MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. JLS chromosome

Total Repeats: 9216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009077	GGC	2	6	37	42	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009077	ACA	2	6	139	144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009077	ACG	3	9	147	155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009077	TTCG	2	8	203	210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009077	GTC	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009077	CGT	2	6	1741	1746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009077	T	7	7	1750	1756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009077	GCC	2	6	1768	1773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009077	CGG	2	6	1784	1789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009077	A	6	6	1822	1827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009077	TCAC	2	8	1852	1859	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009077	CGT	2	6	1934	1939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009077	CCGC	2	8	1956	1963	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_009077	GTCC	2	8	1966	1973	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009077	GCC	2	6	1977	1982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_009077	TC	3	6	2065	2070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009077	TCT	2	6	2077	2082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009077	AC	3	6	2102	2107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009077	CGT	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009077	CGAT	2	8	2153	2160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009077	GGT	2	6	2191	2196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009077	GTC	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009077	GAG	2	6	4462	4467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009077	GATA	2	8	6285	6292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009077	CGC	3	9	6301	6309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_009077	CGG	2	6	6357	6362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009077	GAG	2	6	6390	6395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009077	ATC	2	6	8461	8466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009077	GAG	2	6	10984	10989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009077	CGG	2	6	11875	11880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009077	GCT	2	6	11940	11945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009077	TCC	2	6	12023	12028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_009077	CACGG	2	10	12141	12150	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009077	CGA	2	6	12172	12177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009077	CAC	2	6	12740	12745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009077	CGG	2	6	12782	12787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009077	CGA	2	6	13335	13340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009077	GAAT	2	8	13893	13900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009077	CTCGC	2	10	18989	18998	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_009077	CTG	2	6	23889	23894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009077	GC	3	6	23966	23971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009077	TCGT	2	8	25402	25409	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009077	GCT	2	6	25414	25419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009077	CCG	2	6	25432	25437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_009077	GCC	2	6	25565	25570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_009077	CTG	2	6	25572	25577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009077	GTC	2	6	25619	25624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009077	AGCG	2	8	25710	25717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009077	CCG	2	6	26073	26078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_009077	CTC	2	6	26091	26096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_009077	GGCC	2	8	26101	26108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009077	GAG	2	6	26127	26132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009077	CTG	2	6	26153	26158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009077	CGG	2	6	26191	26196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009077	ACGG	2	8	26253	26260	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009077	CCG	2	6	28080	28085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009077	CG	3	6	28129	28134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009077	CCGC	2	8	28145	28152	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_009077	CCG	2	6	29180	29185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009077	TCG	2	6	30237	30242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009077	CAC	2	6	30247	30252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_009077	GCTG	2	8	30274	30281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009077	CGG	2	6	32200	32205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009077	GGT	2	6	32210	32215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009077	GCG	2	6	32262	32267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009077	GCG	2	6	32285	32290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009077	CGGT	2	8	32310	32317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009077	GGTG	2	8	32362	32369	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009077	CGG	2	6	32380	32385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009077	GCG	2	6	32391	32396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009077	CGG	2	6	32404	32409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009077	CCG	2	6	32454	32459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_009077	ACGA	2	8	32479	32486	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009077	AGACG	2	10	33136	33145	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009077	CGTCT	2	10	33149	33158	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_009077	GC	3	6	40421	40426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009077	AAC	2	6	40433	40438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009077	CCT	2	6	40459	40464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_009077	CCG	2	6	40509	40514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009077	TGG	3	9	40549	40557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009077	CA	3	6	40572	40577	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009077	CGT	2	6	40589	40594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009077	CGG	2	6	47421	47426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009077	GT	3	6	49267	49272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009077	CGG	2	6	49285	49290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009077	GGT	2	6	50142	50147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009077	GCC	2	6	50534	50539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_009077	TGG	2	6	50582	50587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009077	ATG	2	6	50615	50620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009077	GTG	2	6	51032	51037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009077	GGT	2	6	51123	51128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009077	CGG	2	6	51138	51143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009077	TAGCGG	2	12	51231	51242	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009077	CGT	2	6	51272	51277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009077	CCG	3	9	52055	52063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_009077	GCG	2	6	52065	52070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009077	CTA	2	6	52075	52080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009077	GAC	2	6	52130	52135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009077	CGC	2	6	53136	53141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_009077	AGC	2	6	53142	53147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009077	CCG	2	6	53149	53154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009077	GTC	2	6	54225	54230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009077	ATG	2	6	54283	54288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009077	CCG	2	6	55290	55295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_009077	G	6	6	55325	55330	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009077	GCG	3	9	55342	55350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009077	CGG	2	6	55358	55363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009077	CGGG	2	8	55374	55381	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009077	GGC	2	6	55392	55397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009077	TGG	2	6	55408	55413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009077	CGG	2	6	55424	55429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009077	GCGG	2	8	55431	55438	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009077	CTG	2	6	55454	55459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009077	GCG	2	6	55501	55506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009077	CG	3	6	55517	55522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009077	TCC	2	6	55560	55565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_009077	CT	3	6	55583	55588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009077	CGGT	2	8	55605	55612	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009077	TCC	2	6	55623	55628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_009077	GACG	2	8	55642	55649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009077	CG	3	6	55682	55687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009077	CCG	2	6	55758	55763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_009077	CGC	2	6	55818	55823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009077	GCG	2	6	56010	56015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009077	CCG	2	6	56091	56096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009077	CG	3	6	56095	56100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009077	TGG	2	6	64789	64794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009077	GAC	2	6	64832	64837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009077	GGTA	2	8	64840	64847	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009077	GCG	2	6	65203	65208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009077	CCAC	2	8	65240	65247	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_009077	AC	3	6	65246	65251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009077	CGC	2	6	66587	66592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_009077	GTG	2	6	66641	66646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009077	AAG	2	6	66659	66664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009077	GCCG	2	8	67322	67329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009077	CCT	2	6	67359	67364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_009077	CCA	2	6	67381	67386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_009077	CCA	2	6	68847	68852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_009077	GGC	2	6	68871	68876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009077	ACC	2	6	68882	68887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_009077	TCC	2	6	72619	72624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_009077	CGGC	2	8	72647	72654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009077	C	6	6	75417	75422	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
145	NC_009077	CCG	2	6	75431	75436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_009077	G	6	6	75550	75555	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009077	GGA	2	6	75575	75580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_009077	CCA	2	6	216462	216467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_009077	CGGCG	2	10	216471	216480	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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291	NC_009077	CG	3	6	218560	218565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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412	NC_009077	TCG	2	6	334235	334240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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418	NC_009077	CTC	2	6	347269	347274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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