MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 5175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009440	GTA	2	6	2096343	2096348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_009440	AG	3	6	2096447	2096452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_009440	TAA	2	6	2096518	2096523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_009440	TCC	2	6	2096892	2096897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_009440	TAT	2	6	2098700	2098705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_009440	TCG	2	6	2098708	2098713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_009440	TA	3	6	2099448	2099453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_009440	GAA	2	6	2099466	2099471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_009440	GAG	2	6	2099485	2099490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_009440	ACT	2	6	2099504	2099509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_009440	TTC	2	6	2099555	2099560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_009440	AGA	3	9	2099655	2099663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_009440	A	6	6	2099666	2099671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_009440	TAG	2	6	2101707	2101712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_009440	A	6	6	2104583	2104588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_009440	CAT	2	6	2106749	2106754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_009440	TAT	2	6	2109221	2109226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_009440	AAG	2	6	2109298	2109303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_009440	ATG	2	6	2109319	2109324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_009440	TTG	2	6	2109401	2109406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_009440	AGA	2	6	2109426	2109431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_009440	GGGC	2	8	2109444	2109451	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5023	NC_009440	AGG	2	6	2109655	2109660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_009440	GAG	2	6	2109662	2109667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_009440	GGGA	2	8	2109720	2109727	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_009440	AGGG	2	8	2109782	2109789	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_009440	AGG	2	6	2109805	2109810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_009440	GAGG	2	8	2109818	2109825	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_009440	GCG	2	6	2109916	2109921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_009440	AGGA	2	8	2110003	2110010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_009440	TCA	2	6	2110030	2110035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_009440	GAA	2	6	2110085	2110090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_009440	CG	3	6	2110200	2110205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_009440	AGG	2	6	2110210	2110215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_009440	CCAAC	2	10	2110276	2110285	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5036	NC_009440	AAG	2	6	2110311	2110316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_009440	CAA	2	6	2110337	2110342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_009440	CTCC	2	8	2110361	2110368	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5039	NC_009440	GAG	3	9	2110373	2110381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_009440	GTT	2	6	2110388	2110393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_009440	GGA	2	6	2110405	2110410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_009440	CG	3	6	2110421	2110426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_009440	CTA	2	6	2110439	2110444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_009440	TAA	2	6	2110474	2110479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_009440	TCA	2	6	2110494	2110499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_009440	AAT	2	6	2110525	2110530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_009440	GCC	2	6	2110590	2110595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5048	NC_009440	CCTG	2	8	2110601	2110608	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_009440	T	6	6	2110618	2110623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_009440	GAC	2	6	2110652	2110657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_009440	TAA	2	6	2110755	2110760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_009440	CTA	2	6	2111961	2111966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_009440	CTTTT	2	10	2111980	2111989	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5054	NC_009440	AT	3	6	2112231	2112236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_009440	TCT	2	6	2112270	2112275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_009440	T	6	6	2112275	2112280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_009440	TGAT	2	8	2112337	2112344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_009440	T	6	6	2114968	2114973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_009440	ATTTT	2	10	2114975	2114984	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_009440	ATT	2	6	2120538	2120543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_009440	ATA	2	6	2120646	2120651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_009440	ATA	2	6	2120691	2120696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_009440	TAT	2	6	2120711	2120716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_009440	TAT	2	6	2120720	2120725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_009440	TTC	2	6	2120727	2120732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_009440	TC	3	6	2120799	2120804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_009440	GTAC	2	8	2120842	2120849	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5068	NC_009440	TA	3	6	2120863	2120868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_009440	T	6	6	2121853	2121858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_009440	TAG	2	6	2121872	2121877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_009440	GTA	2	6	2122245	2122250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_009440	ATT	2	6	2125807	2125812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_009440	TAC	2	6	2132817	2132822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_009440	TAA	2	6	2132850	2132855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_009440	AG	3	6	2135280	2135285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_009440	A	6	6	2135297	2135302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_009440	TCTTG	2	10	2135303	2135312	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5078	NC_009440	ATT	2	6	2136296	2136301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_009440	ATT	2	6	2137525	2137530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_009440	GAA	2	6	2144772	2144777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_009440	CAC	2	6	2149677	2149682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_009440	GGT	2	6	2152580	2152585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_009440	ATA	2	6	2152697	2152702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_009440	T	6	6	2154050	2154055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_009440	TC	3	6	2154150	2154155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5086	NC_009440	T	6	6	2154201	2154206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_009440	AGT	2	6	2154298	2154303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_009440	C	6	6	2154325	2154330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5089	NC_009440	AT	3	6	2154336	2154341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_009440	TTC	2	6	2154380	2154385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_009440	CAT	2	6	2154390	2154395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_009440	GAC	2	6	2154474	2154479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_009440	A	6	6	2154511	2154516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_009440	TAT	2	6	2156537	2156542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_009440	TCT	2	6	2156550	2156555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_009440	AAT	2	6	2158368	2158373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_009440	ATT	2	6	2158389	2158394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_009440	GA	3	6	2158396	2158401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_009440	AGGTT	2	10	2158415	2158424	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_009440	ATG	2	6	2158457	2158462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_009440	CG	3	6	2158531	2158536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_009440	AGT	2	6	2158661	2158666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_009440	TCA	2	6	2158692	2158697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_009440	ATT	2	6	2158738	2158743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_009440	GAA	3	9	2158758	2158766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_009440	ATT	2	6	2160076	2160081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_009440	TAT	2	6	2160088	2160093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_009440	TCG	2	6	2160134	2160139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_009440	TAG	2	6	2160144	2160149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_009440	ACATG	2	10	2160152	2160161	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5111	NC_009440	GATT	2	8	2160203	2160210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_009440	AGAGGA	2	12	2160247	2160258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_009440	AGAGGA	2	12	2160271	2160282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_009440	GTAAA	2	10	2160304	2160313	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_009440	AG	3	6	2160314	2160319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_009440	T	6	6	2160330	2160335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_009440	TTC	2	6	2162211	2162216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_009440	TTG	2	6	2162232	2162237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_009440	ATTT	2	8	2163407	2163414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_009440	CGA	2	6	2163419	2163424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_009440	AAC	2	6	2163427	2163432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_009440	A	6	6	2165937	2165942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_009440	TA	3	6	2167640	2167645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_009440	CTTTT	2	10	2167650	2167659	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5125	NC_009440	TAA	2	6	2167690	2167695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_009440	TCT	2	6	2167772	2167777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_009440	AAT	2	6	2167787	2167792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_009440	TAA	2	6	2167849	2167854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_009440	TTG	2	6	2168488	2168493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_009440	GA	3	6	2168509	2168514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_009440	CCA	2	6	2168551	2168556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5132	NC_009440	ATG	2	6	2170238	2170243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_009440	TTAT	2	8	2170244	2170251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_009440	AT	3	6	2170266	2170271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_009440	AGA	2	6	2170400	2170405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_009440	TCA	2	6	2176786	2176791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5138	NC_009440	CGT	2	6	2180915	2180920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5140	NC_009440	TAG	2	6	2181134	2181139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5142	NC_009440	A	6	6	2181203	2181208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_009440	CGT	2	6	2181219	2181224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5144	NC_009440	C	6	6	2181988	2181993	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5145	NC_009440	CAC	2	6	2184804	2184809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5146	NC_009440	T	6	6	2184816	2184821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_009440	A	6	6	2185184	2185189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_009440	T	6	6	2185209	2185214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5149	NC_009440	TAC	2	6	2185232	2185237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5151	NC_009440	TAA	2	6	2185268	2185273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5152	NC_009440	ATT	2	6	2185289	2185294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5153	NC_009440	T	7	7	2185496	2185502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5154	NC_009440	CGG	2	6	2185505	2185510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5155	NC_009440	T	6	6	2185517	2185522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5156	NC_009440	TCT	2	6	2185527	2185532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5159	NC_009440	GAAAG	2	10	2185678	2185687	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5160	NC_009440	TAT	2	6	2185693	2185698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5161	NC_009440	AG	3	6	2185732	2185737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5162	NC_009440	CGT	2	6	2185761	2185766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5163	NC_009440	CCG	2	6	2185822	2185827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5165	NC_009440	GAGG	2	8	2186655	2186662	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_009440	GA	3	6	2189043	2189048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_009440	GGA	2	6	2189093	2189098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5168	NC_009440	TATT	2	8	2189695	2189702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5172	NC_009440	A	7	7	2191443	2191449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5173	NC_009440	AAT	2	6	2191458	2191463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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