MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. KMS plasmid pMKMS01

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008703	TCTT	2	8	10145	10152	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008703	GGGT	2	8	13091	13098	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008703	GCCT	2	8	13161	13168	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008703	TGGG	2	8	21663	21670	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008703	GGGC	2	8	21743	21750	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008703	TGGC	2	8	21923	21930	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008703	GGGT	2	8	22629	22636	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008703	GCCT	2	8	22699	22706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008703	CGGT	2	8	24075	24082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008703	CGGT	2	8	24142	24149	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008703	CGCC	2	8	24708	24715	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_008703	CCGG	2	8	24807	24814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008703	CGCC	2	8	26040	26047	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008703	CCGG	2	8	26139	26146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008703	CGCC	2	8	27202	27209	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_008703	CCGG	2	8	27301	27308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008703	CGCC	2	8	27913	27920	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_008703	CGGG	2	8	28019	28026	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008703	GGGT	2	8	28641	28648	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008703	GCCT	2	8	28711	28718	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008703	CGCC	2	8	30754	30761	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_008703	CGCC	2	8	31386	31393	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_008703	TCGC	2	8	31486	31493	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008703	GGGT	2	8	32760	32767	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008703	GCCT	2	8	32830	32837	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008703	GTGG	2	8	34176	34183	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008703	CGGA	2	8	34786	34793	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008703	CGCC	2	8	34952	34959	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_008703	CGGC	2	8	35020	35027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008703	GGCG	2	8	36044	36051	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008703	GGTG	2	8	36090	36097	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008703	CGCC	2	8	37541	37548	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_008703	TGGC	2	8	38900	38907	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008703	CGGA	2	8	41870	41877	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008703	AATT	2	8	42005	42012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008703	GAAA	2	8	43945	43952	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008703	GGTC	2	8	44128	44135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008703	GGGC	2	8	44217	44224	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008703	GGGT	2	8	45336	45343	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008703	GCCT	2	8	45406	45413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008703	CGGG	2	8	46839	46846	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008703	GCCT	2	8	48044	48051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008703	AGCG	2	8	58876	58883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008703	TCGC	2	8	59398	59405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008703	TCAA	2	8	59738	59745	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008703	CGGA	2	8	61951	61958	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008703	CCCG	2	8	62651	62658	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_008703	CGGG	2	8	62720	62727	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008703	GCGT	2	8	62878	62885	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008703	GAAT	2	8	64443	64450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008703	CCCG	2	8	70049	70056	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_008703	CGCT	2	8	70161	70168	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008703	CGGC	2	8	72812	72819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008703	ACGC	2	8	72829	72836	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008703	GGAA	2	8	75275	75282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008703	GACC	2	8	75695	75702	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008703	TGGG	2	8	78580	78587	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008703	GGCC	2	8	82895	82902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008703	GCCG	2	8	82999	83006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008703	GGTG	2	8	85507	85514	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008703	GCGG	2	8	86698	86705	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008703	TGGC	2	8	89586	89593	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008703	TCGT	2	8	89854	89861	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008703	TCGG	2	8	89909	89916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008703	ACCG	2	8	89961	89968	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008703	GAAC	2	8	91301	91308	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008703	GACG	2	8	91522	91529	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008703	ACGT	2	8	91847	91854	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008703	AAGC	2	8	95542	95549	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008703	CGGT	2	8	96114	96121	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008703	GGCA	2	8	99424	99431	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008703	TTCT	2	8	99581	99588	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008703	CGGG	2	8	99621	99628	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008703	GTGA	2	8	106661	106668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008703	CGCC	2	8	107907	107914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_008703	ACTG	2	8	108130	108137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008703	CCGT	2	8	110988	110995	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008703	CGAG	2	8	113475	113482	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008703	TCGA	2	8	114988	114995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008703	AGCA	2	8	116665	116672	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008703	AGTT	2	8	118046	118053	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008703	CGCA	2	8	125693	125700	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008703	ATGC	2	8	128909	128916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008703	CGCC	2	8	129700	129707	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_008703	GTCG	2	8	132313	132320	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008703	CTTG	2	8	132347	132354	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008703	CGGC	2	8	135441	135448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008703	CGTG	2	8	137220	137227	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008703	GCTG	2	8	137366	137373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008703	GGCA	2	8	147116	147123	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008703	ATGC	2	8	153359	153366	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008703	CCGG	2	8	154009	154016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008703	GTCA	2	8	154174	154181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008703	GAAA	2	8	162276	162283	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008703	GTTC	2	8	166335	166342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008703	CGAT	2	8	167492	167499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008703	GGTC	2	8	167798	167805	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008703	ACCG	2	8	169621	169628	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008703	GGGC	2	8	169666	169673	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008703	CGTG	2	8	170909	170916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008703	GCCA	2	8	174105	174112	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008703	AGCC	2	8	175147	175154	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008703	GTAG	2	8	176615	176622	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008703	GTAC	2	8	177980	177987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008703	CGAG	2	8	180800	180807	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008703	GTAG	2	8	184391	184398	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008703	TCCG	2	8	184716	184723	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008703	TGAG	2	8	184843	184850	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008703	ACTA	3	12	188716	188727	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008703	GTGC	2	8	189014	189021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008703	GACG	2	8	190894	190901	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008703	GCCG	2	8	192353	192360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008703	ATCA	2	8	195959	195966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008703	CCCT	2	8	196867	196874	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_008703	CGGA	2	8	197968	197975	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008703	TGCG	2	8	199235	199242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008703	AATG	2	8	200251	200258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008703	CCGG	2	8	200870	200877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008703	GCAG	2	8	206675	206682	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008703	GCGG	2	8	206788	206795	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008703	GTGA	2	8	207147	207154	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008703	GCCC	2	8	218576	218583	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_008703	TGAC	2	8	223693	223700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008703	TCAT	2	8	224063	224070	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008703	CGGG	2	8	224091	224098	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_008703	GCCG	2	8	224244	224251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008703	GATC	2	8	224332	224339	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008703	TACG	2	8	224535	224542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008703	ACGT	2	8	224609	224616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008703	ATGA	2	8	224811	224818	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008703	GGCC	2	8	225737	225744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008703	GCAG	2	8	225750	225757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008703	CCGG	2	8	227444	227451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008703	ACGC	2	8	227502	227509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008703	GACG	2	8	228971	228978	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008703	CCCA	2	8	229005	229012	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_008703	CGTC	2	8	232852	232859	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008703	GGCT	2	8	232916	232923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008703	GCAG	2	8	237763	237770	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008703	ACGG	2	8	237946	237953	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008703	GGCA	2	8	238045	238052	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008703	ATGA	2	8	238800	238807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008703	TGCT	2	8	242255	242262	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008703	CGTC	2	8	242916	242923	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008703	TGCC	2	8	243845	243852	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008703	ATGG	2	8	245458	245465	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008703	GCCG	2	8	249492	249499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008703	GGGC	2	8	252971	252978	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008703	GGCT	2	8	253028	253035	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008703	CGCT	2	8	263914	263921	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008703	GGTA	2	8	265830	265837	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008703	CCGG	2	8	266044	266051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_008703	GCCC	2	8	269699	269706	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
154	NC_008703	GACT	2	8	278242	278249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_008703	ATAG	2	8	289221	289228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.