MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 5175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009440	TCA	2	6	844990	844995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_009440	TC	3	6	845102	845107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_009440	AT	3	6	845245	845250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_009440	ATG	2	6	845322	845327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_009440	ATT	2	6	845361	845366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_009440	CCT	2	6	846629	846634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_009440	ATTAT	2	10	846671	846680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_009440	CAT	2	6	848948	848953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_009440	CTTT	2	8	849961	849968	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_009440	ATC	2	6	849977	849982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_009440	TATG	2	8	850044	850051	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_009440	AATAT	2	10	850088	850097	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_009440	TGC	2	6	850103	850108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_009440	GAA	2	6	850116	850121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_009440	TCG	2	6	850141	850146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_009440	T	6	6	851244	851249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_009440	TCTT	2	8	851279	851286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_009440	ATA	2	6	851361	851366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_009440	TTG	2	6	852513	852518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_009440	TTG	2	6	852570	852575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_009440	T	7	7	852578	852584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_009440	CTA	2	6	855781	855786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_009440	ATA	2	6	855797	855802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_009440	GTTTA	2	10	855805	855814	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_009440	TATG	2	8	855916	855923	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_009440	GT	3	6	855935	855940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_009440	ATT	2	6	856003	856008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_009440	AT	3	6	856085	856090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_009440	ATAG	2	8	860990	860997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_009440	ATA	2	6	861010	861015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_009440	TA	3	6	861020	861025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_009440	ACAT	2	8	861033	861040	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_009440	T	7	7	861044	861050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_009440	A	6	6	861051	861056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_009440	TAA	2	6	861061	861066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_009440	CAC	2	6	861099	861104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_009440	AAT	2	6	861109	861114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_009440	AAT	2	6	861171	861176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_009440	TTG	2	6	861191	861196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_009440	ATT	2	6	862237	862242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_009440	TAT	2	6	862263	862268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_009440	TTC	2	6	862364	862369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_009440	ATC	2	6	862386	862391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_009440	AAT	2	6	865886	865891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_009440	GTA	2	6	865960	865965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_009440	AAG	2	6	866029	866034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_009440	CT	3	6	866527	866532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_009440	AGG	2	6	866538	866543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_009440	TTA	2	6	866586	866591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_009440	TTACT	2	10	866597	866606	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1551	NC_009440	TTC	2	6	866625	866630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_009440	AT	3	6	866668	866673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_009440	GAA	2	6	866706	866711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_009440	ATC	2	6	869010	869015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_009440	A	6	6	870379	870384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_009440	GA	3	6	874895	874900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_009440	AAT	2	6	877760	877765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_009440	GT	3	6	877781	877786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_009440	TAG	2	6	877823	877828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_009440	ACA	2	6	877851	877856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_009440	GGA	2	6	877929	877934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_009440	GA	3	6	878043	878048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_009440	CAAG	2	8	878054	878061	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_009440	AAT	2	6	878065	878070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_009440	ATC	2	6	878095	878100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_009440	CCA	2	6	878125	878130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_009440	TCT	2	6	878166	878171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_009440	AAG	2	6	878190	878195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_009440	ATT	2	6	878282	878287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_009440	T	6	6	878292	878297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_009440	ATAGT	2	10	878312	878321	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_009440	TA	3	6	878384	878389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_009440	TGA	2	6	878427	878432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_009440	CTGA	2	8	878447	878454	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_009440	CTT	2	6	878481	878486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_009440	CTA	2	6	878502	878507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_009440	GA	3	6	878517	878522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_009440	GAA	2	6	878539	878544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_009440	AG	3	6	878604	878609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_009440	TCACC	2	10	878657	878666	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1581	NC_009440	TACC	2	8	878762	878769	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1582	NC_009440	TAA	2	6	878831	878836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_009440	TC	3	6	878843	878848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_009440	TGA	2	6	878874	878879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_009440	ATC	2	6	878882	878887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_009440	CACT	2	8	878888	878895	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_009440	CAGCT	2	10	878993	879002	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1588	NC_009440	TCT	2	6	879004	879009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_009440	CT	3	6	879081	879086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_009440	GTC	2	6	879141	879146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_009440	ATT	2	6	879212	879217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_009440	TTCC	2	8	879274	879281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_009440	TTG	2	6	879289	879294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_009440	TCC	2	6	879971	879976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_009440	TAA	3	9	880203	880211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_009440	AAT	2	6	880229	880234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_009440	GGA	2	6	880373	880378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_009440	CCT	2	6	880464	880469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_009440	TAA	2	6	880496	880501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_009440	AAC	2	6	880502	880507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_009440	AAT	2	6	880513	880518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_009440	GATG	2	8	881170	881177	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_009440	GAG	2	6	881200	881205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_009440	AAT	2	6	881344	881349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_009440	ATG	2	6	881353	881358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_009440	GAAA	2	8	881407	881414	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_009440	T	6	6	883481	883486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_009440	ATG	2	6	883487	883492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_009440	AG	4	8	883495	883502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_009440	ATG	2	6	884006	884011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_009440	GGT	2	6	884026	884031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_009440	ATC	2	6	884210	884215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_009440	TCT	2	6	884284	884289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_009440	GA	3	6	884298	884303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_009440	TCT	2	6	884371	884376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_009440	CAA	2	6	884377	884382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_009440	ATT	2	6	884386	884391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_009440	TAA	2	6	884449	884454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_009440	TCT	2	6	884455	884460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_009440	TA	3	6	886471	886476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_009440	GAT	2	6	886504	886509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_009440	TTA	2	6	886515	886520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_009440	AT	3	6	886573	886578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_009440	A	6	6	886583	886588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_009440	AATT	2	8	886637	886644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_009440	TAA	2	6	886661	886666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_009440	TAAAT	2	10	886676	886685	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_009440	A	6	6	889218	889223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_009440	AT	3	6	889262	889267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_009440	TCA	2	6	891167	891172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_009440	GAGC	2	8	891187	891194	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_009440	AGCTC	2	10	891245	891254	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1633	NC_009440	TTC	2	6	891303	891308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_009440	AAG	2	6	891326	891331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_009440	CGCGA	2	10	891419	891428	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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