MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 plasmid pMAQU02

Total Repeats: 434

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008739	CAA	2	6	17	22	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008739	TAT	2	6	39	44	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008739	CTG	2	6	182	187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008739	GAC	2	6	301	306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008739	CTA	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008739	GCA	2	6	365	370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008739	ACT	2	6	432	437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008739	TGC	2	6	576	581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008739	AAG	2	6	1515	1520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008739	AGA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008739	GAC	2	6	2840	2845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008739	ACG	2	6	2903	2908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008739	TCA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008739	AGG	2	6	3134	3139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008739	GAA	2	6	3140	3145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008739	TTG	2	6	6837	6842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008739	AAT	2	6	6899	6904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008739	CAA	2	6	6918	6923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008739	GCA	2	6	7855	7860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008739	CGA	2	6	8205	8210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008739	TAA	2	6	9341	9346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008739	GAT	2	6	9368	9373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008739	GAT	2	6	9392	9397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008739	ATG	2	6	9817	9822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008739	AGT	2	6	11115	11120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008739	CAT	2	6	11144	11149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008739	GCT	2	6	11254	11259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008739	ATG	2	6	11379	11384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008739	GCT	2	6	11470	11475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008739	ACC	2	6	12460	12465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_008739	TGA	2	6	12538	12543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008739	ACT	2	6	13119	13124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008739	TCC	2	6	13999	14004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_008739	CCA	2	6	15367	15372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_008739	TGT	2	6	15410	15415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008739	CCT	2	6	17353	17358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_008739	GTG	2	6	17435	17440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008739	GAC	2	6	17495	17500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008739	CTG	2	6	17555	17560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008739	GTC	2	6	18312	18317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008739	TGC	2	6	18325	18330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008739	CCG	2	6	20104	20109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_008739	TCA	2	6	20116	20121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008739	TCG	2	6	20137	20142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008739	TGG	2	6	21480	21485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008739	TCG	2	6	21563	21568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008739	GCC	2	6	21877	21882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_008739	TTG	2	6	21887	21892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008739	CCG	2	6	21933	21938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_008739	TAT	2	6	22006	22011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008739	TTA	2	6	22069	22074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008739	TTC	2	6	22228	22233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008739	CAG	2	6	22260	22265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008739	CCA	2	6	25581	25586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_008739	TGG	2	6	25665	25670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008739	GTT	2	6	34603	34608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008739	CCA	2	6	34769	34774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008739	CTG	2	6	34855	34860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008739	TTG	2	6	34861	34866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008739	TTA	2	6	35253	35258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008739	AAG	2	6	36676	36681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008739	CGC	2	6	36691	36696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_008739	AGC	2	6	36737	36742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008739	GTT	2	6	36834	36839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008739	GGA	2	6	36864	36869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008739	AAG	2	6	36998	37003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008739	TGC	2	6	37034	37039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008739	GCA	2	6	37046	37051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008739	TAT	2	6	37065	37070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008739	CCA	2	6	37085	37090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_008739	TGA	2	6	37179	37184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008739	CGG	2	6	37219	37224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008739	GAA	2	6	37379	37384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008739	GAA	2	6	37410	37415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008739	CTG	2	6	37551	37556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008739	CTG	2	6	37572	37577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008739	CGG	2	6	40663	40668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008739	AGC	2	6	40673	40678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008739	GTA	2	6	42706	42711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008739	CCG	2	6	42842	42847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_008739	AGT	2	6	44359	44364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008739	GCG	2	6	44473	44478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008739	TCA	3	9	44566	44574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008739	GTT	2	6	44744	44749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008739	TAA	2	6	45398	45403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008739	CTT	2	6	46929	46934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008739	AGC	2	6	46967	46972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008739	ATG	2	6	47196	47201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008739	TGA	2	6	47327	47332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008739	ATG	2	6	47383	47388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008739	TAC	2	6	47397	47402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008739	TTC	2	6	48057	48062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008739	CCG	2	6	48082	48087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_008739	AGG	2	6	48092	48097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008739	CGG	2	6	48228	48233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008739	ATT	2	6	50873	50878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008739	ACC	2	6	52232	52237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_008739	GAA	2	6	52325	52330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008739	CCT	2	6	52375	52380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008739	ATT	2	6	52470	52475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008739	CTC	2	6	52517	52522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008739	AGG	2	6	52778	52783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008739	TAC	2	6	52820	52825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008739	ACT	2	6	52920	52925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008739	GCA	2	6	53081	53086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008739	ACT	2	6	53088	53093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008739	TTC	2	6	53112	53117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008739	TTA	2	6	53193	53198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008739	TAA	2	6	53214	53219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008739	CAA	2	6	53280	53285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008739	CAA	2	6	53367	53372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008739	AGT	2	6	53422	53427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008739	CAA	2	6	53458	53463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008739	ATC	2	6	53596	53601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008739	GGA	2	6	53816	53821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008739	GAG	2	6	55738	55743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008739	TAG	2	6	55746	55751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008739	ATG	2	6	55819	55824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008739	CAA	2	6	55923	55928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008739	GAC	2	6	56523	56528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008739	TGG	2	6	59045	59050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008739	ATT	2	6	59319	59324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008739	TTA	2	6	59409	59414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008739	GTC	2	6	59461	59466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008739	ATG	2	6	59471	59476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008739	AGT	2	6	62062	62067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008739	GTG	2	6	62183	62188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008739	AAG	2	6	62212	62217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008739	CTG	2	6	62244	62249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008739	ATA	2	6	63482	63487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008739	TGA	2	6	63504	63509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008739	GAT	2	6	65349	65354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008739	AGA	2	6	65379	65384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008739	CTC	2	6	65429	65434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_008739	ATC	2	6	65493	65498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008739	ATG	3	9	65553	65561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008739	TCA	2	6	65782	65787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008739	GGA	2	6	65919	65924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008739	CGC	2	6	66287	66292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_008739	TTG	2	6	66315	66320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.