MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanococcus maripaludis C5 chromosome

Total Repeats: 828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009135	AATT	2	8	18380	18387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009135	TCTA	2	8	22726	22733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009135	AAAT	2	8	23346	23353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009135	AATT	2	8	23379	23386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009135	TATT	2	8	26985	26992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009135	AATT	2	8	27671	27678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009135	ATTA	2	8	29367	29374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009135	TATT	2	8	30433	30440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009135	TTAT	2	8	33441	33448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009135	GAAA	2	8	37928	37935	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009135	TTCT	2	8	41315	41322	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009135	TAAA	2	8	43452	43459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009135	TTTA	2	8	44968	44975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009135	TAAA	2	8	47642	47649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009135	ATAC	2	8	49120	49127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009135	TTTG	2	8	55094	55101	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009135	AATT	2	8	56426	56433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009135	TAAT	2	8	59269	59276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009135	GAAT	2	8	64922	64929	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009135	TCTT	2	8	71367	71374	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009135	AAAG	2	8	71386	71393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009135	TTAT	3	12	75586	75597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009135	ATAA	2	8	87475	87482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009135	TACC	2	8	95935	95942	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009135	TTTA	2	8	114430	114437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009135	TTTA	2	8	114858	114865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009135	CTTA	2	8	115636	115643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009135	AAAT	2	8	120498	120505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009135	TTTA	2	8	120546	120553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009135	AATT	2	8	130121	130128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009135	AAGT	2	8	135281	135288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009135	TACT	2	8	142934	142941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009135	GTTA	2	8	144592	144599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009135	TTAA	2	8	150656	150663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009135	TTTA	2	8	150772	150779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009135	AATT	2	8	152326	152333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009135	TAAA	2	8	152380	152387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009135	TTTA	2	8	155855	155862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009135	TATT	2	8	157373	157380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009135	CTTT	2	8	158485	158492	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009135	AAAT	2	8	158808	158815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009135	ATTT	2	8	159597	159604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009135	AATA	2	8	159629	159636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009135	TACT	2	8	159782	159789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009135	ATTT	2	8	161203	161210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009135	CTTT	2	8	165838	165845	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009135	ATTT	2	8	173875	173882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009135	AAAT	2	8	189264	189271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009135	TTAA	2	8	191442	191449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009135	TAAA	2	8	194599	194606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009135	AAAT	2	8	194620	194627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009135	CAAA	2	8	195745	195752	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009135	TTTA	2	8	196620	196627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009135	TGTA	2	8	200823	200830	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009135	AAAG	2	8	210127	210134	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009135	TCAA	2	8	213204	213211	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009135	TCAA	2	8	213232	213239	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009135	ATTT	2	8	219071	219078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009135	AGTA	2	8	219353	219360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009135	AATC	2	8	219539	219546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009135	ATCA	2	8	219673	219680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009135	AGGT	2	8	219691	219698	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009135	TTAA	2	8	219761	219768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009135	AATC	2	8	219802	219809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009135	ACAT	2	8	220163	220170	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009135	TGAT	2	8	221304	221311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009135	ATTA	2	8	221316	221323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009135	ATTT	2	8	221881	221888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009135	CTTG	2	8	225758	225765	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009135	AATT	2	8	228259	228266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009135	ATTA	2	8	228805	228812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009135	TTAA	2	8	229130	229137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009135	ATAG	2	8	230647	230654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009135	GAAA	2	8	230907	230914	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009135	GATA	2	8	234348	234355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009135	TTTA	2	8	234407	234414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009135	AATT	2	8	234805	234812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009135	AATT	2	8	239153	239160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009135	TTTA	2	8	244665	244672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009135	ATTT	2	8	245366	245373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009135	ATAC	2	8	251964	251971	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009135	TAGA	2	8	267032	267039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009135	GACC	2	8	270679	270686	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009135	TGAG	2	8	270866	270873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009135	ATCA	2	8	276039	276046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009135	TTAG	2	8	276202	276209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009135	TAAT	2	8	278600	278607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009135	ATTT	3	12	283974	283985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009135	ATTT	2	8	288575	288582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009135	GAAT	2	8	292904	292911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009135	ATGA	2	8	294088	294095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009135	CTTT	2	8	295261	295268	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009135	ATTA	2	8	295524	295531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009135	ACAA	2	8	296254	296261	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009135	TTAT	2	8	296321	296328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009135	TTTA	2	8	296510	296517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009135	TTAA	2	8	301910	301917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009135	AAAT	2	8	302995	303002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009135	CTAT	2	8	310994	311001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009135	TAAT	2	8	319071	319078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009135	ATTT	2	8	327163	327170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009135	AATA	2	8	330558	330565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009135	TAAA	2	8	330570	330577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009135	TTAA	2	8	340901	340908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009135	ATTT	2	8	344683	344690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009135	AAAT	2	8	350876	350883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009135	TAAT	2	8	352448	352455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009135	TCCG	2	8	354249	354256	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009135	TAAC	2	8	355062	355069	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009135	TCGT	2	8	355825	355832	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009135	AATA	2	8	356209	356216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009135	TAAA	2	8	363242	363249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009135	AAAG	2	8	363542	363549	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009135	ATTA	2	8	363555	363562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009135	TGAT	2	8	365935	365942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009135	TAAA	2	8	367655	367662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009135	ATTA	2	8	368269	368276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009135	AAAT	2	8	379237	379244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009135	ATTA	2	8	380978	380985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009135	TTTA	2	8	382342	382349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009135	TTAA	2	8	388133	388140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009135	AAAT	2	8	388191	388198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009135	TAAA	2	8	389754	389761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009135	CCTC	2	8	393416	393423	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_009135	TAAT	2	8	393426	393433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009135	TACT	2	8	393537	393544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009135	ATTT	2	8	394768	394775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009135	TACT	2	8	396556	396563	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009135	TATT	3	12	396587	396598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_009135	AAAT	2	8	399512	399519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009135	TAAC	2	8	399524	399531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009135	TTAA	2	8	404747	404754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009135	TATC	2	8	406288	406295	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009135	ATTT	2	8	407302	407309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009135	TGTA	2	8	407361	407368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009135	TATT	2	8	407447	407454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009135	ATTA	2	8	412544	412551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009135	ATTT	2	8	413737	413744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009135	TAAT	2	8	415910	415917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009135	TTAA	2	8	421673	421680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009135	AAAT	2	8	423575	423582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009135	TTAT	2	8	423614	423621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_009135	GAAT	2	8	444485	444492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009135	TTCT	2	8	446782	446789	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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