MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacillus flagellatus KT

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007947	TTTCAC	2	12	14	25	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007947	TTTAAA	2	12	1601	1612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007947	GATTAA	2	12	9754	9765	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007947	TGCTTT	2	12	18719	18730	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_007947	GGATGA	2	12	64578	64589	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007947	TTTTGT	2	12	69460	69471	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007947	TGCATT	2	12	75710	75721	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_007947	CGGCAA	2	12	121173	121184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007947	CATGAC	2	12	146515	146526	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007947	TTGCAG	2	12	161726	161737	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007947	TGGGTG	2	12	163527	163538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007947	AGCCTG	2	12	200953	200964	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007947	TGTTCA	2	12	217698	217709	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007947	ACTGGT	2	12	220494	220505	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007947	CCTGTT	2	12	247792	247803	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007947	CACTTG	2	12	292826	292837	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007947	CAAAAG	2	12	304782	304793	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007947	CAAAAA	2	12	317962	317973	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007947	TAAAAA	2	12	331920	331931	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007947	ACAATG	2	12	341441	341452	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007947	GCAATA	2	12	385842	385853	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007947	AATGAA	2	12	422259	422270	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007947	TTGATT	2	12	491618	491629	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007947	CAATGC	2	12	558597	558608	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007947	TGAGGC	2	12	615525	615536	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007947	GGGAAG	2	12	690598	690609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007947	CAAGAT	2	12	693433	693444	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007947	CTTGAT	2	12	824457	824468	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007947	CTGATT	2	12	835754	835765	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007947	ACGGTT	2	12	871455	871466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007947	GCGATT	2	12	884546	884557	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007947	ATATCA	2	12	956896	956907	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007947	ATTGAG	2	12	967287	967298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007947	ATGCAG	2	12	980865	980876	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007947	AGCCTG	2	12	987053	987064	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007947	ATGCCG	2	12	991137	991148	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007947	CAATGC	2	12	995203	995214	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007947	ACGGTT	2	12	1014487	1014498	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007947	GCGATT	2	12	1027578	1027589	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_007947	ATATCA	2	12	1099928	1099939	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007947	ATTGAG	2	12	1110319	1110330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007947	ATGCAG	2	12	1123897	1123908	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007947	AGCCTG	2	12	1130085	1130096	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007947	ATGCCG	2	12	1134169	1134180	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007947	CAATGC	2	12	1138235	1138246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007947	AAAAGG	2	12	1165796	1165807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007947	AATGAA	2	12	1180857	1180868	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007947	TATCGC	2	12	1186559	1186570	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007947	TTGAAT	2	12	1235707	1235718	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007947	TATGCG	2	12	1236101	1236112	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007947	GCTAAG	2	12	1240794	1240805	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_007947	ATGTAT	2	12	1359113	1359124	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007947	CTTTTT	2	12	1361771	1361782	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007947	TGAGCG	2	12	1367102	1367113	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007947	TTTAAA	2	12	1448953	1448964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007947	TTTAAC	2	12	1512666	1512677	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007947	GTGTAT	2	12	1565723	1565734	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007947	GTGTAT	2	12	1565741	1565752	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007947	AGGTTT	2	12	1614770	1614781	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007947	ATATCA	2	12	1649609	1649620	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007947	AGCTCT	2	12	1743527	1743538	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007947	CGACCA	2	12	1789445	1789456	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007947	TCGGCC	2	12	1796275	1796286	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007947	TATCAA	2	12	1810470	1810481	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007947	CAAAAA	2	12	1831432	1831443	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_007947	TCATAT	2	12	1840516	1840527	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007947	CAAGTT	2	12	1864978	1864989	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007947	TTGTAA	2	12	1868404	1868415	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007947	GGCCCG	2	12	1927020	1927031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007947	GATGAC	2	12	1997065	1997076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007947	CGATAC	2	12	2000310	2000321	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007947	AACTTA	2	12	2015771	2015782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007947	ACCATA	2	12	2038348	2038359	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007947	AATGAT	2	12	2041414	2041425	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007947	TCATCC	2	12	2234400	2234411	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007947	AGCTCA	2	12	2245807	2245818	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007947	ATAGCC	2	12	2273072	2273083	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007947	TTATCT	2	12	2345294	2345305	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_007947	ATCAGG	2	12	2346109	2346120	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_007947	TATTTA	2	12	2403619	2403630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007947	TCGACC	2	12	2525089	2525100	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007947	CGCCAG	2	12	2526126	2526137	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007947	TCAGGA	2	12	2527245	2527256	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007947	ACTGGC	2	12	2607911	2607922	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007947	ATCAGG	2	12	2622641	2622652	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007947	CCGGCC	2	12	2826946	2826957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007947	CTGATA	2	12	2879950	2879961	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_007947	GATGAA	2	12	2880723	2880734	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007947	AGAGGA	2	12	2884799	2884810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007947	TTATTG	2	12	2889327	2889338	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.