MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 5175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009440	AT	3	6	1367775	1367780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_009440	CAC	2	6	1368113	1368118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_009440	TG	3	6	1368136	1368141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_009440	TAAAA	2	10	1368173	1368182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_009440	GAA	2	6	1368220	1368225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_009440	CAG	2	6	1368254	1368259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_009440	GAT	2	6	1368279	1368284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_009440	CTTA	2	8	1368298	1368305	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_009440	A	6	6	1368346	1368351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_009440	AAGATA	2	12	1368849	1368860	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_009440	CGG	2	6	1368867	1368872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_009440	AAGA	2	8	1368935	1368942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_009440	AAGAA	2	10	1368948	1368957	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_009440	AAGG	2	8	1368986	1368993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_009440	A	6	6	1369460	1369465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_009440	TA	3	6	1369468	1369473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_009440	TA	4	8	1369508	1369515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_009440	TTTG	2	8	1369528	1369535	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_009440	GTT	2	6	1369560	1369565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_009440	TAGA	2	8	1369576	1369583	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_009440	AT	3	6	1369682	1369687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_009440	TAA	2	6	1372110	1372115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_009440	ATC	2	6	1372132	1372137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_009440	TTA	2	6	1372138	1372143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_009440	ACT	2	6	1372155	1372160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_009440	AAT	2	6	1373263	1373268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_009440	GAT	2	6	1373275	1373280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_009440	AAC	2	6	1373283	1373288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_009440	TTTAT	2	10	1373303	1373312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_009440	TAAA	2	8	1373314	1373321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_009440	CCT	2	6	1373342	1373347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_009440	TCA	3	9	1376013	1376021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_009440	TCAAA	2	10	1377865	1377874	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3534	NC_009440	TTC	2	6	1377885	1377890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3536	NC_009440	TTC	2	6	1378018	1378023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_009440	TC	3	6	1378043	1378048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_009440	GT	3	6	1378080	1378085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_009440	ATT	3	9	1378093	1378101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_009440	TTCTA	2	10	1378958	1378967	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3541	NC_009440	ATAA	2	8	1385879	1385886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_009440	AAT	2	6	1392287	1392292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_009440	TCT	2	6	1394662	1394667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_009440	GAA	2	6	1395147	1395152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_009440	A	7	7	1395169	1395175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_009440	AAT	2	6	1395182	1395187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_009440	T	6	6	1395207	1395212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_009440	AGA	2	6	1396337	1396342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_009440	AAAC	2	8	1396355	1396362	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3550	NC_009440	ACGG	2	8	1396483	1396490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3551	NC_009440	CTT	2	6	1396522	1396527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_009440	ACC	2	6	1396762	1396767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_009440	GGA	2	6	1396801	1396806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_009440	GT	3	6	1396873	1396878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_009440	CAA	2	6	1396888	1396893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_009440	TGTA	2	8	1396935	1396942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_009440	TAGC	2	8	1396978	1396985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3558	NC_009440	CTC	2	6	1397019	1397024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_009440	CAA	2	6	1397045	1397050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_009440	CT	3	6	1397058	1397063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3561	NC_009440	CCT	2	6	1397066	1397071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_009440	CGTCAC	2	12	1397098	1397109	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_009440	TTCCTA	2	12	1397125	1397136	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_009440	GTT	2	6	1397173	1397178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_009440	TAC	2	6	1397205	1397210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_009440	GAA	2	6	1397269	1397274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_009440	TC	3	6	1397284	1397289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3568	NC_009440	CTTT	2	8	1397386	1397393	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3569	NC_009440	TGT	2	6	1397425	1397430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_009440	GTT	2	6	1397441	1397446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_009440	TCT	3	9	1397540	1397548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_009440	TTG	2	6	1397571	1397576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_009440	TGA	2	6	1397605	1397610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_009440	TC	3	6	1397615	1397620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_009440	ATCC	2	8	1397736	1397743	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3579	NC_009440	TTAG	2	8	1404372	1404379	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_009440	ATGT	2	8	1404396	1404403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_009440	AAG	2	6	1404463	1404468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_009440	ACA	2	6	1404475	1404480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_009440	TGA	2	6	1405246	1405251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3587	NC_009440	AACA	2	8	1406476	1406483	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3588	NC_009440	TC	3	6	1406495	1406500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3589	NC_009440	TAG	2	6	1406553	1406558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3593	NC_009440	TCAG	2	8	1406661	1406668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3594	NC_009440	TA	3	6	1406688	1406693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3599	NC_009440	TAG	2	6	1407975	1407980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3601	NC_009440	ATA	2	6	1408028	1408033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_009440	GAC	2	6	1408100	1408105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_009440	T	6	6	1409199	1409204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_009440	TAT	2	6	1409236	1409241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_009440	TA	3	6	1409244	1409249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_009440	AT	3	6	1409251	1409256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_009440	AGA	2	6	1409272	1409277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3610	NC_009440	TAA	2	6	1409308	1409313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_009440	AAG	2	6	1409427	1409432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_009440	TATT	2	8	1409479	1409486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_009440	CAA	2	6	1410334	1410339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_009440	CAT	2	6	1410382	1410387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3616	NC_009440	TTA	2	6	1411286	1411291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3618	NC_009440	TTC	2	6	1411363	1411368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_009440	TGA	2	6	1411495	1411500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_009440	AAC	2	6	1415574	1415579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_009440	CTTA	2	8	1415644	1415651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3622	NC_009440	TGT	2	6	1418258	1418263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_009440	TAAG	2	8	1418353	1418360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_009440	ACAA	2	8	1421361	1421368	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_009440	GAA	3	9	1422184	1422192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_009440	A	6	6	1422209	1422214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_009440	ATTA	2	8	1424148	1424155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_009440	CTA	2	6	1424168	1424173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3630	NC_009440	T	6	6	1424194	1424199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_009440	AAT	2	6	1424290	1424295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3633	NC_009440	AGATG	2	10	1424368	1424377	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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