MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium vanbaalenii PYR-1 chromosome

Total Repeats: 1518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008726	TATC	2	8	2066	2073	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008726	ACCT	2	8	13419	13426	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008726	CCGG	2	8	14536	14543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008726	CGCA	2	8	15871	15878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008726	TCCA	2	8	18440	18447	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008726	ATTC	2	8	23346	23353	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008726	ACGA	2	8	23693	23700	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008726	GTCG	2	8	34885	34892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008726	CCTC	2	8	36358	36365	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_008726	CATG	2	8	36431	36438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008726	CCGC	2	8	50984	50991	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_008726	CGAT	2	8	51373	51380	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008726	CGGC	2	8	51460	51467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008726	CCGG	2	8	54621	54628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008726	CGGG	2	8	70696	70703	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008726	CCGC	2	8	74350	74357	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_008726	TCGC	2	8	76251	76258	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008726	GGCG	2	8	76776	76783	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008726	GACG	2	8	106430	106437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008726	GAAT	2	8	112282	112289	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008726	GCTG	2	8	116652	116659	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008726	TGGT	2	8	118540	118547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008726	CGAG	2	8	125249	125256	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008726	AACC	2	8	138584	138591	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008726	CCGC	2	8	169348	169355	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_008726	ATCG	2	8	170707	170714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008726	CGAG	2	8	170754	170761	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008726	CAGA	2	8	170762	170769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008726	ATTG	2	8	174724	174731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008726	TGCG	2	8	174777	174784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008726	CCAA	2	8	174843	174850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008726	GTCG	2	8	184608	184615	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008726	CGGC	2	8	189983	189990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008726	GGGC	2	8	190234	190241	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008726	CGGC	2	8	197398	197405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008726	GGTC	2	8	198053	198060	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008726	GGCA	2	8	208222	208229	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008726	CAGG	2	8	210560	210567	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008726	GCGT	2	8	212460	212467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008726	CGGG	2	8	213110	213117	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008726	GCCC	2	8	227264	227271	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_008726	CAGT	2	8	227297	227304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008726	GTAC	2	8	227591	227598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008726	GGGC	2	8	227683	227690	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008726	GATC	2	8	227700	227707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008726	AGCC	2	8	227869	227876	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008726	GTAG	2	8	228116	228123	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008726	GGCC	2	8	228478	228485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008726	CGAG	2	8	229349	229356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008726	CGGC	2	8	230716	230723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008726	CGAC	2	8	251687	251694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008726	CGGG	3	12	259222	259233	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008726	CGGA	2	8	259288	259295	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008726	AGTG	2	8	264596	264603	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008726	CGGG	2	8	271923	271930	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008726	TCGG	2	8	279657	279664	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008726	ATCG	2	8	286423	286430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008726	CAGC	2	8	304616	304623	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008726	CGAT	2	8	311081	311088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008726	CCAT	2	8	311133	311140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008726	GCTA	2	8	324324	324331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008726	ACGG	2	8	347203	347210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008726	CCGG	2	8	356247	356254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008726	GATA	2	8	361085	361092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008726	GATG	2	8	362099	362106	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008726	CTGC	2	8	363493	363500	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008726	CTCG	2	8	364127	364134	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008726	AAGG	2	8	365240	365247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008726	GGAC	2	8	365262	365269	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008726	GGCT	2	8	366963	366970	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008726	CTCC	2	8	367013	367020	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_008726	CGAG	2	8	388011	388018	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008726	GCAC	2	8	392454	392461	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008726	GCCA	2	8	392603	392610	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008726	CCTG	2	8	392619	392626	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008726	CTCC	2	8	392861	392868	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_008726	ATGT	2	8	407588	407595	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008726	AGGA	2	8	422093	422100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008726	CGGG	2	8	424448	424455	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008726	CGAC	2	8	427101	427108	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008726	CCGG	2	8	427115	427122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008726	CCTC	2	8	427647	427654	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_008726	GCTG	2	8	431937	431944	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008726	GGGC	2	8	431982	431989	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008726	GCTA	2	8	437555	437562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008726	GGTT	2	8	437566	437573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008726	GGCG	2	8	443319	443326	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008726	CATA	2	8	444345	444352	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008726	CAGG	2	8	454987	454994	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008726	ACCC	2	8	455058	455065	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_008726	TCCG	2	8	477419	477426	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008726	TTCC	2	8	477446	477453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008726	GCAG	2	8	477495	477502	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008726	AGGG	2	8	494078	494085	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008726	CGGC	2	8	494178	494185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008726	GGAT	2	8	495855	495862	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008726	TGCC	2	8	499297	499304	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008726	GCAG	2	8	502067	502074	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008726	GGAA	2	8	508389	508396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008726	GCTG	2	8	510099	510106	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008726	CGCC	2	8	515510	515517	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_008726	CCCA	2	8	517584	517591	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_008726	GCCG	2	8	519476	519483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008726	TATG	2	8	519637	519644	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008726	GAGT	2	8	525447	525454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008726	CGGC	2	8	528261	528268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008726	CGTG	2	8	530039	530046	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008726	GCTG	2	8	530185	530192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008726	GATC	2	8	543209	543216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008726	CCGG	2	8	549839	549846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008726	ACCC	2	8	554783	554790	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_008726	CAGA	2	8	554883	554890	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008726	GGCA	2	8	563105	563112	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008726	GCTG	2	8	567079	567086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008726	GAAA	2	8	578265	578272	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008726	GAAG	2	8	584384	584391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008726	GATG	2	8	592494	592501	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008726	CGGG	2	8	593675	593682	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008726	CCAA	2	8	595635	595642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008726	CCCG	2	8	595797	595804	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_008726	CTGG	2	8	596604	596611	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008726	GCTT	2	8	598703	598710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008726	CGTG	2	8	598774	598781	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008726	CATG	2	8	598875	598882	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008726	CGGG	2	8	610835	610842	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_008726	CAGC	2	8	613352	613359	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008726	CTTG	2	8	613820	613827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008726	AACC	2	8	619687	619694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008726	GCCG	2	8	631215	631222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008726	GTTC	2	8	644947	644954	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008726	GGTC	2	8	648137	648144	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008726	CGAG	2	8	657437	657444	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008726	CGAG	2	8	661000	661007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008726	CGTT	2	8	661019	661026	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008726	GGCC	2	8	680769	680776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008726	GCAC	2	8	683167	683174	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008726	CACC	2	8	683358	683365	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_008726	GGCC	2	8	690875	690882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008726	CTGC	2	8	699578	699585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008726	ACCT	2	8	699623	699630	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008726	GCCC	2	8	701651	701658	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_008726	CAAT	2	8	703348	703355	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008726	GGGT	2	8	711345	711352	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008726	CGGG	2	8	716068	716075	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008726	CGCC	2	8	718080	718087	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_008726	GGGC	2	8	725365	725372	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008726	CAGG	2	8	740599	740606	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008726	GCTG	2	8	744520	744527	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008726	AGCG	2	8	749175	749182	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008726	AGCC	2	8	750543	750550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008726	GGTG	2	8	768177	768184	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008726	GATC	2	8	772027	772034	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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154	NC_008726	CGGG	2	8	785182	785189	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
155	NC_008726	GTCT	2	8	801884	801891	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_008726	AGTG	2	8	805386	805393	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_008726	TCGG	2	8	841489	841496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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167	NC_008726	CGGC	2	8	843452	843459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
168	NC_008726	TCGC	2	8	843478	843485	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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267	NC_008726	CCTG	2	8	1352736	1352743	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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270	NC_008726	CCTG	2	8	1356966	1356973	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
271	NC_008726	AACT	2	8	1357003	1357010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
272	NC_008726	TCGC	3	12	1369539	1369550	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
273	NC_008726	CTGA	2	8	1370710	1370717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
274	NC_008726	AAGC	2	8	1371550	1371557	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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276	NC_008726	CAAT	2	8	1382122	1382129	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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279	NC_008726	TCGA	2	8	1388341	1388348	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
280	NC_008726	TGAG	2	8	1412575	1412582	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
281	NC_008726	GCAG	2	8	1415801	1415808	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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284	NC_008726	TTAG	2	8	1432209	1432216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
285	NC_008726	CGGG	2	8	1432270	1432277	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
286	NC_008726	GCCA	2	8	1432384	1432391	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
287	NC_008726	CTAT	2	8	1451159	1451166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
288	NC_008726	TCGT	2	8	1460625	1460632	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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291	NC_008726	CGGG	2	8	1489321	1489328	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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433	NC_008726	CAGC	2	8	1936983	1936990	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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491	NC_008726	CGTT	2	8	2201736	2201743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_008726	GATG	2	8	2202054	2202061	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_008726	CTGT	2	8	2219423	2219430	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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