MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 5175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009440	AAG	2	6	1161953	1161958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_009440	TAA	2	6	1161969	1161974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_009440	ATG	2	6	1161984	1161989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_009440	GAA	2	6	1162002	1162007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_009440	AGG	2	6	1162008	1162013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_009440	TTG	2	6	1162081	1162086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_009440	AT	3	6	1162105	1162110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_009440	T	6	6	1162119	1162124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_009440	TC	3	6	1162184	1162189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3010	NC_009440	TTAG	2	8	1162217	1162224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_009440	AGTG	2	8	1162251	1162258	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_009440	A	7	7	1163268	1163274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_009440	TACAT	2	10	1163287	1163296	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3014	NC_009440	GCT	2	6	1163347	1163352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_009440	AAACA	2	10	1163467	1163476	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3016	NC_009440	CAA	2	6	1163519	1163524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_009440	CTT	2	6	1163601	1163606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_009440	AGGG	2	8	1164980	1164987	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_009440	TAA	2	6	1164997	1165002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_009440	TA	3	6	1165023	1165028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_009440	A	6	6	1165059	1165064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_009440	ATG	2	6	1165940	1165945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_009440	AAT	2	6	1165949	1165954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_009440	AT	3	6	1166011	1166016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_009440	GT	3	6	1166073	1166078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_009440	CAA	2	6	1171463	1171468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_009440	AGGA	2	8	1171470	1171477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_009440	AAG	2	6	1171488	1171493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_009440	TATTTT	2	12	1171544	1171555	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_009440	T	6	6	1171552	1171557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_009440	A	7	7	1171566	1171572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_009440	TAT	2	6	1174950	1174955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_009440	AGT	2	6	1174956	1174961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_009440	T	6	6	1174987	1174992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_009440	A	6	6	1175018	1175023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_009440	ATG	2	6	1175119	1175124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_009440	TAA	2	6	1175616	1175621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_009440	TAC	2	6	1175694	1175699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_009440	ATT	2	6	1175756	1175761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_009440	ATAAA	2	10	1175768	1175777	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_009440	A	7	7	1175775	1175781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_009440	ATT	2	6	1176068	1176073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_009440	ATAGA	2	10	1176112	1176121	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_009440	A	7	7	1176139	1176145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_009440	AT	4	8	1177714	1177721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_009440	CAT	2	6	1177726	1177731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_009440	TAAG	2	8	1177739	1177746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_009440	TAT	2	6	1177754	1177759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_009440	TAA	2	6	1177785	1177790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_009440	AG	4	8	1177807	1177814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_009440	TATAAT	2	12	1177844	1177855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_009440	ATA	2	6	1177877	1177882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_009440	ACA	3	9	1177886	1177894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_009440	GTA	2	6	1177942	1177947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_009440	AGT	2	6	1177980	1177985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_009440	AAT	2	6	1178019	1178024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_009440	TCA	2	6	1178124	1178129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_009440	TCC	2	6	1178156	1178161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_009440	TTA	2	6	1178544	1178549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_009440	TTA	2	6	1178576	1178581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_009440	AT	3	6	1178626	1178631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_009440	TTTA	2	8	1178646	1178653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_009440	TTAAA	2	10	1178708	1178717	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_009440	TGAG	2	8	1178821	1178828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_009440	CAAGG	2	10	1178947	1178956	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3066	NC_009440	A	6	6	1179064	1179069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_009440	TAC	2	6	1179089	1179094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_009440	AG	3	6	1180766	1180771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_009440	ACT	2	6	1180789	1180794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_009440	A	6	6	1180823	1180828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_009440	GAATA	2	10	1180844	1180853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_009440	CGA	2	6	1180965	1180970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_009440	TCA	2	6	1180977	1180982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3075	NC_009440	ATG	2	6	1181073	1181078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_009440	AGA	2	6	1181107	1181112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_009440	AAC	2	6	1181146	1181151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_009440	A	6	6	1181789	1181794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_009440	AAAAT	2	10	1181824	1181833	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_009440	ATC	2	6	1181842	1181847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_009440	CATT	2	8	1181933	1181940	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3082	NC_009440	CTGA	2	8	1181952	1181959	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3083	NC_009440	TCT	2	6	1181979	1181984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3085	NC_009440	GT	3	6	1182056	1182061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_009440	GAAT	2	8	1182272	1182279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_009440	TC	3	6	1183042	1183047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_009440	TAA	2	6	1183667	1183672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_009440	CAA	2	6	1183777	1183782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_009440	ATG	2	6	1183789	1183794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_009440	TAGT	2	8	1183904	1183911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_009440	TA	4	8	1184012	1184019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_009440	AATT	2	8	1184021	1184028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_009440	A	6	6	1184036	1184041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_009440	TA	3	6	1184062	1184067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_009440	GTA	2	6	1184123	1184128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_009440	ATT	2	6	1184136	1184141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_009440	TA	3	6	1184165	1184170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_009440	AATA	2	8	1184276	1184283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_009440	TCT	2	6	1184284	1184289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_009440	ATAA	2	8	1184310	1184317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_009440	ATT	2	6	1184319	1184324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_009440	TC	4	8	1184333	1184340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_009440	ATGTT	2	10	1184343	1184352	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_009440	TTAA	2	8	1187599	1187606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_009440	TGG	2	6	1187609	1187614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_009440	GAA	2	6	1187702	1187707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_009440	ACATGT	2	12	1188343	1188354	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3110	NC_009440	CT	3	6	1188376	1188381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_009440	AACT	2	8	1188520	1188527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3113	NC_009440	T	6	6	1188663	1188668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_009440	ATT	2	6	1188673	1188678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_009440	ACTT	2	8	1188746	1188753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3117	NC_009440	GAA	2	6	1195137	1195142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_009440	AGGT	2	8	1195186	1195193	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_009440	TAA	2	6	1195369	1195374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_009440	CA	3	6	1196198	1196203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_009440	TAA	2	6	1196223	1196228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_009440	TA	3	6	1196234	1196239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_009440	T	6	6	1197693	1197698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_009440	CTT	2	6	1200722	1200727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_009440	AG	3	6	1200781	1200786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_009440	GGA	2	6	1200795	1200800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_009440	TAA	2	6	1200846	1200851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_009440	CCT	2	6	1200919	1200924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_009440	TCGAA	2	10	1200941	1200950	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3130	NC_009440	TA	4	8	1201064	1201071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_009440	TTA	2	6	1201125	1201130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_009440	A	6	6	1201276	1201281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_009440	GAT	2	6	1201288	1201293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_009440	ATA	2	6	1201298	1201303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_009440	ATG	2	6	1201365	1201370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_009440	TAGC	2	8	1201396	1201403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3138	NC_009440	CTA	2	6	1201597	1201602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3141	NC_009440	T	11	11	1201771	1201781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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