MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 chromosome

Total Repeats: 1808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008596	TGCC	2	8	33	40	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008596	CGAT	2	8	345	352	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008596	GATT	2	8	6639	6646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008596	GGCG	2	8	12665	12672	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008596	CGCC	2	8	45785	45792	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_008596	TCGC	2	8	51363	51370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008596	TTCG	2	8	57902	57909	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008596	GGCC	2	8	58426	58433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008596	CGGT	2	8	61377	61384	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008596	TCGC	2	8	70087	70094	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008596	CGTA	2	8	74437	74444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008596	GTGC	2	8	87684	87691	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008596	TGGC	2	8	90789	90796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008596	TGGC	2	8	90914	90921	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008596	CCGG	2	8	92023	92030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008596	TTAA	2	8	92452	92459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008596	GCGA	2	8	92704	92711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008596	TCGA	2	8	95651	95658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008596	CGGG	2	8	95680	95687	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008596	GGCC	2	8	96028	96035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008596	GGCC	2	8	98182	98189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008596	CCGG	2	8	98903	98910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008596	AGGG	2	8	99781	99788	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008596	CGTA	2	8	101437	101444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008596	CAAT	2	8	101708	101715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008596	TCTT	2	8	101732	101739	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008596	TCAC	2	8	102854	102861	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008596	TCCC	2	8	102871	102878	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_008596	CTGT	2	8	111652	111659	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008596	ATCG	2	8	114424	114431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008596	GTTC	2	8	117198	117205	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008596	CCGC	2	8	128037	128044	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_008596	TGAT	2	8	141166	141173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008596	TTGA	2	8	141917	141924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008596	AGTG	2	8	141957	141964	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008596	GCCT	2	8	149487	149494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008596	CTTT	2	8	170342	170349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008596	GACT	2	8	179563	179570	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008596	AGTC	2	8	179669	179676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008596	CGGC	2	8	193176	193183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008596	TGAA	2	8	193409	193416	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008596	TGGA	2	8	193451	193458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008596	ATTG	2	8	199128	199135	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008596	ACAA	2	8	203604	203611	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008596	AGGT	2	8	203642	203649	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008596	GACC	2	8	205180	205187	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008596	CTTG	2	8	211953	211960	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008596	AATG	2	8	212047	212054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008596	AATA	2	8	216814	216821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008596	TGCG	2	8	224105	224112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008596	ATCG	2	8	224624	224631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008596	GCGT	2	8	242507	242514	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008596	GCAC	2	8	242547	242554	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008596	ACCG	2	8	242582	242589	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008596	TGGC	2	8	253449	253456	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008596	GCGT	2	8	257499	257506	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008596	GCAC	2	8	257542	257549	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008596	GCTC	2	8	259301	259308	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008596	CGCC	2	8	264561	264568	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_008596	CGAT	2	8	267470	267477	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008596	GCCC	2	8	267505	267512	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_008596	ACCA	2	8	267567	267574	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008596	GTTC	2	8	273208	273215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008596	CGAA	2	8	273243	273250	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008596	CCGC	2	8	284979	284986	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_008596	GACA	2	8	287692	287699	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008596	GGGT	2	8	299295	299302	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008596	TACG	2	8	310494	310501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008596	CTCA	2	8	317475	317482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008596	GCTA	2	8	317498	317505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008596	ACGC	2	8	317610	317617	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008596	GTGG	2	8	325294	325301	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008596	GTGG	2	8	342034	342041	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008596	ACCG	2	8	342665	342672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008596	CGGC	2	8	342686	342693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008596	CGGT	2	8	342698	342705	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008596	TTTG	2	8	348028	348035	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008596	GCGT	2	8	352168	352175	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008596	CGTC	2	8	358711	358718	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008596	GGTC	2	8	358808	358815	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008596	TCAG	2	8	368098	368105	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008596	ACCG	2	8	376194	376201	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008596	TCGC	2	8	381103	381110	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008596	GGGA	2	8	381113	381120	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008596	TATT	2	8	381813	381820	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008596	CCCG	2	8	393485	393492	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_008596	GTCG	2	8	393580	393587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008596	CAGC	2	8	401139	401146	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008596	TCGC	2	8	416287	416294	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008596	GTTT	2	8	417691	417698	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008596	TCGA	2	8	417826	417833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008596	TCGT	2	8	417871	417878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008596	TCGG	2	8	421839	421846	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008596	GACG	2	8	422965	422972	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008596	CGAT	2	8	425040	425047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008596	TTGC	2	8	425153	425160	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008596	TCGA	2	8	444365	444372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008596	TCCT	2	8	444382	444389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008596	TTCG	2	8	470465	470472	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008596	GTGG	2	8	489140	489147	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008596	AATT	2	8	504808	504815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008596	TGAT	2	8	505000	505007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008596	CGTT	2	8	506462	506469	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008596	GAAG	2	8	506608	506615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008596	GGCG	2	8	506728	506735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008596	AGGC	2	8	508668	508675	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008596	TCGG	2	8	529978	529985	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008596	TACG	2	8	534287	534294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008596	TCGG	2	8	542930	542937	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008596	CGAC	2	8	543003	543010	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008596	TTGC	2	8	549875	549882	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008596	CGTG	2	8	549967	549974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008596	GAAG	2	8	553169	553176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008596	CGAA	2	8	568587	568594	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008596	TGTC	2	8	572841	572848	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008596	CCGC	2	8	573389	573396	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_008596	TCAG	2	8	574033	574040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008596	GTGC	2	8	574752	574759	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008596	CGCC	2	8	574831	574838	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_008596	GGCG	2	8	577535	577542	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008596	CGGG	2	8	577575	577582	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008596	ACGC	2	8	579249	579256	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008596	CCCG	2	8	585815	585822	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_008596	GAGC	2	8	589613	589620	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008596	CGAA	2	8	598589	598596	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_008596	AGGC	2	8	599779	599786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008596	CAGT	2	8	601436	601443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008596	CGGC	2	8	601849	601856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008596	TGAG	2	8	602102	602109	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008596	TTCC	2	8	611763	611770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008596	AAGG	2	8	611868	611875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008596	CCGG	2	8	611879	611886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008596	ACTC	2	8	613848	613855	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008596	TGCA	2	8	616461	616468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008596	ATGC	2	8	616472	616479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008596	TCCC	2	8	620767	620774	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_008596	CGGC	2	8	622857	622864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008596	CCGG	2	8	622934	622941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008596	CAGT	2	8	623523	623530	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008596	ACGC	2	8	623554	623561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008596	TAAT	2	8	626683	626690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008596	CGGC	2	8	634089	634096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008596	GCGG	2	8	647792	647799	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008596	GGCT	2	8	647963	647970	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008596	AGAC	2	8	649316	649323	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_008596	CACC	2	8	663221	663228	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
147	NC_008596	GTCT	2	8	676081	676088	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008596	TTCC	2	8	679339	679346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008596	CGGT	2	8	681620	681627	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008596	AACC	2	8	684455	684462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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293	NC_008596	GACA	2	8	1272112	1272119	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_008596	GCCG	2	8	1885494	1885501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
486	NC_008596	ATCG	2	8	1890299	1890306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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492	NC_008596	GGGC	2	8	1892428	1892435	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
493	NC_008596	TCCG	2	8	1895962	1895969	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
494	NC_008596	GCTC	2	8	1898819	1898826	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
495	NC_008596	GCCC	2	8	1901303	1901310	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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499	NC_008596	ACAA	2	8	1914717	1914724	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
500	NC_008596	ACGA	2	8	1917248	1917255	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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