MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 plasmid pMAQU01

Total Repeats: 350

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008738	GAA	2	6	3095	3100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008738	GCC	2	6	4070	4075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_008738	GCA	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008738	TAA	2	6	4852	4857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008738	AGG	2	6	4879	4884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008738	GCT	2	6	4942	4947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008738	GAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008738	CTT	2	6	5702	5707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008738	TGT	2	6	6477	6482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008738	AGA	2	6	8673	8678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008738	TAC	2	6	8776	8781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008738	AGC	2	6	10052	10057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008738	CCA	3	9	10074	10082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_008738	GGT	2	6	10372	10377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008738	TTG	3	9	11206	11214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008738	AGT	2	6	11277	11282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008738	TAA	2	6	11512	11517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008738	TTC	2	6	11740	11745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008738	TGC	2	6	11805	11810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008738	CCG	2	6	12849	12854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_008738	TGG	2	6	13871	13876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008738	ACT	2	6	14183	14188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008738	TAA	2	6	14233	14238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008738	ACA	2	6	14274	14279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008738	ACA	2	6	14343	14348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008738	GGC	2	6	14358	14363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008738	AAG	2	6	14387	14392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008738	TTA	2	6	14455	14460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008738	TCG	2	6	14535	14540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008738	CCG	2	6	14546	14551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_008738	CTG	2	6	15310	15315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008738	CAG	2	6	16000	16005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008738	GAC	2	6	16018	16023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008738	TAC	2	6	19097	19102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008738	TCC	2	6	19168	19173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_008738	CAC	2	6	22455	22460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_008738	GCG	2	6	22466	22471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008738	AGG	2	6	23674	23679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008738	ATC	2	6	26675	26680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008738	TTC	2	6	26741	26746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008738	ATG	2	6	26761	26766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008738	GAA	2	6	26801	26806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008738	ATC	2	6	26947	26952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008738	CAG	2	6	26963	26968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008738	ACT	2	6	28483	28488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008738	GAA	2	6	28870	28875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008738	CGA	2	6	29261	29266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008738	GAC	2	6	39540	39545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008738	GTG	2	6	40511	40516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008738	GAA	2	6	40534	40539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008738	CAT	2	6	40645	40650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008738	TGC	2	6	40663	40668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008738	GCT	2	6	40686	40691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008738	TTG	2	6	40915	40920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008738	CAA	2	6	40972	40977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008738	ACA	2	6	40984	40989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008738	AGT	2	6	42481	42486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008738	AGG	2	6	45978	45983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008738	AAG	2	6	46678	46683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008738	TTC	2	6	46799	46804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008738	ACC	2	6	46843	46848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008738	TCG	2	6	46851	46856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008738	TCC	2	6	47161	47166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_008738	GCC	2	6	47322	47327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_008738	GGA	2	6	47330	47335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008738	GGT	2	6	47417	47422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008738	ATC	2	6	47482	47487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008738	TGT	2	6	47508	47513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008738	GAA	2	6	47544	47549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008738	AAT	2	6	47695	47700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008738	CTT	2	6	47703	47708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008738	TTA	2	6	47712	47717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008738	TGA	2	6	47827	47832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008738	AGT	2	6	47916	47921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008738	CGG	2	6	47983	47988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008738	GCC	2	6	48070	48075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_008738	CTT	2	6	48111	48116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008738	ACC	2	6	48129	48134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_008738	GTT	2	6	48136	48141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008738	GCC	2	6	48149	48154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_008738	GAT	2	6	48178	48183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008738	ATG	2	6	48218	48223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008738	GGC	2	6	49673	49678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008738	AAC	2	6	49859	49864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008738	GCT	2	6	49884	49889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008738	GGC	2	6	49945	49950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008738	TCT	2	6	50045	50050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008738	AAT	2	6	50111	50116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008738	AAT	2	6	50197	50202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008738	TAC	2	6	50211	50216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008738	AAG	2	6	50231	50236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008738	CAG	2	6	51216	51221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008738	CAG	2	6	52968	52973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008738	CCT	2	6	52997	53002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008738	CGC	2	6	53590	53595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_008738	CAC	2	6	53758	53763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008738	CGA	2	6	53794	53799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008738	AAC	2	6	53808	53813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008738	ACT	2	6	53846	53851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008738	CCA	2	6	54473	54478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_008738	CGA	2	6	56397	56402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008738	CCA	2	6	56417	56422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_008738	CGC	2	6	56433	56438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_008738	GCT	2	6	56478	56483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008738	AAT	2	6	56569	56574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008738	TAC	2	6	56699	56704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008738	ACC	2	6	56733	56738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008738	GCT	2	6	56743	56748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008738	ACC	2	6	58926	58931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_008738	CTG	2	6	59032	59037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008738	TAT	2	6	60861	60866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008738	ACA	2	6	60889	60894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008738	TAT	2	6	60902	60907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008738	GCG	2	6	60923	60928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008738	GTC	2	6	62493	62498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008738	CAA	2	6	62631	62636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008738	ACG	2	6	62642	62647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008738	CTA	2	6	65057	65062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008738	GAA	2	6	65140	65145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008738	GTT	2	6	65244	65249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008738	CAA	2	6	66570	66575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008738	TGA	2	6	66579	66584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008738	CAA	2	6	66696	66701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008738	GGA	2	6	66713	66718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008738	TCG	2	6	66734	66739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008738	CAC	2	6	66859	66864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_008738	CAA	2	6	66959	66964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008738	TGG	2	6	66968	66973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008738	CAA	2	6	66992	66997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008738	TGG	2	6	67124	67129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008738	TGC	2	6	67158	67163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008738	TTG	2	6	67215	67220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008738	CCA	2	6	67227	67232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008738	CAA	2	6	67266	67271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008738	AAC	2	6	67311	67316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008738	AAC	2	6	67362	67367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008738	CTA	2	6	68799	68804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008738	AAC	2	6	69338	69343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008738	ATC	2	6	71987	71992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008738	CGA	2	6	72015	72020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.