MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. JLS chromosome

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009077	CACGG	2	10	12141	12150	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009077	CTCGC	2	10	18989	18998	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_009077	AGACG	2	10	33136	33145	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009077	CGTCT	2	10	33149	33158	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009077	AGCAC	2	10	128726	128735	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_009077	GCTGT	2	10	163060	163069	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009077	TCAGA	2	10	163097	163106	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009077	GTTCC	2	10	191067	191076	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009077	GGGCG	2	10	211269	211278	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009077	CGGCG	2	10	216471	216480	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009077	GCGCC	2	10	276354	276363	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_009077	CGGGA	2	10	298574	298583	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009077	CGGCC	2	10	321988	321997	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_009077	GGCGC	2	10	374173	374182	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009077	CCGGT	2	10	397457	397466	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009077	TAGCC	2	10	397520	397529	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009077	CGCAA	2	10	421226	421235	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009077	TTCCG	2	10	440782	440791	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_009077	CCGCA	2	10	446143	446152	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_009077	ACGCC	2	10	454973	454982	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_009077	ACGCG	2	10	462305	462314	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_009077	ACGCG	2	10	490403	490412	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009077	CTCGT	2	10	503379	503388	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_009077	GAGCG	2	10	560687	560696	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009077	GCAAC	2	10	600857	600866	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_009077	TCGAG	2	10	624983	624992	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009077	GGGCC	2	10	656268	656277	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009077	GCGGG	2	10	669806	669815	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009077	CGCTG	2	10	691559	691568	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009077	ACCGA	2	10	703896	703905	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_009077	GTCGC	2	10	729588	729597	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009077	GGACG	2	10	762866	762875	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009077	CCGGG	2	10	773253	773262	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009077	GTCGC	2	10	811378	811387	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009077	CGAAA	2	10	814672	814681	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009077	CGATT	2	10	816359	816368	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009077	TGGCG	2	10	883988	883997	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009077	CGGCT	2	10	896089	896098	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_009077	GAGGG	2	10	910145	910154	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009077	CGCGG	2	10	975855	975864	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009077	TGTGG	2	10	996428	996437	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009077	TTCTG	2	10	1010057	1010066	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_009077	GACCG	2	10	1012771	1012780	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_009077	CAGCA	2	10	1019613	1019622	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_009077	TCGTC	2	10	1027201	1027210	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_009077	CACGG	2	10	1029929	1029938	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_009077	TTTGG	2	10	1046391	1046400	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009077	CCGCC	2	10	1053270	1053279	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
49	NC_009077	TGTCG	2	10	1062711	1062720	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009077	CACCT	2	10	1080157	1080166	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
51	NC_009077	GACCT	2	10	1147140	1147149	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009077	CGCTT	2	10	1161451	1161460	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_009077	TCGCT	2	10	1166538	1166547	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_009077	TCGCT	2	10	1166574	1166583	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_009077	GCCAC	2	10	1176895	1176904	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_009077	GCGGT	2	10	1194589	1194598	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009077	GAACG	2	10	1206762	1206771	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009077	GAGCG	2	10	1207315	1207324	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009077	CCGGC	2	10	1207422	1207431	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_009077	CGGTG	2	10	1216690	1216699	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009077	CCCGG	2	10	1217225	1217234	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_009077	GGGAG	2	10	1235562	1235571	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009077	GTGTG	2	10	1245955	1245964	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009077	GGTCA	2	10	1250393	1250402	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009077	GCCGC	2	10	1250863	1250872	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_009077	AGCGC	2	10	1262442	1262451	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_009077	CGAGC	2	10	1264372	1264381	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_009077	CGAGA	2	10	1299627	1299636	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009077	CGCGG	2	10	1300655	1300664	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_009077	GTTTC	2	10	1327831	1327840	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009077	AGACG	2	10	1329428	1329437	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009077	ACGCC	2	10	1348779	1348788	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_009077	CGGCG	2	10	1360641	1360650	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_009077	CCGGC	2	10	1404701	1404710	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_009077	TGCTG	2	10	1446459	1446468	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009077	AGTCA	2	10	1463081	1463090	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009077	TCGCC	2	10	1472178	1472187	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_009077	CGGTG	2	10	1476732	1476741	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009077	GCCGT	2	10	1484780	1484789	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_009077	GGCTC	2	10	1488282	1488291	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_009077	CGGAT	2	10	1494685	1494694	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009077	GAATT	2	10	1518876	1518885	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009077	CGGCG	2	10	1533157	1533166	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_009077	GCCGG	2	10	1535475	1535484	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
85	NC_009077	CGGCG	2	10	1540291	1540300	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_009077	TCGGT	2	10	1549876	1549885	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009077	CGGGC	2	10	1564764	1564773	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_009077	CAAGG	2	10	1581861	1581870	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009077	GCCCG	2	10	1582845	1582854	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
90	NC_009077	GCCGC	2	10	1583144	1583153	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
91	NC_009077	TCGCT	2	10	1667665	1667674	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_009077	CACCG	2	10	1670555	1670564	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_009077	CGGCG	2	10	1680075	1680084	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_009077	TCGCG	2	10	1687874	1687883	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_009077	TTTTC	2	10	1691540	1691549	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009077	CCGGT	2	10	1696053	1696062	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_009077	GTGGG	2	10	1696583	1696592	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009077	TCGGA	2	10	1698267	1698276	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009077	CGCGG	2	10	1703320	1703329	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
100	NC_009077	GGAGT	2	10	1708869	1708878	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009077	CGGCG	2	10	1709391	1709400	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_009077	AATCG	2	10	1709507	1709516	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009077	TGGTC	2	10	1710816	1710825	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009077	ACCAC	2	10	1715944	1715953	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
105	NC_009077	GTGAC	2	10	1717224	1717233	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009077	TGGTC	2	10	1717291	1717300	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009077	GTCGG	2	10	1740073	1740082	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009077	GTACT	2	10	1754436	1754445	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009077	CCGAT	2	10	1765453	1765462	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_009077	AGCGC	2	10	1768116	1768125	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_009077	GCACG	2	10	1782533	1782542	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_009077	AGGCT	2	10	1799324	1799333	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_009077	GGCTC	2	10	1807930	1807939	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_009077	ACCCG	2	10	1808364	1808373	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_009077	GCCGC	3	15	1818043	1818057	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_009077	TTCCA	2	10	1828413	1828422	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_009077	GGTGG	2	10	1828851	1828860	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009077	GGAGA	2	10	1829490	1829499	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009077	GGGCG	2	10	1886963	1886972	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009077	CAGCG	2	10	1890395	1890404	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_009077	TCTCG	2	10	1909046	1909055	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_009077	GGGTG	2	10	1971776	1971785	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009077	TGGGC	2	10	1972393	1972402	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009077	CCGCC	2	10	2026400	2026409	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
125	NC_009077	CGGGC	2	10	2048587	2048596	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
126	NC_009077	CCGGC	2	10	2057660	2057669	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
127	NC_009077	CCGCC	2	10	2131934	2131943	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
128	NC_009077	TGACC	2	10	2168708	2168717	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_009077	GGCGC	2	10	2173780	2173789	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
130	NC_009077	TGTTT	2	10	2189428	2189437	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009077	CAGCA	2	10	2192420	2192429	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_009077	CGGAC	2	10	2212420	2212429	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_009077	GTGAG	2	10	2218090	2218099	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009077	GGGTG	2	10	2252460	2252469	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009077	CGCAG	2	10	2256144	2256153	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_009077	TACGG	2	10	2263349	2263358	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009077	TGTCG	2	10	2266037	2266046	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009077	ACCAG	2	10	2268960	2268969	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_009077	CGTGC	2	10	2312132	2312141	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_009077	GCTGC	2	10	2312904	2312913	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_009077	CGGTT	2	10	2314451	2314460	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_009077	GACCA	2	10	2334091	2334100	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_009077	GACCA	2	10	2340297	2340306	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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276	NC_009077	TACTG	2	10	4086654	4086663	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
277	NC_009077	TGTGG	2	10	4130264	4130273	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_009077	GTTCC	2	10	5982917	5982926	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
400	NC_009077	CTCCC	2	10	5993081	5993090	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
401	NC_009077	CGCTG	2	10	5995566	5995575	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
402	NC_009077	CGTGT	2	10	5997658	5997667	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
403	NC_009077	GTTGC	2	10	6023756	6023765	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.