MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. MCS chromosome

Total Repeats: 8477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008146	ATG	2	6	780369	780374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_008146	TCG	2	6	780379	780384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_008146	CCGGG	2	10	786370	786379	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1004	NC_008146	ACC	2	6	786399	786404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_008146	GCGG	2	8	786409	786416	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_008146	ACG	2	6	786432	786437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_008146	GGC	2	6	786473	786478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_008146	CCG	2	6	786482	786487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_008146	GTG	2	6	786505	786510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008146	GAC	2	6	786527	786532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_008146	ACC	2	6	789042	789047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_008146	CCCG	2	8	793233	793240	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1013	NC_008146	CG	3	6	798572	798577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_008146	GGAG	2	8	798580	798587	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008146	GCG	2	6	800283	800288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_008146	TTCC	2	8	800958	800965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_008146	TTC	2	6	800966	800971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_008146	TGG	2	6	801016	801021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008146	CGG	2	6	801069	801074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_008146	TGA	2	6	801087	801092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008146	GGC	2	6	814683	814688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_008146	CGG	2	6	816680	816685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_008146	ACC	3	9	820161	820169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_008146	CCT	2	6	820801	820806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_008146	GCC	2	6	820842	820847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_008146	G	6	6	821508	821513	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008146	TGT	2	6	823791	823796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008146	TGC	2	6	824262	824267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_008146	GAT	2	6	824328	824333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_008146	TCG	2	6	824348	824353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_008146	CAC	2	6	824379	824384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_008146	CGA	2	6	824399	824404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_008146	TCA	2	6	824429	824434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_008146	TCGCGC	2	12	824453	824464	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_008146	GAC	3	9	824485	824493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_008146	GAG	2	6	826815	826820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_008146	GCG	2	6	827711	827716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_008146	CGAAA	2	10	827788	827797	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1039	NC_008146	CG	3	6	827804	827809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_008146	GAT	2	6	827812	827817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008146	CGATT	2	10	829478	829487	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1042	NC_008146	GCA	2	6	829491	829496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_008146	CG	3	6	829504	829509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_008146	G	6	6	829538	829543	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008146	ACC	2	6	832503	832508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_008146	CG	4	8	832689	832696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_008146	CGGT	2	8	832734	832741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_008146	TC	3	6	832863	832868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_008146	GC	3	6	832890	832895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_008146	GCC	2	6	832917	832922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_008146	GCG	2	6	832982	832987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_008146	AGC	2	6	833052	833057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_008146	AAC	2	6	833155	833160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_008146	CAGTGC	2	12	833167	833178	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_008146	CTT	2	6	833181	833186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_008146	CCG	2	6	833213	833218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_008146	GCC	2	6	833327	833332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_008146	TG	3	6	833353	833358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008146	CGA	2	6	833812	833817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_008146	GGTC	2	8	833855	833862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_008146	GT	3	6	833921	833926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_008146	CGG	3	9	833999	834007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_008146	CAA	2	6	834035	834040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_008146	TC	3	6	834068	834073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_008146	GGC	2	6	834076	834081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_008146	GCG	2	6	834133	834138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_008146	CGC	2	6	834176	834181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_008146	CAAA	2	8	834199	834206	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_008146	CG	3	6	834243	834248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_008146	ACG	2	6	837321	837326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_008146	GGT	2	6	840167	840172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_008146	CTT	2	6	840864	840869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_008146	GAC	2	6	840873	840878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_008146	CG	3	6	840919	840924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_008146	AC	3	6	841055	841060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_008146	GAG	2	6	841076	841081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008146	CGG	2	6	842929	842934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_008146	CGT	2	6	842963	842968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_008146	GAG	2	6	842970	842975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_008146	GGA	2	6	842980	842985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_008146	TCC	2	6	848839	848844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_008146	GTCC	2	8	849829	849836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_008146	CTG	2	6	849873	849878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_008146	CGG	2	6	851232	851237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_008146	GGA	2	6	851251	851256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_008146	G	6	6	851322	851327	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_008146	GCG	2	6	851405	851410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_008146	CCAG	2	8	851468	851475	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_008146	GCT	2	6	851497	851502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_008146	ACC	2	6	851560	851565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_008146	GTA	2	6	852789	852794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008146	GAAA	2	8	852832	852839	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008146	CGG	2	6	853030	853035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_008146	CGA	2	6	853039	853044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_008146	ACG	2	6	853080	853085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_008146	CAA	2	6	853648	853653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_008146	CGA	2	6	853661	853666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_008146	CTTGAC	2	12	853731	853742	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_008146	GTG	2	6	853826	853831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_008146	CCG	2	6	853863	853868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_008146	AAC	2	6	853881	853886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_008146	TCC	2	6	857305	857310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_008146	GCG	2	6	861300	861305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_008146	CGT	2	6	861309	861314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_008146	CTGA	2	8	865543	865550	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_008146	GCC	3	9	865912	865920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_008146	CGTG	2	8	865985	865992	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_008146	TCG	2	6	865996	866001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_008146	GCG	2	6	866046	866051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_008146	GCT	2	6	866086	866091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_008146	CGA	2	6	866166	866171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_008146	ACGTA	2	10	866233	866242	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1113	NC_008146	ACG	2	6	866307	866312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_008146	TG	3	6	866341	866346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008146	TTGTC	2	10	873665	873674	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1116	NC_008146	TAG	2	6	873714	873719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008146	CGT	2	6	873772	873777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_008146	CAA	2	6	873828	873833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_008146	AG	3	6	881854	881859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008146	GT	3	6	881868	881873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_008146	GTGC	2	8	881897	881904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_008146	GAG	2	6	881945	881950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008146	CGA	2	6	882016	882021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_008146	GAG	2	6	882068	882073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_008146	ACG	2	6	883136	883141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_008146	GTC	2	6	883169	883174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_008146	GGT	2	6	888507	888512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008146	GTCA	2	8	888654	888661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_008146	ATGG	2	8	888662	888669	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_008146	CG	3	6	888677	888682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_008146	GGT	2	6	888703	888708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008146	CGAAT	2	10	888720	888729	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1133	NC_008146	TCGC	2	8	900042	900049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_008146	CG	3	6	902119	902124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_008146	GGA	2	6	902827	902832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1402	NC_008146	GAG	2	6	1012723	1012728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1403	NC_008146	GTG	2	6	1012753	1012758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1404	NC_008146	CG	3	6	1012773	1012778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1405	NC_008146	CCACC	2	10	1012855	1012864	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1406	NC_008146	GCC	2	6	1012868	1012873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1407	NC_008146	A	6	6	1013674	1013679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_008146	CT	3	6	1015493	1015498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1411	NC_008146	C	7	7	1015703	1015709	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1412	NC_008146	TCGG	2	8	1015929	1015936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1415	NC_008146	GC	3	6	1017473	1017478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1416	NC_008146	GC	3	6	1017499	1017504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1417	NC_008146	TG	3	6	1017509	1017514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1422	NC_008146	AGA	2	6	1019024	1019029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1424	NC_008146	TCCC	2	8	1020654	1020661	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1425	NC_008146	GTC	2	6	1020706	1020711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1427	NC_008146	TGG	2	6	1020776	1020781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1430	NC_008146	TGC	2	6	1020829	1020834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1431	NC_008146	GACT	2	8	1020837	1020844	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1432	NC_008146	GGGCG	2	10	1020845	1020854	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1433	NC_008146	TGC	2	6	1020943	1020948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1434	NC_008146	CTG	2	6	1020957	1020962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1435	NC_008146	CGT	2	6	1021024	1021029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1436	NC_008146	GCC	3	9	1021057	1021065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1437	NC_008146	GCCC	2	8	1021087	1021094	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1438	NC_008146	TGA	2	6	1021688	1021693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1440	NC_008146	CCG	2	6	1021803	1021808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1442	NC_008146	CG	3	6	1021826	1021831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1443	NC_008146	GGCCGC	2	12	1021866	1021877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1449	NC_008146	GTCG	2	8	1022354	1022361	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1452	NC_008146	CCTC	3	12	1023411	1023422	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1453	NC_008146	CCT	2	6	1023567	1023572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1454	NC_008146	TCG	2	6	1023589	1023594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1470	NC_008146	CGAG	2	8	1026769	1026776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1471	NC_008146	CGC	2	6	1026789	1026794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1487	NC_008146	GT	3	6	1027866	1027871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1488	NC_008146	GTGG	2	8	1027890	1027897	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_008146	CTC	2	6	1033896	1033901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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