MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. MCS plasmid1

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008147	CGGG	2	8	15	22	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008147	GCCC	2	8	26	33	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_008147	GCAG	2	8	6063	6070	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008147	GGTG	2	8	10020	10027	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008147	AGTC	2	8	14477	14484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008147	TGGC	2	8	16028	16035	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008147	GTCA	2	8	20316	20323	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008147	CGAT	2	8	26093	26100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008147	GTGC	2	8	29102	29109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008147	GCCG	2	8	49478	49485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008147	AGGC	2	8	49508	49515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008147	CACG	2	8	49630	49637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008147	GCCC	2	8	50279	50286	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008147	CCGG	2	8	57035	57042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008147	CGAC	2	8	58801	58808	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008147	GTCG	2	8	58832	58839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008147	GACC	2	8	63184	63191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008147	CGGT	2	8	63292	63299	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008147	GTGC	2	8	74307	74314	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008147	ATGC	2	8	75536	75543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008147	GCCT	2	8	75948	75955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008147	GTCG	2	8	77374	77381	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008147	ACCC	2	8	81418	81425	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_008147	TCGA	2	8	89508	89515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008147	GGCC	2	8	89654	89661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008147	TGCG	2	8	90037	90044	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008147	CCTC	2	8	94001	94008	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_008147	AGCG	2	8	104450	104457	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008147	GCCG	2	8	104660	104667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008147	CGGC	2	8	107415	107422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008147	CCGC	2	8	123969	123976	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_008147	TTCC	2	8	126837	126844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008147	TGGC	2	8	134777	134784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008147	GCCG	2	8	143292	143299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008147	CGTA	2	8	144809	144816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008147	CATA	2	8	144832	144839	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008147	CGGT	2	8	145127	145134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008147	AGGA	2	8	145224	145231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008147	TGCG	2	8	148329	148336	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008147	CGGA	2	8	148487	148494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008147	GACT	2	8	154648	154655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008147	TACC	2	8	155186	155193	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008147	GCTG	2	8	171016	171023	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008147	CGCT	2	8	172801	172808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008147	TCCG	2	8	172860	172867	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008147	CTTT	2	8	173035	173042	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008147	CCCG	2	8	177777	177784	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_008147	TTCG	2	8	177795	177802	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008147	AACG	2	8	177827	177834	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008147	TGTC	2	8	182082	182089	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008147	CTGT	2	8	182576	182583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008147	CGGC	2	8	182593	182600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008147	GCCA	3	12	182613	182624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008147	CCAC	2	8	182761	182768	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_008147	GCTC	2	8	182844	182851	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008147	AGTG	2	8	182961	182968	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008147	CGGC	2	8	191655	191662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008147	CCTG	2	8	196674	196681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008147	GGTG	2	8	197643	197650	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008147	AGGG	2	8	202929	202936	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008147	GGGC	2	8	202999	203006	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008147	CGGG	2	8	203311	203318	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008147	GTGG	2	8	204495	204502	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008147	CGGT	2	8	204619	204626	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008147	GTTG	2	8	205535	205542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008147	CGAG	2	8	205707	205714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008147	TCGG	2	8	206094	206101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008147	GCCG	2	8	206162	206169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008147	CCGG	2	8	206408	206415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008147	CTGA	2	8	207147	207154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008147	CCGC	2	8	207504	207511	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_008147	ACCG	2	8	207806	207813	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008147	TGCC	2	8	208780	208787	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008147	GCCG	2	8	208968	208975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008147	ACCG	2	8	209095	209102	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008147	CGGG	2	8	209414	209421	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008147	GCCG	2	8	209440	209447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008147	GCCG	2	8	210403	210410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008147	CTCG	2	8	211086	211093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008147	CACC	2	8	211460	211467	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_008147	GGCC	2	8	212055	212062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008147	CGGG	2	8	214980	214987	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.