MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 chromosome

Total Repeats: 600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007681	TAAAA	2	10	73	82	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007681	TTTTA	2	10	439	448	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007681	TGGAA	2	10	13828	13837	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007681	ATTAT	2	10	14965	14974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007681	TATTT	2	10	21007	21016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007681	TTTAT	2	10	25274	25283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007681	AAAAT	2	10	31883	31892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007681	CTACA	2	10	33392	33401	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_007681	TTATT	2	10	38031	38040	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007681	ATCTA	2	10	45072	45081	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007681	TAATA	2	10	45126	45135	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007681	TAATA	2	10	45151	45160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007681	TAATT	2	10	50206	50215	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007681	ATTTT	2	10	53988	53997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007681	ATTTA	2	10	59868	59877	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007681	ATATT	2	10	66136	66145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007681	ATTTT	2	10	66245	66254	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007681	GTATT	2	10	73744	73753	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007681	ATTCT	2	10	75801	75810	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007681	ATTTT	2	10	90738	90747	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007681	ATTTT	2	10	92645	92654	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007681	ATATT	2	10	99066	99075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007681	TTCTA	2	10	122864	122873	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007681	TTTTA	2	10	123068	123077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007681	ATTTA	2	10	127802	127811	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007681	TATTT	2	10	129779	129788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007681	AATTT	2	10	129822	129831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007681	TTATT	2	10	131573	131582	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007681	ATATT	2	10	132649	132658	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007681	TTATA	2	10	132803	132812	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007681	ATATA	4	20	132971	132990	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007681	ATTAA	2	10	133687	133696	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007681	TTTTA	2	10	134709	134718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007681	ATATG	2	10	137538	137547	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007681	TATTT	2	10	137588	137597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007681	ATTTT	3	15	137658	137672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007681	TAATA	2	10	137829	137838	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007681	TGTTA	2	10	146321	146330	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007681	TATAA	2	10	146352	146361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007681	TATTT	2	10	146432	146441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007681	TTTTA	2	10	146548	146557	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007681	TCAAA	2	10	153073	153082	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_007681	ATAAA	2	10	153181	153190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007681	ATATT	2	10	153279	153288	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007681	TTATT	2	10	157897	157906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007681	TTATT	2	10	166074	166083	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007681	TATTT	2	10	166249	166258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007681	TTTAT	2	10	166367	166376	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007681	TTTAT	2	10	166398	166407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007681	GAATG	2	10	166842	166851	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007681	ATTTT	2	10	169739	169748	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007681	ATTTA	2	10	169838	169847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007681	ATTTT	2	10	169895	169904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007681	TTAAA	2	10	179817	179826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007681	TTCTT	2	10	180091	180100	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007681	TTTTA	2	10	181957	181966	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007681	TTAAA	2	10	183750	183759	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007681	TTAAA	2	10	187314	187323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007681	AAAAT	2	10	196774	196783	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007681	ATTTA	2	10	198079	198088	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007681	TATTT	2	10	202702	202711	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007681	TAAAA	2	10	202772	202781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007681	GATAT	2	10	202784	202793	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007681	ATAAA	2	10	207335	207344	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007681	ATATA	2	10	215248	215257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007681	ATATA	2	10	218321	218330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007681	TAGTA	2	10	223002	223011	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007681	TTTAT	2	10	224945	224954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007681	ATATT	2	10	226870	226879	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007681	GTGTA	2	10	228704	228713	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007681	TAAAA	2	10	232737	232746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007681	TTTTC	2	10	235042	235051	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_007681	TAATT	2	10	235072	235081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007681	GAGAT	2	10	235279	235288	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007681	AAATA	2	10	243845	243854	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007681	TAATA	2	10	246198	246207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007681	TCTAT	2	10	253250	253259	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007681	ATCTA	2	10	263958	263967	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007681	TATAA	2	10	264628	264637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007681	AGTAA	2	10	264708	264717	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007681	ATCTT	2	10	264837	264846	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_007681	TAATA	2	10	285157	285166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007681	TCTAT	2	10	285175	285184	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_007681	ATATT	2	10	285248	285257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007681	ATATT	2	10	289528	289537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007681	ATATA	2	10	291911	291920	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007681	GTTAA	2	10	296159	296168	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007681	ATTTA	2	10	296309	296318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007681	AAATT	2	10	296361	296370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007681	TTTTA	2	10	296380	296389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007681	ATATT	2	10	305353	305362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007681	ATTTT	2	10	308413	308422	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007681	AAAAT	2	10	310913	310922	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007681	AGTAT	2	10	324767	324776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007681	TTTTC	2	10	324812	324821	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_007681	TATTT	2	10	327999	328008	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007681	TTATT	2	10	332574	332583	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007681	TTTTA	2	10	332808	332817	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007681	TGTTA	2	10	332820	332829	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007681	ATTTA	2	10	337638	337647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007681	TAATA	2	10	341573	341582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007681	TAAAA	2	10	341627	341636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007681	TGATT	2	10	343934	343943	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007681	TGTTT	2	10	343970	343979	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007681	TTAAT	2	10	352369	352378	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007681	AAATA	2	10	352379	352388	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007681	TAAAT	2	10	354692	354701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007681	AAATA	2	10	354867	354876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007681	TATAA	2	10	372113	372122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007681	GTATT	2	10	375257	375266	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007681	AACTT	2	10	376422	376431	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007681	ATTTC	2	10	377018	377027	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_007681	GTTTA	2	10	381411	381420	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007681	TAAAT	2	10	387017	387026	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007681	AAATT	2	10	387049	387058	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007681	GATTT	2	10	392151	392160	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007681	TGATA	2	10	392273	392282	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007681	CATAT	2	10	392687	392696	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_007681	TCCAT	2	10	394193	394202	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_007681	AATAT	2	10	396268	396277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007681	ATTTA	2	10	400390	400399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007681	ATATA	2	10	407218	407227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007681	AATAT	2	10	407670	407679	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007681	TATAT	2	10	407936	407945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007681	TATAT	2	10	408097	408106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007681	AATAG	2	10	410474	410483	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007681	TGGCA	2	10	411269	411278	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007681	GAAAA	2	10	412416	412425	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007681	ATTTC	2	10	413716	413725	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_007681	TTTAT	2	10	413814	413823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007681	TTATT	2	10	413931	413940	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007681	TTTAT	3	15	414437	414451	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007681	CTTTA	2	10	420573	420582	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007681	ATTAT	2	10	424281	424290	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007681	TATAA	2	10	424327	424336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007681	ATTAG	2	10	426520	426529	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007681	TAAAA	2	10	428193	428202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007681	ATTTT	2	10	433180	433189	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007681	TTTTA	2	10	433427	433436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007681	TAATA	2	10	433553	433562	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007681	TAATT	2	10	438722	438731	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007681	CTTTT	2	10	440395	440404	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_007681	TAATA	2	10	447076	447085	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007681	TTAAA	2	10	453388	453397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007681	GAATA	2	10	453915	453924	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007681	TAATA	2	10	454637	454646	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007681	ATATG	2	10	455794	455803	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007681	ATTAG	2	10	457672	457681	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007681	TTATT	2	10	458688	458697	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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