MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 chromosome

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008740	CCGGTG	2	12	52794	52805	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008740	GGTGCT	2	12	132293	132304	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008740	GGAAAC	2	12	214562	214573	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008740	GAAATC	2	12	244177	244188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_008740	TTATTT	2	12	254290	254301	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008740	GAGCTT	2	12	262592	262603	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008740	CGCACC	2	12	343495	343506	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008740	GGCCGG	2	12	446285	446296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008740	TTGGGG	2	12	461616	461627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008740	AAGCTC	2	12	481837	481848	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008740	ACAAAA	2	12	505218	505229	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_008740	CTCGTT	2	12	509637	509648	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008740	ATTGCA	2	12	520534	520545	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008740	TGACCA	2	12	534248	534259	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008740	TTACTG	2	12	661576	661587	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008740	TGGCCT	2	12	713666	713677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008740	ATCCTT	2	12	733957	733968	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008740	CGATTG	2	12	741692	741703	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008740	TCTACA	2	12	769622	769633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008740	TTTGTT	2	12	769734	769745	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008740	TTTTGT	2	12	769764	769775	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008740	ACACTG	2	12	799499	799510	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008740	TGAAAT	2	12	802943	802954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008740	TTTAGT	2	12	1003721	1003732	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008740	ACACTG	2	12	1010880	1010891	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008740	TGAAAT	2	12	1014324	1014335	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008740	TAAGTA	2	12	1102147	1102158	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008740	TTTAGT	2	12	1105172	1105183	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008740	GTGGCT	2	12	1129790	1129801	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008740	GGTATT	2	12	1130360	1130371	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008740	AAACTT	2	12	1141866	1141877	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008740	TTCGGG	2	12	1145403	1145414	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008740	TACAGG	2	12	1289796	1289807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008740	CGCTCC	2	12	1378350	1378361	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_008740	ATTTAT	2	12	1414295	1414306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008740	GACCGA	2	12	1419455	1419466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008740	AATCAG	2	12	1461854	1461865	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008740	GAGTCG	2	12	1500335	1500346	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008740	TTACCT	2	12	1566544	1566555	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008740	GATTCA	2	12	1599377	1599388	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008740	CTGGGC	2	12	1642340	1642351	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008740	GTTTCT	2	12	1752349	1752360	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008740	GGCCAC	2	12	1895551	1895562	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008740	TAACGG	2	12	1896680	1896691	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008740	CTTGAT	2	12	1987596	1987607	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008740	CCTTCC	2	12	2004189	2004200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_008740	TCGACC	2	12	2090625	2090636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008740	TTCCCA	2	12	2097422	2097433	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008740	GCCGGT	2	12	2129442	2129453	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008740	CTTTTT	2	12	2245796	2245807	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008740	GACCCG	2	12	2265240	2265251	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008740	TGACTC	2	12	2273109	2273120	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008740	GAACTG	2	12	2367853	2367864	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008740	TTTACG	2	12	2378423	2378434	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_008740	AATCAA	2	12	2444205	2444216	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_008740	CCGGCC	2	12	2502133	2502144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008740	TATACA	2	12	2531344	2531355	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008740	CTGGGG	2	12	2533625	2533636	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_008740	AAAAAG	2	12	2555661	2555672	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008740	GTTGTG	2	12	2593634	2593645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008740	GAAACA	2	12	2596267	2596278	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008740	TGGCCG	2	12	2638700	2638711	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008740	ATTTCA	2	12	2765241	2765252	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008740	TCAGTG	2	12	2768966	2768977	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_008740	TTCAGG	2	12	2799936	2799947	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008740	GTGTAG	2	12	2904104	2904115	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008740	ATTCTC	2	12	3006760	3006771	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008740	CGTTGA	2	12	3011268	3011279	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008740	TCTTGC	2	12	3018945	3018956	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008740	AAACAC	2	12	3096775	3096786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008740	GGCCGG	2	12	3108294	3108305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008740	CAAAAT	2	12	3123233	3123244	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008740	ACGGAT	2	12	3155951	3155962	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008740	AACAAG	2	12	3174277	3174288	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_008740	CCCGAT	2	12	3192954	3192965	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008740	GGGGTG	2	12	3215584	3215595	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008740	AAGGGC	2	12	3269968	3269979	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008740	CAGAAG	2	12	3309769	3309780	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008740	CCCGGC	2	12	3469006	3469017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_008740	TTGATC	2	12	3483113	3483124	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008740	TCGATG	2	12	3526137	3526148	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_008740	AGTCGA	2	12	3534724	3534735	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_008740	AGCACC	2	12	3535641	3535652	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008740	CGGAGG	2	12	3554829	3554840	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_008740	GGCGCT	2	12	3563351	3563362	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008740	CTAATG	2	12	3579066	3579077	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_008740	CATTAT	2	12	3637860	3637871	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_008740	CAGGCG	2	12	3664922	3664933	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008740	CTAACC	2	12	3694122	3694133	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008740	ACAAAA	2	12	3706319	3706330	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_008740	GCAACA	2	12	3783460	3783471	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008740	CAAACC	2	12	3798705	3798716	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008740	TGGTTT	2	12	3876441	3876452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008740	CTACCG	2	12	3972447	3972458	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008740	GGGGAT	2	12	4142825	4142836	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008740	GCATAG	2	12	4259166	4259177	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_008740	ATGGTT	2	12	4326772	4326783	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.