MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Magnetococcus marinus MC-1 chromosome

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008576	GTTGTG	2	12	76	87	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008576	GGCAAG	2	12	34640	34651	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008576	GTTAGG	2	12	63587	63598	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008576	ACAGGC	2	12	92747	92758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008576	TATAAA	2	12	162979	162990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008576	AGGGGG	2	12	200560	200571	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008576	GGGTGA	2	12	200626	200637	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008576	GACAGA	2	12	221694	221705	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008576	AGGGTT	2	12	235476	235487	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008576	ACCGTT	2	12	241403	241414	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008576	TGGGTT	2	12	245428	245439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008576	TAGAGC	2	12	253195	253206	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_008576	GTTATG	2	12	269811	269822	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008576	GGGGAG	2	12	340005	340016	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008576	GTAGCT	2	12	482000	482011	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008576	TAGGGT	2	12	512586	512597	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008576	TAAGGG	2	12	527975	527986	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008576	AACAGG	2	12	581530	581541	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008576	AAAAGC	2	12	590782	590793	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_008576	CTGCCC	2	12	638334	638345	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_008576	CAGGCT	2	12	655112	655123	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008576	GCCGCT	2	12	697513	697524	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008576	CATTTT	2	12	797255	797266	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008576	GCTTGA	2	12	797451	797462	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008576	TGGGTG	2	12	805542	805553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008576	GAAAAC	2	12	837469	837480	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008576	TCTCTT	2	12	858890	858901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008576	GTTCGT	2	12	862298	862309	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008576	TTTTTA	2	12	875054	875065	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008576	GCTTAC	2	12	898055	898066	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008576	GCCTGT	2	12	904826	904837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008576	TCTTTA	2	12	942948	942959	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008576	ACCTTC	2	12	974001	974012	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008576	ACCTGC	2	12	990299	990310	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008576	GGAACC	2	12	1003752	1003763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008576	TTGTGT	2	12	1009834	1009845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008576	TGGTGA	2	12	1027636	1027647	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008576	TTTTGG	2	12	1040909	1040920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008576	AAAAGC	2	12	1120228	1120239	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008576	TTTTTG	2	12	1124267	1124278	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008576	TCTGGG	2	12	1124898	1124909	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_008576	ATTATA	2	12	1198950	1198961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008576	TAGGTA	2	12	1200841	1200852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008576	GGGGTG	2	12	1277578	1277589	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008576	TATGGT	2	12	1318403	1318414	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008576	AGGGGT	2	12	1322709	1322720	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008576	CAGCCG	2	12	1386952	1386963	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008576	TGGATA	2	12	1387187	1387198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008576	ATCTCC	2	12	1388226	1388237	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008576	TTGGCT	2	12	1401520	1401531	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008576	ATTATG	2	12	1421301	1421312	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008576	CTGCCA	2	12	1661890	1661901	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008576	TCATGT	2	12	1665918	1665929	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008576	AACATG	2	12	1671460	1671471	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_008576	GTACTT	2	12	1678782	1678793	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_008576	AGCTAA	2	12	1756678	1756689	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008576	GCCCAC	2	12	1788065	1788076	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008576	ACGGTT	2	12	1838635	1838646	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_008576	AACCGT	2	12	1888415	1888426	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008576	CCTTTG	2	12	1900411	1900422	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008576	ATATTG	2	12	1925597	1925608	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008576	CCCGCT	2	12	1929314	1929325	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_008576	ATATAA	2	12	1965964	1965975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008576	TATCTC	2	12	2020419	2020430	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008576	CTGGGC	2	12	2041727	2041738	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008576	GGAAAA	2	12	2046105	2046116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008576	CTCTGT	2	12	2085204	2085215	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008576	CCGTGG	2	12	2095380	2095391	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008576	ATTTTT	2	12	2285277	2285288	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008576	CTGAAC	2	12	2320210	2320221	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008576	GCCAAG	2	12	2344570	2344581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008576	TCAAGG	2	12	2420215	2420226	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008576	GGAGAT	2	12	2442483	2442494	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008576	CGGGAA	2	12	2544110	2544121	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_008576	CGGGAA	2	12	2544185	2544196	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008576	TTGGCC	2	12	2594365	2594376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008576	TGGATG	2	12	2599314	2599325	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008576	TTTTTA	2	12	2602845	2602856	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008576	TGTTTT	2	12	2655393	2655404	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008576	ACACAA	2	12	2737783	2737794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008576	CCCCAT	2	12	2843353	2843364	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_008576	CCCCTC	2	12	2849305	2849316	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
83	NC_008576	ACCCCA	2	12	2859156	2859167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_008576	CTCTGC	2	12	2890094	2890105	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008576	CGTTGC	2	12	2901902	2901913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008576	TTTTCA	2	12	2933654	2933665	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_008576	CCCCAC	2	12	2949759	2949770	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
88	NC_008576	TAACCG	2	12	3112186	3112197	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008576	GCACCA	2	12	3112743	3112754	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008576	ATTTTG	2	12	3259128	3259139	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008576	CCTCAT	2	12	3295081	3295092	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008576	GCCACA	2	12	3298112	3298123	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008576	TCGCTT	2	12	3372083	3372094	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008576	AAAGAG	2	12	3377207	3377218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008576	ATTTTT	2	12	3378015	3378026	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008576	TGTAAT	2	12	3394918	3394929	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008576	CAAAGC	2	12	3418747	3418758	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008576	CTGGGC	2	12	3419683	3419694	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008576	GACAGA	2	12	3494237	3494248	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_008576	TCAACA	2	12	3541397	3541408	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008576	GCTCCT	2	12	3561878	3561889	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008576	TTATCG	2	12	3562093	3562104	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_008576	AACATG	2	12	3571374	3571385	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_008576	GACAGA	2	12	3618789	3618800	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_008576	TCGCTT	2	12	3621521	3621532	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008576	GAAAGA	2	12	3691665	3691676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008576	GGAGTT	2	12	3816192	3816203	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008576	TGGAGT	2	12	3816439	3816450	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008576	TGAGCG	2	12	3850237	3850248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_008576	CCACCC	2	12	3855879	3855890	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
111	NC_008576	CAGCGC	2	12	3871904	3871915	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008576	TCGCAG	2	12	3879949	3879960	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008576	TTCGAC	2	12	3928996	3929007	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008576	TCAATA	2	12	3933663	3933674	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_008576	CACCCA	2	12	3964519	3964530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_008576	TTCTGT	2	12	3992613	3992624	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_008576	CTCTTC	2	12	4023206	4023217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008576	GGTTTA	2	12	4023294	4023305	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008576	TGGGGT	2	12	4023878	4023889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008576	ACCCAA	2	12	4092312	4092323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008576	TTGAGT	2	12	4096459	4096470	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008576	TCTTTT	2	12	4097023	4097034	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_008576	GTTTTT	2	12	4128744	4128755	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008576	TGGGGG	2	12	4355355	4355366	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008576	CTGGTG	2	12	4376277	4376288	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_008576	AGACTG	2	12	4436851	4436862	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_008576	ACCAAC	2	12	4454335	4454346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008576	CAGATG	2	12	4496777	4496788	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_008576	GCTCAT	2	12	4507327	4507338	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008576	CCAAAA	2	12	4574155	4574166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008576	GGTTTT	2	12	4580492	4580503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008576	ATGGGC	2	12	4589941	4589952	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_008576	CCTTCT	2	12	4659591	4659602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008576	GCTGGT	2	12	4699601	4699612	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.