MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanospirillum hungatei JF-1 chromosome

Total Repeats: 11468

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007796	TAA	2	6	376	381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007796	TATC	2	8	382	389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007796	GCATTT	2	12	402	413	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007796	GAGAGT	2	12	459	470	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007796	A	7	7	482	488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007796	CA	5	10	944	953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007796	GAT	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007796	TCA	2	6	1075	1080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007796	AG	3	6	1114	1119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007796	AAAACA	2	12	1173	1184	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007796	TAAA	2	8	1917	1924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007796	TTA	2	6	2005	2010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007796	TCA	2	6	2027	2032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007796	GGA	2	6	9425	9430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007796	AGAAT	2	10	9478	9487	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007796	CT	3	6	9507	9512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007796	AAT	2	6	9514	9519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007796	GAT	2	6	9565	9570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007796	A	7	7	9654	9660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007796	TA	3	6	10922	10927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007796	T	6	6	10986	10991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007796	GGAA	2	8	10992	10999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007796	CAT	2	6	11103	11108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007796	AAT	2	6	11147	11152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007796	AT	3	6	11165	11170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007796	CACAAA	2	12	13314	13325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007796	A	7	7	13323	13329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007796	ATT	2	6	13341	13346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007796	TA	4	8	13357	13364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007796	TTA	2	6	13365	13370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007796	AT	3	6	13377	13382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007796	GATC	2	8	15013	15020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007796	AAT	2	6	17367	17372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007796	TTA	2	6	17392	17397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007796	GAGAT	2	10	20415	20424	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007796	TGG	2	6	20484	20489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007796	CAT	2	6	20571	20576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007796	ATC	2	6	20651	20656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007796	GAT	2	6	20706	20711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007796	GGTTC	2	10	20737	20746	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007796	T	7	7	20904	20910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007796	ATC	2	6	20961	20966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007796	TCA	2	6	20984	20989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007796	CAT	2	6	22579	22584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007796	GAT	2	6	22616	22621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007796	TAA	2	6	22758	22763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007796	AAAAGA	2	12	22832	22843	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007796	TGA	2	6	24984	24989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007796	TGCC	2	8	28109	28116	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007796	T	6	6	28123	28128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007796	TCA	2	6	28161	28166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007796	ATCG	2	8	28173	28180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007796	ATT	2	6	28201	28206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007796	ATCA	2	8	28251	28258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007796	CCG	2	6	28274	28279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_007796	CTG	2	6	28299	28304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007796	GAA	2	6	28344	28349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007796	ATC	2	6	28364	28369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007796	GCT	2	6	28375	28380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007796	AT	3	6	28384	28389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007796	AAG	2	6	28424	28429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007796	T	6	6	28453	28458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007796	A	6	6	28463	28468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007796	AAG	2	6	30400	30405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007796	TGT	2	6	30453	30458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007796	AT	3	6	30459	30464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007796	GTAA	2	8	30512	30519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007796	C	7	7	30522	30528	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_007796	GTGAT	2	10	30531	30540	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007796	ACG	2	6	30610	30615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007796	AT	4	8	34662	34669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007796	ACAG	2	8	34691	34698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007796	AAT	2	6	35181	35186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007796	AG	3	6	39393	39398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007796	TCC	2	6	39417	39422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007796	A	6	6	39451	39456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007796	TGA	2	6	39515	39520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007796	TTC	2	6	39535	39540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007796	TA	3	6	39555	39560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007796	CGG	2	6	39613	39618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007796	TA	3	6	39655	39660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007796	CGA	2	6	39702	39707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007796	TCTG	2	8	39761	39768	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007796	AGG	2	6	39930	39935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007796	CGAA	2	8	39993	40000	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_007796	GTT	2	6	40041	40046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007796	CAA	2	6	40059	40064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007796	GCA	2	6	40141	40146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007796	GGCT	2	8	40205	40212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_007796	CCA	2	6	40215	40220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_007796	GAA	2	6	40236	40241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007796	GCC	2	6	40265	40270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007796	CGG	2	6	40281	40286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007796	GTG	2	6	40292	40297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007796	CCG	2	6	40355	40360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007796	ACC	2	6	40460	40465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_007796	GT	3	6	40575	40580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007796	CGC	2	6	40626	40631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007796	CAC	2	6	40681	40686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_007796	GAG	2	6	40788	40793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007796	CGT	2	6	40803	40808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007796	CGAG	2	8	40846	40853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_007796	AGGA	2	8	40927	40934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007796	GGACA	2	10	40992	41001	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007796	GTA	2	6	41095	41100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007796	CA	3	6	41144	41149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007796	ACC	2	6	41161	41166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_007796	TGA	2	6	41179	41184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007796	G	6	6	41223	41228	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007796	CCT	2	6	41274	41279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_007796	GGAAT	2	10	41334	41343	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007796	GCG	2	6	41373	41378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007796	GAT	2	6	41492	41497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007796	GAA	2	6	41560	41565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007796	CGA	2	6	41617	41622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007796	CAT	2	6	41711	41716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007796	TAG	2	6	41756	41761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007796	GAA	2	6	41770	41775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007796	TAG	2	6	41793	41798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007796	AG	3	6	41907	41912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007796	ATGC	2	8	41933	41940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007796	TCA	2	6	41997	42002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007796	GTA	3	9	42038	42046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007796	TTG	2	6	42178	42183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007796	TCGTA	2	10	42190	42199	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_007796	GAA	2	6	42206	42211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007796	AG	3	6	42218	42223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007796	AAG	2	6	42256	42261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007796	CAA	2	6	42274	42279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007796	GAC	2	6	42301	42306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007796	TAC	2	6	42308	42313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007796	CAG	2	6	42327	42332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007796	GGA	2	6	42394	42399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007796	GAA	2	6	42557	42562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007796	TCA	2	6	42598	42603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007796	CGA	2	6	42605	42610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007796	AGT	2	6	42709	42714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007796	AGC	2	6	42749	42754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007796	ATG	2	6	42857	42862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007796	AG	3	6	42867	42872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007796	AGT	2	6	42939	42944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007796	AATCC	2	10	42965	42974	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_007796	CCTGTA	2	12	43079	43090	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007796	GAAGGC	2	12	43280	43291	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_007796	TGCC	2	8	43355	43362	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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454	NC_007796	AT	3	6	179582	179587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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