MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. JLS chromosome

Total Repeats: 1211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009077	TTCG	2	8	203	210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009077	TCAC	2	8	1852	1859	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009077	CCGC	2	8	1956	1963	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_009077	GTCC	2	8	1966	1973	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009077	CGAT	2	8	2153	2160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009077	GATA	2	8	6285	6292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009077	GAAT	2	8	13893	13900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009077	TCGT	2	8	25402	25409	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009077	AGCG	2	8	25710	25717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009077	GGCC	2	8	26101	26108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009077	ACGG	2	8	26253	26260	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009077	CCGC	2	8	28145	28152	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_009077	GCTG	2	8	30274	30281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009077	CGGT	2	8	32310	32317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009077	GGTG	2	8	32362	32369	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009077	ACGA	2	8	32479	32486	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009077	CGGG	2	8	55374	55381	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009077	GCGG	2	8	55431	55438	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009077	CGGT	2	8	55605	55612	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009077	GACG	2	8	55642	55649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009077	GGTA	2	8	64840	64847	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009077	CCAC	2	8	65240	65247	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_009077	GCCG	2	8	67322	67329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009077	CGGC	2	8	72647	72654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009077	TCGG	2	8	77911	77918	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009077	GAAT	2	8	81461	81468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009077	GGGC	2	8	87891	87898	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009077	GGTT	2	8	87904	87911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009077	AGGA	2	8	87932	87939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009077	CGGC	2	8	96270	96277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009077	TCCT	2	8	101186	101193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009077	GACC	2	8	106041	106048	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009077	CTGA	2	8	110422	110429	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009077	CCGG	2	8	128599	128606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009077	CCCG	2	8	128639	128646	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_009077	GCCG	2	8	149644	149651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009077	CGGC	2	8	150736	150743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009077	GGCA	2	8	158683	158690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009077	CGGG	2	8	162376	162383	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009077	GGCG	2	8	162398	162405	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009077	GCGG	2	8	166014	166021	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009077	ACGC	2	8	177951	177958	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009077	CCCG	2	8	187756	187763	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_009077	TCCA	2	8	188687	188694	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009077	CTTC	2	8	195285	195292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009077	CGCA	2	8	202446	202453	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009077	GCGG	2	8	202528	202535	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009077	CGGT	2	8	208933	208940	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009077	CGTC	2	8	209841	209848	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009077	GAGG	2	8	213008	213015	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009077	TGGG	2	8	216421	216428	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009077	GTGA	2	8	216449	216456	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009077	TCGC	2	8	218542	218549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009077	GCCC	2	8	218762	218769	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_009077	CGAC	2	8	221142	221149	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009077	CCAC	2	8	234826	234833	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_009077	GATT	2	8	242513	242520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009077	CGGG	2	8	246449	246456	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009077	CGCC	2	8	250189	250196	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_009077	GAGG	2	8	252554	252561	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009077	CGTG	2	8	279863	279870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009077	GCGG	2	8	280775	280782	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009077	GACC	2	8	282534	282541	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009077	CCAA	2	8	296606	296613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009077	GGGC	2	8	296652	296659	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009077	GACG	2	8	297598	297605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009077	GGCA	2	8	312387	312394	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009077	TTCA	2	8	324375	324382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009077	CGTC	2	8	324419	324426	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009077	GTCA	2	8	329170	329177	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009077	GGAC	2	8	344645	344652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009077	GCCG	2	8	344663	344670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009077	TCTG	2	8	346379	346386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009077	CCGG	2	8	350236	350243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009077	TCGC	2	8	351566	351573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009077	GATC	3	12	353415	353426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009077	GATC	3	12	354117	354128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009077	CAGT	2	8	357878	357885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009077	AGGC	2	8	363115	363122	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009077	GCGG	2	8	363150	363157	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009077	CAGC	2	8	385931	385938	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009077	TTGG	2	8	394893	394900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009077	ACAG	2	8	406823	406830	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009077	CGGG	2	8	407499	407506	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009077	GGGC	2	8	415515	415522	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009077	CCGA	2	8	416744	416751	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009077	GCAG	2	8	423696	423703	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009077	TGGG	2	8	427352	427359	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009077	GGCA	2	8	430859	430866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009077	CGTT	2	8	432890	432897	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009077	AAGA	2	8	440451	440458	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009077	GGGT	2	8	445371	445378	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009077	GTCA	2	8	446063	446070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009077	CGCA	2	8	446106	446113	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009077	GCTC	2	8	455057	455064	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009077	CCGG	2	8	455097	455104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009077	TCCG	2	8	455574	455581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009077	CGGC	2	8	455622	455629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009077	CATG	2	8	455971	455978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009077	GGCT	2	8	456014	456021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009077	CTGG	2	8	456169	456176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009077	CCGA	2	8	459722	459729	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009077	GCCC	2	8	459744	459751	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_009077	GGCT	2	8	460762	460769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009077	ACGA	2	8	462263	462270	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009077	GGCC	2	8	462278	462285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009077	GGCG	2	8	471537	471544	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009077	GACT	2	8	482091	482098	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009077	GGCG	2	8	489527	489534	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009077	GCGT	2	8	490108	490115	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009077	GAGG	2	8	490236	490243	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009077	GGGC	2	8	490289	490296	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009077	AGCG	2	8	503422	503429	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009077	CCGC	2	8	503847	503854	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_009077	TCCG	2	8	515864	515871	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009077	CGAT	2	8	515944	515951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009077	CGGG	2	8	530101	530108	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009077	GGCG	2	8	565279	565286	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009077	GTAA	2	8	579293	579300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009077	GTGC	2	8	579327	579334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009077	TAGT	2	8	579347	579354	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009077	AGGG	2	8	589530	589537	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009077	TCGC	2	8	594169	594176	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009077	TCGG	2	8	594246	594253	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009077	GGGC	2	8	600611	600618	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009077	TCCG	2	8	602263	602270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009077	CCGA	2	8	610587	610594	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009077	CGGA	2	8	624739	624746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009077	TTCA	2	8	633822	633829	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009077	CGTG	2	8	640224	640231	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009077	GGGC	2	8	649739	649746	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009077	CGTG	2	8	649764	649771	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009077	TTGC	2	8	653784	653791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009077	CGCT	2	8	653804	653811	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009077	CCGT	2	8	654541	654548	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009077	CGAC	2	8	654564	654571	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009077	GGCG	2	8	656327	656334	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009077	GCCG	2	8	663942	663949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009077	CATT	2	8	674779	674786	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009077	GCTA	2	8	692909	692916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009077	GTAG	2	8	716398	716405	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009077	GCCG	2	8	716519	716526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009077	ACGC	2	8	729544	729551	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009077	GTCC	2	8	741499	741506	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009077	ACTG	2	8	744214	744221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009077	ATTG	2	8	759709	759716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009077	GCGG	2	8	773292	773299	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009077	CCCG	2	8	780116	780123	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_009077	GGAG	2	8	785463	785470	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009077	TTCC	2	8	787841	787848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_009077	CGGT	2	8	819615	819622	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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496	NC_009077	GCTG	2	8	2519564	2519571	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
497	NC_009077	CGGC	2	8	2527708	2527715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
498	NC_009077	ACCG	2	8	2531810	2531817	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_009077	CGGG	2	8	2546370	2546377	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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