MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. JLS chromosome

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009077	TAGCGG	2	12	51231	51242	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009077	TGGGGG	2	12	75871	75882	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009077	ATGTGC	2	12	218735	218746	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009077	CAGCGC	2	12	224024	224035	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009077	CCGGAT	2	12	268161	268172	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009077	TTTCAC	2	12	374054	374065	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009077	CGGGCG	2	12	374153	374164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009077	ACGGTG	2	12	448406	448417	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009077	CAACGC	2	12	456211	456222	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009077	CCCGAG	2	12	459792	459803	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009077	CCGGGC	3	18	492233	492250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009077	GTGCTT	2	12	600749	600760	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009077	CAGCCG	2	12	716543	716554	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009077	TTTTGG	2	12	763371	763382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009077	TCGCGC	2	12	811335	811346	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009077	CTTGAC	2	12	840612	840623	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009077	TTCGCA	2	12	867055	867066	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009077	AACGAC	2	12	955410	955421	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009077	GTGATC	2	12	957144	957155	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009077	CGATCA	2	12	958754	958765	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009077	CGGTGG	2	12	1012713	1012724	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_009077	AGCCCG	2	12	1146874	1146885	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009077	CGGAAG	2	12	1146931	1146942	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_009077	TGCACG	2	12	1197140	1197151	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009077	AGACCG	2	12	1197537	1197548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009077	TGCGGT	2	12	1206868	1206879	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009077	CGATCG	2	12	1207152	1207163	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009077	GAGCGA	2	12	1207264	1207275	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009077	TCGAAG	2	12	1236929	1236940	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009077	AGCGTG	2	12	1250651	1250662	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009077	GAAGTA	2	12	1259083	1259094	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009077	TCGGCC	2	12	1300745	1300756	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009077	GCCGCG	2	12	1353370	1353381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009077	CCGTCA	2	12	1395923	1395934	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009077	TCGGCG	2	12	1408491	1408502	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009077	GTCGCC	2	12	1434319	1434330	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009077	TACCGC	2	12	1567221	1567232	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009077	GGCCGG	2	12	1590830	1590841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009077	CGAAGT	2	12	1695223	1695234	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009077	AAGGGC	2	12	1695886	1695897	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009077	CCGGTC	2	12	1709303	1709314	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009077	CTCGCC	4	24	1709819	1709842	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009077	CTCGAT	2	12	1710209	1710220	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009077	AGATCG	2	12	1715787	1715798	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009077	TCCACT	2	12	1749736	1749747	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009077	GTGCGG	2	12	1765899	1765910	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_009077	ACCGCG	2	12	1886184	1886195	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009077	CGTCGA	2	12	1890943	1890954	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009077	GCGGGT	2	12	1891396	1891407	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009077	CTTGTT	2	12	1891511	1891522	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009077	CCGGGT	2	12	1914604	1914615	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009077	ACGCGA	2	12	2052148	2052159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009077	CAGTGA	2	12	2124234	2124245	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009077	CGGCCG	2	12	2189756	2189767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009077	GCGTCG	2	12	2315472	2315483	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009077	CAGGGC	2	12	2367248	2367259	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009077	CCCGGA	2	12	2468554	2468565	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009077	TCCTGG	2	12	2482240	2482251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009077	ACAGCG	2	12	2483266	2483277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009077	AGGCCA	2	12	2707299	2707310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009077	CGGAAT	2	12	2728573	2728584	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009077	CCGCGA	2	12	2750097	2750108	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009077	GGCGCC	2	12	2767411	2767422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009077	CATCAG	2	12	2777920	2777931	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009077	GCATCG	2	12	2813784	2813795	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009077	GTTTCA	2	12	2855172	2855183	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_009077	CGAGTG	2	12	2978079	2978090	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_009077	GAACAC	2	12	2980872	2980883	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009077	TCCCTC	2	12	2998317	2998328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_009077	AATTGA	2	12	3077993	3078004	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009077	GTGGGA	2	12	3127087	3127098	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009077	GCAGAC	2	12	3244038	3244049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009077	CCCGGG	2	12	3348314	3348325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009077	GATGCC	2	12	3388809	3388820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009077	CCGTTG	2	12	3393604	3393615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009077	AATTTC	2	12	3418074	3418085	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009077	CTCAAC	2	12	3422001	3422012	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009077	GTACCG	2	12	3576924	3576935	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009077	CCGCAC	2	12	3671218	3671229	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009077	ACGCGG	2	12	3697528	3697539	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009077	CGCGGT	2	12	3748413	3748424	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009077	CACCGG	2	12	3762923	3762934	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009077	ACCGGA	2	12	3767394	3767405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009077	GCCGGG	2	12	3815756	3815767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009077	CGGCGA	2	12	3864637	3864648	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009077	TGCCAC	2	12	3873691	3873702	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009077	GGTCAC	2	12	3939130	3939141	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009077	GAACCG	2	12	4101681	4101692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009077	GCATCC	2	12	4245596	4245607	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009077	GCTGTG	2	12	4441497	4441508	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_009077	GGAGCT	2	12	4441859	4441870	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_009077	TCGTGA	2	12	4467379	4467390	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_009077	GATCAT	2	12	4491104	4491115	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009077	GACGCG	2	12	4521410	4521421	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009077	CGGCGC	2	12	4563091	4563102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009077	GGGCCG	2	12	4597424	4597435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009077	CGTCTC	2	12	4640373	4640384	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009077	GTCAGG	2	12	4674602	4674613	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009077	CGCAAA	2	12	4699571	4699582	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009077	GGACAA	2	12	4723069	4723080	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_009077	CCCGAA	2	12	4724312	4724323	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009077	ACCGCG	2	12	4751976	4751987	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009077	ATCCCG	2	12	4755274	4755285	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009077	CAGTCC	2	12	4757509	4757520	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009077	GCCCGA	2	12	4761514	4761525	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009077	CGAACA	2	12	4767935	4767946	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009077	AACGCC	2	12	4798655	4798666	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009077	AACAGC	2	12	4818441	4818452	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009077	ACGGGT	2	12	4918131	4918142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_009077	CGTCGG	2	12	4936616	4936627	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009077	ATCCGG	2	12	4954897	4954908	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009077	ACCCGA	2	12	5106907	5106918	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009077	ACTGGC	2	12	5174064	5174075	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009077	AGAACG	2	12	5190559	5190570	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_009077	CGCGCC	2	12	5219150	5219161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_009077	CCCCGG	2	12	5278329	5278340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_009077	TGCGAG	2	12	5434727	5434738	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_009077	CACCGA	2	12	5434835	5434846	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009077	TGGCGG	2	12	5594557	5594568	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_009077	GACGGC	2	12	5657439	5657450	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009077	ACCGGC	2	12	5685203	5685214	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009077	TGCCCG	2	12	5765983	5765994	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009077	TCCGCC	2	12	5846622	5846633	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009077	CGACGG	2	12	5946097	5946108	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009077	CCGCAC	2	12	5995524	5995535	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009077	GGAGAG	2	12	6005987	6005998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.