1693096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_009440	CT	3	6	1697860	1697865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4072	NC_009440	GTCA	2	8	1698684	1698691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4073	NC_009440	ACA	2	6	1698753	1698758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_009440	TAA	2	6	1699966	1699971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_009440	CTT	2	6	1701413	1701418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_009440	CGGGGA	2	12	1701441	1701452	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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4079	NC_009440	CT	3	6	1701873	1701878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4080	NC_009440	CTC	2	6	1701898	1701903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4083	NC_009440	TTG	2	6	1702371	1702376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4086	NC_009440	AGT	2	6	1702501	1702506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_009440	TAGAG	2	10	1702509	1702518	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_009440	TCC	2	6	1704153	1704158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4089	NC_009440	C	6	6	1704227	1704232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4090	NC_009440	CCT	2	6	1704282	1704287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_009440	GTT	2	6	1704336	1704341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_009440	CT	3	6	1704378	1704383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4093	NC_009440	GATC	2	8	1704392	1704399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4094	NC_009440	TC	3	6	1704667	1704672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_009440	ATCT	2	8	1704713	1704720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_009440	CTC	2	6	1704724	1704729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_009440	CCA	2	6	1704752	1704757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_009440	CTC	2	6	1704842	1704847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4099	NC_009440	TCA	3	9	1704862	1704870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_009440	ATT	2	6	1704904	1704909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_009440	TCC	2	6	1704937	1704942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_009440	TC	3	6	1704964	1704969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_009440	CAT	2	6	1704986	1704991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_009440	ATT	2	6	1705021	1705026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_009440	T	6	6	1705025	1705030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_009440	ACC	2	6	1705082	1705087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4108	NC_009440	GAGTT	2	10	1705189	1705198	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_009440	TAA	2	6	1705208	1705213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4111	NC_009440	GTG	2	6	1705249	1705254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_009440	GGGAGC	2	12	1705571	1705582	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4113	NC_009440	GGA	2	6	1705717	1705722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_009440	G	6	6	1705729	1705734	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_009440	GCC	2	6	1705749	1705754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4117	NC_009440	ACC	2	6	1705943	1705948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_009440	TAG	2	6	1706026	1706031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4121	NC_009440	GAG	2	6	1706271	1706276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_009440	CGAG	2	8	1706329	1706336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4123	NC_009440	TC	3	6	1706361	1706366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_009440	GGA	2	6	1706407	1706412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_009440	AGG	2	6	1706413	1706418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_009440	CAA	2	6	1706592	1706597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_009440	CA	3	6	1706626	1706631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_009440	TCC	2	6	1706702	1706707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4129	NC_009440	G	6	6	1706712	1706717	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_009440	CTCTC	2	10	1706830	1706839	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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4132	NC_009440	ATC	2	6	1706866	1706871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4398	NC_009440	TGA	2	6	1781606	1781611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4399	NC_009440	TCC	2	6	1781656	1781661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4402	NC_009440	TCA	2	6	1781727	1781732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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