MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium gilvum PYR-GCK chromosome

Total Repeats: 386

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009338	CGCGC	2	10	14064	14073	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_009338	AGGCG	2	10	54645	54654	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009338	CGACG	2	10	56097	56106	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009338	CGGCG	2	10	92055	92064	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009338	TGCGG	2	10	94283	94292	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009338	CCGCA	2	10	94380	94389	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_009338	TCCGA	2	10	94614	94623	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009338	GTCGG	2	10	163172	163181	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009338	ACCGG	2	10	204275	204284	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009338	TCCCG	2	10	220489	220498	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_009338	GCGGG	2	10	230628	230637	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009338	GGCGC	2	10	230964	230973	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009338	TTAGG	2	10	287077	287086	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009338	GCCCG	2	10	288879	288888	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_009338	GCTAA	2	10	330414	330423	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009338	CGCGC	2	10	347577	347586	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17	NC_009338	TGGCG	2	10	357591	357600	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009338	GCGCC	2	10	357724	357733	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_009338	GCCAC	2	10	358314	358323	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_009338	ACCGA	2	10	373611	373620	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009338	TGAGT	2	10	398083	398092	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009338	CGCGA	2	10	419682	419691	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009338	TTGCG	2	10	422910	422919	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009338	GTCGG	2	10	424154	424163	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009338	CGCGG	2	10	430583	430592	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_009338	GCACG	2	10	431049	431058	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009338	CGCTA	2	10	456587	456596	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009338	TGCGA	2	10	466511	466520	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009338	GAACG	2	10	501012	501021	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009338	TGGCC	2	10	508291	508300	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_009338	GCGCC	2	10	526321	526330	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_009338	ACTTC	2	10	544602	544611	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_009338	GATCG	2	10	564751	564760	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009338	CAGTA	2	10	575769	575778	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009338	CCTTT	2	10	580368	580377	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_009338	ATCGC	2	10	588219	588228	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009338	CAACG	2	10	591033	591042	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009338	GACCA	2	10	597742	597751	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_009338	CGAAT	2	10	603524	603533	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009338	GCCGG	2	10	606300	606309	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009338	ACTCC	2	10	611299	611308	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_009338	GGCCA	2	10	612246	612255	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_009338	GTTGT	2	10	617582	617591	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009338	CCGCG	2	10	617789	617798	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_009338	CAGCG	2	10	623966	623975	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_009338	GCTGG	2	10	624657	624666	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009338	CTGCG	2	10	626726	626735	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_009338	GCACG	2	10	640295	640304	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_009338	AGCGC	2	10	640345	640354	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_009338	CAGTA	2	10	649453	649462	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009338	CCTTT	2	10	654052	654061	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009338	CCGAC	2	10	663817	663826	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_009338	GACCA	2	10	685306	685315	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_009338	GTGCG	2	10	685524	685533	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009338	CGATT	2	10	693104	693113	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_009338	ACTCC	2	10	693743	693752	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_009338	GTTGT	2	10	700536	700545	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009338	CCGCG	2	10	700743	700752	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
59	NC_009338	TCCGA	2	10	705711	705720	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_009338	CGGCG	2	10	712896	712905	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_009338	CGGCG	2	10	713127	713136	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_009338	GATCG	2	10	744183	744192	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009338	ACGGC	2	10	757920	757929	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_009338	CGGTC	2	10	776604	776613	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_009338	GGTGC	2	10	803430	803439	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009338	CGGCG	2	10	810306	810315	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_009338	GGGCC	2	10	816278	816287	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
68	NC_009338	GGCCC	2	10	823517	823526	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_009338	TGAAC	2	10	831145	831154	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009338	ACGTC	2	10	833179	833188	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_009338	TCCTG	2	10	842919	842928	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_009338	CGTGG	2	10	858321	858330	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009338	GACGG	2	10	879358	879367	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009338	ACGGC	2	10	897896	897905	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_009338	AACCT	2	10	916937	916946	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_009338	CATCA	2	10	921464	921473	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_009338	ATTGA	2	10	926333	926342	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009338	TCGCG	2	10	929786	929795	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_009338	ATCAG	2	10	931129	931138	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009338	GTCGA	2	10	934535	934544	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009338	GGGCC	2	10	934677	934686	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_009338	GTCAA	2	10	942186	942195	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009338	TCGTG	2	10	942670	942679	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009338	TCGAC	2	10	955167	955176	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_009338	CACAT	2	10	965717	965726	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_009338	ACTCA	2	10	969439	969448	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_009338	AGCAT	2	10	974402	974411	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009338	CCAGC	2	10	1015458	1015467	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_009338	TGAGA	2	10	1022999	1023008	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009338	CGGCG	2	10	1066237	1066246	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_009338	CGCGC	2	10	1097837	1097846	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_009338	TCCGA	2	10	1148731	1148740	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_009338	GGGCC	2	10	1148799	1148808	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_009338	GTACC	2	10	1149967	1149976	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_009338	GCAGT	2	10	1179495	1179504	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009338	CCCGG	2	10	1180400	1180409	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
97	NC_009338	CCGGG	2	10	1180419	1180428	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
98	NC_009338	TAACT	2	10	1187557	1187566	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009338	GTGAT	2	10	1210367	1210376	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009338	GGACC	2	10	1246135	1246144	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_009338	GTGGC	2	10	1248989	1248998	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009338	TGCTT	2	10	1252908	1252917	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009338	CGGGA	2	10	1259354	1259363	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009338	GGGAG	2	10	1273619	1273628	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009338	TGCAG	2	10	1306013	1306022	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009338	CGGAA	2	10	1306064	1306073	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009338	AGGGT	2	10	1306110	1306119	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009338	GATCG	2	10	1306140	1306149	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009338	GTGCT	2	10	1318265	1318274	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009338	GACGT	2	10	1331647	1331656	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009338	AACCC	2	10	1332519	1332528	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
112	NC_009338	CGACG	2	10	1358001	1358010	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_009338	CGACC	2	10	1379879	1379888	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_009338	CGGCG	2	10	1379892	1379901	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009338	TCCGG	2	10	1401123	1401132	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_009338	GGTCG	2	10	1448702	1448711	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009338	CCCGC	2	10	1485296	1485305	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
118	NC_009338	CGAAC	2	10	1491734	1491743	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_009338	GGCAT	2	10	1491813	1491822	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009338	CGTGT	2	10	1520907	1520916	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009338	CGGCC	2	10	1555731	1555740	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_009338	GGCCG	2	10	1571565	1571574	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_009338	GCGCC	2	10	1581684	1581693	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_009338	ACCGG	2	10	1581942	1581951	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_009338	CGTGC	2	10	1593373	1593382	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_009338	GGCAC	2	10	1593397	1593406	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_009338	TCGCT	2	10	1605721	1605730	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_009338	TCCCG	2	10	1625033	1625042	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_009338	CCGAC	2	10	1649338	1649347	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_009338	GTTTC	2	10	1649466	1649475	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009338	ACGTC	2	10	1707907	1707916	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_009338	CGTCC	2	10	1709441	1709450	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_009338	AGCGG	2	10	1726403	1726412	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009338	TGACG	2	10	1763910	1763919	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009338	CGATG	2	10	1777461	1777470	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009338	TGCAG	2	10	1777988	1777997	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009338	GATCG	2	10	1794671	1794680	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009338	CGGCG	2	10	1874248	1874257	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_009338	GTCGG	2	10	1876378	1876387	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009338	CTCTC	2	10	1891316	1891325	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
141	NC_009338	ACTCA	2	10	1920524	1920533	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_009338	CGTCC	2	10	1945882	1945891	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_009338	GCACA	2	10	1948439	1948448	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_009338	GTCGC	2	10	2023497	2023506	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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283	NC_009338	CACGC	2	10	4040985	4040994	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
284	NC_009338	AGCGA	2	10	4056338	4056347	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
285	NC_009338	TGACA	2	10	4063650	4063659	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
286	NC_009338	ATCAG	2	10	4063767	4063776	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
287	NC_009338	GCCCT	2	10	4107847	4107856	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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289	NC_009338	CGACC	2	10	4145766	4145775	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
290	NC_009338	GACAG	2	10	4156885	4156894	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
291	NC_009338	CGAGC	2	10	4158837	4158846	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
292	NC_009338	GCGCG	2	10	4195429	4195438	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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297	NC_009338	GCCAG	2	10	4260044	4260053	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
298	NC_009338	GACCG	2	10	4287442	4287451	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
299	NC_009338	GACCG	2	10	4287467	4287476	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
300	NC_009338	ACCCC	2	10	4333645	4333654	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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302	NC_009338	TCTGC	2	10	4338130	4338139	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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341	NC_009338	GTTTC	3	15	4948122	4948136	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
342	NC_009338	TCGTT	3	15	4948138	4948152	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
343	NC_009338	ATCTG	2	10	4959598	4959607	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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352	NC_009338	TCGAC	2	10	5077803	5077812	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
353	NC_009338	CGCAT	2	10	5082924	5082933	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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377	NC_009338	CAGCG	2	10	5532306	5532315	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
378	NC_009338	ATTCA	2	10	5556320	5556329	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
379	NC_009338	GACTG	2	10	5562883	5562892	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
380	NC_009338	CGGCG	2	10	5571619	5571628	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
381	NC_009338	TCGCG	2	10	5573593	5573602	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
382	NC_009338	AAACG	2	10	5576295	5576304	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
383	NC_009338	TCCGG	2	10	5577273	5577282	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
384	NC_009338	AGCCG	2	10	5577739	5577748	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
385	NC_009338	GTCGC	2	10	5588640	5588649	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
386	NC_009338	TCCCC	2	10	5591737	5591746	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.